Сопоставление удаления - Deletion mapping

В генетика и особенно генная инженерия, отображение удаления это метод, используемый для определения мутация сайты в ген.

Принцип делеционного картирования предполагает скрещивание штамма, имеющего точечная мутация в гене с несколькими штаммами, каждый из которых несет удаление в другом регионе того же гена. Где бы рекомбинация происходит между двумя деформациями, чтобы произвести дикого типа (+) гена (независимо от частоты) точечная мутация не может находиться в области делеции. Если рекомбинация не может продуцировать гены дикого типа, то разумно сделать вывод, что точечная мутация и делеция обнаруживаются на одном и том же участке ДНК.

Этот пример должен продемонстрировать, как работает принцип:

Предположим, у вас есть ген X, который в форме (+) дикого типа может быть показан линейно следующим образом:

5'-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------3' ген X, +

Предположим, штамм организмов имеет точечную мутацию в гене (теперь называемом ген X, - для обозначения того, что это больше не дикий тип):

5 '------------------------------------------------ ----ИКС--------------------------------------------- ----------------- 3 ' ген X, -

Теперь предположим, что у вас есть два штамма организмов, каждый с делециями в гене X на разных участках, называемых дель-1 и дель-2, соответственно (пунктирная линия указывает место удаления):

5'-------------------(..............................................)------------------------------------------------3' дель-1

5'------------------------------------------------------------(............................................)---------3' дель-2

Поскольку точечная мутация находится в пределах делеции del-1, между точечным мутантом и мутантом del-1 не будет рекомбинантов дикого типа (+). Однако при скрещивании точечного мутанта и мутанта del-2 может получиться успешный рекомбинант дикого типа (+).

При генетической рекомбинации, если мутантный аллель в доноре находится в последовательности, соответствующей удаленному участку в реципиенте, то (+) рекомбинанты не будут получены (как в скрещивании с del-1). Чтобы исправить делецию путем рекомбинации, донор должен иметь последовательность ДНК дикого типа в области, соответствующей ДНК, удаленной в реципиенте (как в скрещивании с del-2). Другими словами, существует реальная возможность рекомбинации между точечным мутантом и del-2, в которой может быть получена длина ДНК, не содержащая ни точечной мутации, ни делеции, что указывает на то, что мутации в этих двух штаммах не могут быть тот же регион.

Обратите внимание, что не все кроссоверы между точечным мутантом и del-2 будут давать (+) рекомбинанты; в этом случае только те события кроссовера, которые происходят между точечным мутантом и 5'-концом делеции, будут наследовать последовательность дикого типа.