DYNLRB1 - DYNLRB1

DYNLRB1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1Z09, 2Б95, 2E8J, 2HZ5
Идентификаторы
Псевдонимы	DYNLRB1, BITH, BLP, DNCL2A, DNLC2A, ROBLD1, динеиновая легкая цепь, блокирующая тип 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 607167 MGI: 1914318 ГомолоГен: 69161 Генные карты: DYNLRB1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q11.22 Начните 34,516,409 бп[1] Конец 34,540,958 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 H1 Начните 155,236,533 бп[2] Конец 155,250,277 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • двигательная активность микротрубочек • клеточно-двигательная активность • связывание промежуточной цепи динеина Сотовый компонент • центросома • цилиарный кончик • цитоскелет • мембрана • цитоплазма • микротрубочки • ресничка • цитоплазматический динеиновый комплекс • динеиновый комплекс • внешняя рука динеина Биологический процесс • визуальное поведение • движение на основе микротрубочек • внутрицилиарный транспорт, участвующий в сборке ресничек • транспорт • ответ на световой раздражитель Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	83658	67068
Ансамбль	ENSG00000125971	ENSMUSG00000047459
UniProt	Q9NP97	P62627
RefSeq (мРНК)	NM_001281727 NM_001281728 NM_001281729 NM_014183 NM_177953 NM_001319157	NM_001291108 NM_025947
RefSeq (белок)	NP_001306086 NP_054902 NP_001369294 NP_001369295 NP_001369296	NP_001278037 NP_080223
Расположение (UCSC)	Chr 20: 34,52 - 34,54 Мб	Chr 2: 155.24 - 155.25 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Динеин легкой цепи Roadblock-типа 1 это белок что у людей кодируется DYNLRB1 ген.^[5][6][7]

Этот ген является одним из препятствий динеин семейство легких цепей и кодирует цитоплазматический белок, способный связывать белки промежуточной цепи. Upregulation этого гена был связан с гепатоцеллюлярные карциномы, предполагая, что этот ген может быть вовлечен в прогрессирование опухоли.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000125971 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000047459 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Цзян Дж, Ю Л, Хуанг Х, Чен Х, Ли Д., Чжан И, Тан Л., Чжао С. (декабрь 2001 г.). «Идентификация двух новых генов легкой цепи человеческого динеина, DNLC2A и DNLC2B, и изменения их экспрессии в тканях гепатоцеллюлярной карциномы у 68 китайских пациентов». Ген. 281 (1–2): 103–13. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00787-9. PMID  11750132.
6. Пфистер К.К., Фишер Е.М., Гиббонс И.Р., Хейс Т.С., Хольцбаур Е.Л., Макинтош Дж.Р., Портер М.Э., Шроер Т.А., Воган К.Т., Уитман Г.Б., Кинг С.М., Валле РБ (ноябрь 2005 г.). «Номенклатура цитоплазматического динеина». J Cell Biol. 171 (3): 411–3. Дои:10.1083 / jcb.200508078. ЧВК  2171247. PMID  16260502.
7. «Ген Entrez: динеин DYNLRB1, легкая цепь, блокировка типа 1».

дальнейшее чтение

• Чжан К.Х., Е М., Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гемопоэтических стволовых / клетках-предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Сусалка С.Ю., Никулина К., Салата М.В. и др. (2002). «Легкая цепь препятствия связывает новую область цитоплазматической промежуточной цепи динеина». J. Biol. Chem. 277 (36): 32939–46. Дои:10.1074 / jbc.M205510200. PMID  12077152.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Хуанг Ю.С., Карсон Дж. Х., Барбарез Э., Рихтер Дж. Д. (2003). «Облегчение транспорта дендритной мРНК CPEB». Genes Dev. 17 (5): 638–53. Дои:10.1101 / gad.1053003. ЧВК  196011. PMID  12629046.
• Геваерт К., Геталс М., Мартенс Л. и др. (2004). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Биотехнология. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Сайто Ю., Дои К., Ямагиши Н. и др. (2004). «Скрининг Hsp105alpha-связывающих белков с использованием дрожжевых и бактериальных двугибридных систем». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 314 (2): 396–402. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.12.108. PMID  14733918.
• Ленер Б, Сандерсон CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК  442147. PMID  15231747.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Кэмпбелл И.Г., Филлипс В.А., Чунг Д.Ю. (2006). «Генетический и эпигенетический анализ предполагаемого опухолевого супрессора km23 при первичном раке яичников, молочной железы и колоректального рака». Clin. Рак Res. 12 (12): 3713–5. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-06-0800. PMID  16778097.
• Перес-Гонсалес А., Родригес А., Уарте М. и др. (2007). «hCLE / CGI-99, белок человека, который взаимодействует с полимеразой вируса гриппа, является модулятором транскрипции мРНК». J. Mol. Биол. 362 (5): 887–900. Дои:10.1016 / j.jmb.2006.07.085. PMID  16950395.
• Лю Дж. Ф., Ван ZX, Ван XQ и др. (2006). «Кристаллическая структура человеческой легкой цепи динеина Dnlc2A: структурное понимание взаимодействия с IC74». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 349 (3): 1125–9. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.08.161. PMID  16970917.
• Канг Х.С., Ким И.Дж., Ким К. и др. (2007). «km23, компонент передачи сигнала трансформирующего фактора роста-бета, редко мутирует при раке прямой кишки и желудка у человека». Рак Генет. Цитогенет. 175 (2): 173–4. Дои:10.1016 / j.cancergencyto.2007.02.004. PMID  17556076.
• Ваншерс Б., ван де Форстенбош Р., Франсен Дж. И др. (2008). «Белки семейства Rab6 взаимодействуют с белком легкой цепи динеина DYNLRB1». Cell Motil. Цитоскелет. 65 (3): 183–96. Дои:10.1002 / см. 20254. PMID  18044744.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q9NP97 (Блокировка легкой цепи динеина типа 1) на PDBe-KB.