ECOP - ECOP

VOPP1
Идентификаторы
Псевдонимы	VOPP1, ECOP, GASP, везикулярный, сверхэкспрессируемый при раке, протеин выживания 1, WBP1L2, член семейства WBP1 / VOPP1, белок, связывающий домен WW VOPP1
Внешние идентификаторы	OMIM: 611915 MGI: 2141658 ГомолоГен: 12772 Генные карты: VOPP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7p11.2 Начните 55,436,056 бп[1] Конец 55,572,988 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 B3 Начните 57,727,807 бп[2] Конец 57,825,159 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • активность преобразователя сигнала Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • неотъемлемый компонент мембраны органелл • эндосома • мембрана цитоплазматических везикул • мембрана • цитоплазматический пузырек Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	81552	232023
Ансамбль	ENSG00000154978	ENSMUSG00000037788
UniProt	Q96AW1	Q8R1C3
RefSeq (мРНК)	NM_001284282 NM_001284283 NM_001284284 NM_030796 NM_001321242 NM_001321243 NM_001321244 NM_001321246 NM_001321247 NM_001321248 NM_001321249 NM_001321250 NM_001321251	NM_146168
RefSeq (белок)	NP_001271211 NP_001271212 NP_001271213 NP_001308171 NP_001308172 NP_001308173 NP_001308175 NP_001308176 NP_001308177 NP_001308178 NP_001308179 NP_001308180 NP_110423	NP_666280
Расположение (UCSC)	Chr 7: 55,44 - 55,57 Мб	Chr 6: 57,73 - 57,83 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Коамплифицированный и сверхэкспрессируемый EGFR белок, также известный как ECOP, это человек ген.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000154978 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037788 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: коамплифицированный и сверхэкспрессируемый белок ECOP EGFR».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Мацуда А, Сузуки У, Хонда Дж и др. (2003). «Крупномасштабная идентификация и характеристика человеческих генов, активирующих сигнальные пути NF-kappaB и MAPK». Онкоген. 22 (21): 3307–18. Дои:10.1038 / sj.onc.1206406. PMID  12761501.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С. и др. (2005). «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Nat. Биотехнология. 22 (6): 707–16. Дои:10.1038 / nbt971. PMID  15146197. S2CID  27764390.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Парк S, Джеймс CD (2005). «ECop (коамплифицированный и сверхэкспрессируемый EGFR), новый белок, регулирующий транскрипционную активность NF-kappaB и связанный с ним апоптотический ответ IkappaBalpha-зависимым образом». Онкоген. 24 (15): 2495–502. Дои:10.1038 / sj.onc.1208496. PMID  15735698.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Брем Х., Стоядинович О., Дигельманн Р.Ф. и др. (2007). «Молекулярные маркеры у пациентов с хроническими ранами для хирургической обработки раны». Мол. Med. 13 (1–2): 30–9. Дои:10.2119 / 2006-00054.Brem. ЧВК  1869625. PMID  17515955.