EXOC2 - EXOC2

EXOC2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1HK6
Идентификаторы
Псевдонимы	EXOC2, SEC5, SEC5L1, Sec5p, компонент 2 комплекса экзоцисты
Внешние идентификаторы	OMIM: 615329 MGI: 1913732 ГомолоГен: 10122 Генные карты: EXOC2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п25.3 Начните 485,154 бп[1] Конец 693,139 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 A3.2 Начните 30,813,919 бп[2] Конец 30,974,093 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание RAL GTPase • GO: 0001948 связывание с белками • связывание протеинкиназы • связывание с N-концом белка Сотовый компонент • цитозоль • клеточная мембрана • экзоциста • мембрана • Тело Флемминга Биологический процесс • транспорт белка • регулирование проникновения бактерии в клетку-хозяин • Гольджи к транспорту через плазматическую мембрану • сборка экзоцисты • экзоцитоз • транспорт • везикулярный транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	55770	66482
Ансамбль	ENSG00000112685	ENSMUSG00000021357
UniProt	Q96KP1	Q9D4H1
RefSeq (мРНК)	NM_018303	NM_025588 NM_001360093
RefSeq (белок)	NP_060773	NP_079864 NP_001347022
Расположение (UCSC)	Chr 6: 0,49 - 0,69 Мб	Chr 13: 30,81 - 30,97 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Компонент 2 комплекса экзоцисты это белок что у людей кодируется EXOC2 ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, является компонентом комплекс экзоцисты, множественный белковый комплекс, необходимый для воздействия на экзоциты. пузырьки к определенным участкам стыковки на плазматической мембране. Хотя лучше всего охарактеризован в дрожжи было продемонстрировано, что составляющие белки и функции комплекса экзоцисты высоко консервативны у высших эукариот. Было обнаружено, что по крайней мере восемь компонентов комплекса экзоцисты, включая этот белок, взаимодействуют с актиновым ремоделированием цитоскелета и механизмом транспорта везикул. Было показано, что это взаимодействие опосредует филоподии формирование в фибробласты.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112685 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021357 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Мурти М., Гарза Д., Шеллер Р. Х., Шварц Т. Л. (февраль 2003 г.). «Мутации в компоненте экзоцисты Sec5 нарушают движение нейронной мембраны, но высвобождение нейротрансмиттера сохраняется». Нейрон. 37 (3): 433–47. Дои:10.1016 / S0896-6273 (03) 00031-X. PMID  12575951. S2CID  14351315.
6. Шолиндер М., Ульманн Дж., Понстингл Х. (декабрь 2002 г.). «DelGEF, гомолог фактора обмена гуаниновых нуклеотидов RanGEF, связывается с компонентом экзоцисты Sec5 и модулирует секрецию». FEBS Lett. 532 (1–2): 211–5. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03677-3. PMID  12459492. S2CID  31552100.
7. «Ген Entrez: компонент 2 комплекса экзоцисты EXOC2».

дальнейшее чтение

• Сюй СК, ТерБуш Д., Абрахам М., Го В. (2004). «Комплекс экзоцисты в поляризованном экзоцитозе». Int. Преподобный Цитол. Международный обзор цитологии. 233: 243–65. Дои:10.1016 / S0074-7696 (04) 33006-8. ISBN  978-0-12-364637-8. PMID  15037366.
• Kee Y, Yoo JS, Hazuka CD и др. (1998). «Субъединичная структура комплекса экзоцист млекопитающих». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (26): 14438–43. Дои:10.1073 / пнас.94.26.14438. ЧВК  25013. PMID  9405631.
• Hsu SC, Hazuka CD, Roth R и др. (1998). «Субъединичный состав, белковые взаимодействия и структуры комплекса sec6 / 8 мозга млекопитающих и филаментов септина». Нейрон. 20 (6): 1111–22. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80493-6. PMID  9655500. S2CID  10915358.
• Matern HT, Yeaman C, Нельсон WJ, Scheller RH (2001). «Комплекс Sec6 / 8 в клетках млекопитающих: характеристика Sec3 млекопитающих, взаимодействия субъединиц и экспрессия субъединиц в поляризованных клетках». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (17): 9648–53. Дои:10.1073 / pnas.171317898. ЧВК  55506. PMID  11493706.
• Сугихара К., Асано С., Танака К. и др. (2002). «Комплекс экзоцисты связывает малую GTPase RalA, чтобы опосредовать образование филоподий». Nat. Cell Biol. 4 (1): 73–8. Дои:10.1038 / ncb720. PMID  11744922. S2CID  9528945.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Mott HR, Nietlispach D, Hopkins LJ, et al. (2003). «Структура GTPase-связывающего домена Sec5 и выяснение его сайта связывания Ral». J. Biol. Chem. 278 (19): 17053–9. Дои:10.1074 / jbc.M300155200. PMID  12624092.
• Иноуэ М., Чанг Л., Хван Дж. И др. (2003). «Комплекс экзоцисты необходим для доставки Glut4 к плазматической мембране инсулином» (PDF). Природа. 422 (6932): 629–33. Дои:10.1038 / природа01533. HDL:2027.42/62982. PMID  12687004. S2CID  4395760.
• Фукаи С., Матерн Х.Т., Джагат Дж. Р. и др. (2003). «Структурная основа взаимодействия между RalA и Sec5, субъединицей комплекса sec6 / 8». EMBO J. 22 (13): 3267–78. Дои:10.1093 / emboj / cdg329. ЧВК  165653. PMID  12839989.
• Москаленко С., Тонг С., Росс С. и др. (2004). «ГТФазы Ral регулируют сборку экзоцист посредством взаимодействий двойных субъединиц». J. Biol. Chem. 278 (51): 51743–8. Дои:10.1074 / jbc.M308702200. PMID  14525976.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Джин Р., Джунутула Дж. Р., Матерн Х. Т. и др. (2005). «Exo84 и Sec5 являются конкурентными регуляторными эффекторами Sec6 / 8 для RalA GTPase». EMBO J. 24 (12): 2064–74. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600699. ЧВК  1150893. PMID  15920473.
• Чиен И., Ким С., Бумейстер Р. и др. (2006). «Опосредованная RalB GTPase активация киназы TBK1 семейства IkappaB связывает передачу сигналов врожденного иммунитета с выживаемостью опухолевых клеток». Ячейка. 127 (1): 157–70. Дои:10.1016 / j.cell.2006.08.034. PMID  17018283. S2CID  9878037.
• Сулем П., Гудбьяртссон Д. Ф., Стейси С. Н. и др. (2007). «Генетические детерминанты пигментации волос, глаз и кожи у европейцев». Nat. Genet. 39 (12): 1443–52. Дои:10.1038 / нг.2007.13. PMID  17952075. S2CID  19313549.