База данных Domine - Domine Database
 | |
|---|---|
| Содержание | |
| Описание | исчерпывающий набор известных и прогнозируемых взаимодействий домен-домен. |
| Контакт | |
| Исследовательский центр | Национальный институт наук об окружающей среде, Национальные институты здоровья |
| Лаборатория | Системная биология |
| Основное цитирование | Yellaboina et al. (2011)[1] |
| Дата выхода | 2010 |
| Доступ | |
| Интернет сайт | https://manticore.niehs.nih.gov/domine |
ДОМИН это база данных известных и предсказанных белковый домен взаимодействия (или взаимодействия домен-домен).[1] Он содержит взаимодействия, наблюдаемые в PDB кристаллические структуры, и те, которые предсказываются несколькими вычислительными подходами. DOMINE использует Pfam Профили HMM для белковый домен определения. База данных DOMINE содержит 26 219 взаимодействий из 5 410 домены ), который включает 6634 известных взаимодействия, выведенных из PDB данные структуры.
Рекомендации
- ^ а б Yellaboina; и другие. (Январь 2011 г.). «DOMINE: исчерпывающий набор известных и прогнозируемых взаимодействий между доменами». Нуклеиновые кислоты Res. Англия. 39 (Проблема с базой данных): D730-5. Дои:10.1093 / nar / gkq1229. ЧВК 3013741. PMID 21113022.