ELAV-подобный белок 1 - ELAV-like protein 1

ELAVL1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3HI9, 4ED5, 4EGL, 4FXV
Идентификаторы
Псевдонимы	ELAVL1, ELAV1, HUR, Hua, MelG, ELAV-подобный РНК-связывающий белок 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 603466 MGI: 1100851 ГомолоГен: 20367 Генные карты: ELAVL1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19p13.2 Начните 7,958,573 бп[1] Конец 8,005,659 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 A1.1 | 8 2,0 см Начните 4,285,382 бп[2] Конец 4,325,413 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • активность гомодимеризации белков • Связывание мРНК 3'-UTR • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • связывание нуклеиновой кислоты • связывание двухцепочечной РНК • связывание протеинкиназы • связывание мРНК • Привязка элементов AU-rich • Связывание мРНК 3'-UTR AU-богатой области • связывание miRNA Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана • нуклеоплазма • ядро клетки • рибонуклеопротеин • Гранула стресса • постсинапс • глутаматергический синапс Биологический процесс • регуляция стабильности мРНК • регуляция поддержания популяции стволовых клеток • положительное регулирование перевода • развитие многоклеточного организма • стабилизация мРНК • 3'-UTR-опосредованная стабилизация мРНК • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • негативная регуляция молчания генов с помощью miRNA • гомоолигомеризация белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	1994	15568
Ансамбль	ENSG00000066044	ENSMUSG00000040028
UniProt	Q15717	P70372
RefSeq (мРНК)	NM_001419	NM_010485
RefSeq (белок)	NP_001410	NP_034615
Расположение (UCSC)	Chr 19: 7.96 - 8.01 Мб	Chr 8: 4.29 - 4.33 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ELAV-подобный белок 1 или HuR (человеческий антиген R) представляет собой белок что у людей кодируется ELAVL1 ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков ELAVL. Этот кодируемый белок содержит 3 РНК-связывающих домена и связывает цис-действующие Элементы с высоким содержанием Австралии. Одна из самых известных его функций - стабилизация мРНК чтобы регулировать экспрессию генов.^[7]

Смотрите также

• РНК-связывающий белок

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000066044 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040028 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ма В.Дж., Ченг С., Кэмпбелл С., Райт А., Фурно Х. (июнь 1996 г.). «Клонирование и характеристика HuR, повсеместно экспрессируемого Elav-подобного белка». J Biol Chem. 271 (14): 8144–8151. Дои:10.1074 / jbc.271.14.8144. PMID  8626503.
6. Ма WJ, Furneaux H (февраль 1997 г.). «Локализация человеческого гена HuR на хромосоме 19p13.2». Hum Genet. 99 (1): 32–33. Дои:10.1007 / s004390050305. PMID  9003489. S2CID  32509747.
7. «Ген Entrez: ELAVL1 ELAV (эмбриональная летальность, аномальное зрение, Drosophila) -подобный 1 (антиген Hu R)».

дальнейшее чтение

• Nabors LB, Suswam E, Huang Y, Yang X, Johnson MJ, King PH (2003). «Фактор некроза опухоли альфа индуцирует повышенную регуляцию ангиогенного фактора в злокачественных клетках глиомы: роль в стабилизации РНК и HuR». Рак Res. 63 (14): 4181–7. PMID  12874024.
• Абдельмохсен К., Лал А., Ким Х. Х., Горосп М (2007). "Посттранскрипционная оркестровка антиапоптотической программы HuR". Клеточный цикл. 6 (11): 1288–92. Дои:10.4161 / cc.6.11.4299. PMID  17534146.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Сакаи К., Китагава Ю., Хиросе Г. (1999). «Анализ мотивов распознавания РНК человеческих нейрональных ELAV-подобных белков в связывании с мРНК цитокина». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 256 (2): 263–268. Дои:10.1006 / bbrc.1999.0282. PMID  10079173.
• Ван В., Фурно Н., Ченг Н. и др. (2000). «HuR регулирует стабилизацию мРНК p21 УФ-светом». Мол. Cell. Биол. 20 (3): 760–769. Дои:10.1128 / MCB.20.3.760-769.2000. ЧВК  85192. PMID  10629032.
• Blaxall BC, Pellett AC, Wu SC и др. (2000). «Очистка и характеристика белков, связывающих мРНК бета-адренорецепторов». J. Biol. Chem. 275 (6): 4290–4297. Дои:10.1074 / jbc.275.6.4290. PMID  10660597.
• Park S, Myszka DG, Yu M, et al. (2000). «Мотивы распознавания РНК HuD играют разные роли в формировании стабильного комплекса с РНК, богатой AU». Мол. Cell. Биол. 20 (13): 4765–4772. Дои:10.1128 / MCB.20.13.4765-4772.2000. ЧВК  85909. PMID  10848602.
• Спонгберг К., Виклунд Л., Шварц С. (2000). «HuR, белок, участвующий в распаде мРНК онкогена и фактора роста, связывается с 3'-концами РНК вируса гепатита С обеих полярностей». Вирусология. 274 (2): 378–390. Дои:10.1006 / viro.2000.0461. PMID  10964780.
• Бреннан CM, Галлузи И.Е., Стейтц Дж. А. (2000). «Белковые лиганды для HuR модулируют его взаимодействие с мРНК-мишенями in vivo». J. Cell Biol. 151 (1): 1–14. Дои:10.1083 / jcb.151.1.1. ЧВК  2189805. PMID  11018049.
• Галлузи И.Е., Стейтц Дж. А. (2001). «Определение путей экспорта мРНК с использованием проницаемых для клеток пептидов». Наука. 294 (5548): 1895–1901. Bibcode:2001Sci ... 294.1895G. Дои:10.1126 / science.1064693. PMID  11729309. S2CID  43726887.
• Гольдберг-Коэн I, Furneauxb H, Леви AP (2002). «Элемент РНК длиной 40 п.н., который опосредует стабилизацию мРНК фактора роста эндотелия сосудов с помощью HuR». J. Biol. Chem. 277 (16): 13635–13640. Дои:10.1074 / jbc.M108703200. PMID  11834731.
• Ван В., Фан Дж., Ян Х и др. (2002). «AMP-активированная киназа регулирует цитоплазматический HuR». Мол. Cell. Биол. 22 (10): 3425–3436. Дои:10.1128 / MCB.22.10.3425-3436.2002. ЧВК  133799. PMID  11971974.
• Yeap BB, Voon DC, Vivian JP и др. (2002). «Новое связывание HuR и поли (C) -связывающего белка с консервативным UC-богатым мотивом в 3'-нетранслируемой области матричной РНК рецептора андрогена». J. Biol. Chem. 277 (30): 27183–27192. Дои:10.1074 / jbc.M202883200. PMID  12011088.
• Ли Х, Парк С., Килберн Б. и др. (2003). «Липополисахарид-индуцированное метилирование HuR, стабилизирующего мРНК белка, с помощью CARM1. Коактиватор-ассоциированная аргининметилтрансфераза». J. Biol. Chem. 277 (47): 44623–44630. Дои:10.1074 / jbc.M206187200. PMID  12237300.
• Chen CY, Xu N, Shyu AB (2002). «Высокоселективные действия HuR по противодействию дестабилизации мРНК, опосредованной AU-богатыми элементами». Мол. Cell. Биол. 22 (20): 7268–7278. Дои:10.1128 / MCB.22.20.7268-7278.2002. ЧВК  139819. PMID  12242302.
• Джайлз К.М., Дейли Дж. М., Беверидж Д. Д. и др. (2003). «3'-нетранслируемая область мРНК p21WAF1 представляет собой составную цис-действующую последовательность, связанную с РНК-связывающими белками из клеток рака молочной железы, включая HuR и поли (C)-связывающий белок». J. Biol. Chem. 278 (5): 2937–2946. Дои:10.1074 / jbc.M208439200. PMID  12431987.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–16903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ван В., Ян Х, Лопес де Силанес И. и др. (2003). «Повышенное соотношение АМФ: АТФ и активность АМФ-активированной протеинкиназы во время клеточного старения связаны со снижением функции HuR». J. Biol. Chem. 278 (29): 27016–27023. Дои:10.1074 / jbc.M300318200. PMID  12730239.

внешние ссылки

• PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для человеческого ELAV-подобного белка 1

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США  ([1] ), который находится в всеобщее достояние.