FBXL5 - FBXL5

FBXL5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3U9J, 3U9M, 3V5X, 3V5Y, 3V5Z
Идентификаторы
Псевдонимы	FBXL5, FBL4, FBL5, FLR1, F-бокс и богатый лейцином повторяющийся белок 5, F-бокс и богатый лейцином повторяющийся белок 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 605655 MGI: 2152883 ГомолоГен: 8129 Генные карты: FBXL5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4п15.32 Начинать 15,604,381 бп[1] Конец 15,681,679 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 B3 Начинать 43,744,615 бп[2] Конец 43,821,638 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов железа • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • активность убиквитин-протеинтрансферазы Сотовый компонент • убиквитинлигазный комплекс • цитоплазма • SCF убиквитин-лигазный комплекс • перинуклеарная область цитоплазмы • цитозоль Биологический процесс • SCF-зависимый протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • убиквитинирование белков • гомеостаз ионов железа • полиубиквитинирование белков • гомеостаз ионов клеточного железа • посттрансляционная модификация • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • положительная регуляция катаболического процесса клеточного белка Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	26234	242960
Ансамбль	ENSG00000118564	ENSMUSG00000039753
UniProt	Q9UKA1	Q8C2S5
RefSeq (мРНК)	NM_001193534 NM_001193535 NM_012161	NM_001159963 NM_178729
RefSeq (белок)	NP_001180463 NP_001180464 NP_036293	NP_001153435 NP_848844
Расположение (UCSC)	Chr 4: 15,6 - 15,68 Мб	Chr 5: 43,74 - 43,82 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

F-бокс / LRR-повторяющийся белок 5 это белок что у людей кодируется FBXL5 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует член F-бокс протеин семейство, которое характеризуется мотивом приблизительно из 40 аминокислот, F-боксом. Белки F-бокса составляют одну из четырех субъединиц убиквитин-протеин-лигазного комплекса, называемых SCF (SKP1-cullin-F-box), которые функционируют в зависимом от фосфорилирования убиквитинировании. Белки F-бокса делятся на 3 класса: Fbw, содержащие домены WD-40, Fbls, содержащие повторы, богатые лейцином, и Fbx, содержащие либо различные модули взаимодействия белок-белок, либо не распознаваемые мотивы. Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к классу Fbls и, помимо F-бокса, содержит несколько тандемных повторов, богатых лейцином. Альтернативный сплайсинг этого гена дает 2 варианта транскрипта.^[6]

FBXL5 - датчик железа. Это продвигает IRP2 убиквитинирование, а затем его деградация.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000118564 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039753 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (декабрь 1999 г.). «Идентификация семейства человеческих белков F-бокса». Curr Biol. 9 (20): 1177–9. Дои:10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2. PMID  10531035. S2CID  7467493.
6. «Ген Entrez: FBXL5 F-бокс и богатый лейцином повторяющийся белок 5».

дальнейшее чтение

• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Уинстон Дж. Т., Кепп Д. М., Чжу С. и др. (1999). «Семейство белков F-бокса млекопитающих». Curr. Биол. 9 (20): 1180–2. Дои:10.1016 / S0960-9822 (00) 80021-4. PMID  10531037. S2CID  14341845.
• Ильин Г.П., Риалланд М, Голубь С., Гуген-Гийозо С. (2001). «Клонирование кДНК и анализ экспрессии новых членов семейства белков F-бокса млекопитающих». Геномика. 67 (1): 40–7. Дои:10.1006 / geno.2000.6211. PMID  10945468.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Zhang N, Liu J, Ding X и др. (2007). «FBXL5 взаимодействует с p150Glued и регулирует его убиквитинирование». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 359 (1): 34–9. Дои:10.1016 / j.bbrc.2007.05.068. PMID  17532294.