DHX29 - DHX29

DHX29
Идентификаторы
Псевдонимы	DHX29, DDX29, DEAH-бокс-геликаза 29, DExH-бокс-геликаза 29
Внешние идентификаторы	OMIM: 612720 MGI: 2145374 ГомолоГен: 10387 Генные карты: DHX29
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q11.2 Начинать 55,256,055 бп[1] Конец 55,307,694 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 D2.2 Начинать 112,927,454 бп[2] Конец 112,969,432 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • активность фактора инициации трансляции • Связывание АТФ • гидролазная активность • связывание нуклеотидов • связывание нуклеиновой кислоты • GO: 0008026 геликазная активность • связывание малых субъединиц рибосом • связывание кадгерина • Связывание РНК • РНК-геликазная активность • гидролазная активность, действующая на ангидриды кислот, в фосфорсодержащих ангидридах • GO: 0034459 3'-5 'РНК-геликазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • эукариотический преинициативный комплекс 43S • митохондрия Биологический процесс • Обработка РНК • трансляционная инициация • биосинтез белка • положительное регулирование инициации трансляции Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	54505	218629
Ансамбль	ENSG00000067248	ENSMUSG00000042426
UniProt	Q7Z478	Q6PGC1
RefSeq (мРНК)	NM_019030 NM_001345964 NM_001345965	NM_172594
RefSeq (белок)	NP_001332893 NP_001332894 NP_061903	NP_766182
Расположение (UCSC)	Chr 5: 55.26 - 55.31 Мб	Chr 13: 112.93 - 112.97 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

DExH-бокс геликаза 29 (DHX29) составляет 155 кДа белок что у человека кодируется DHX29 ген.^[5]

Функция

Этот ген кодирует член DEAH (Asp-Glu-Ala-His) подсемейство белков, входящих в состав МЕРТВЫХ (Asp-Glu-Ala-Asp) семейство боксов РНК геликасы. Кодируемый белок функционирует в инициирование перевода, и особенно необходим для сканирования рибосом в стабильных мРНК вторичные структуры во время инициации кодон выбор.^[6] Этот белок также может играть роль в обнаружении цитозольных нуклеиновых кислот вирусного происхождения.^[7] Нокдаун этого гена приводит к снижению трансляция белков и нарушение пролиферации раковых клеток.^[8]

Взаимодействия

DHX29 был показан взаимодействовать с малая рибосомная субъединица эукариот (40S) и eIF3.^{[9][10][11][12]}

Смотрите также

• Эукариотический перевод
• Белки DExD / H-бокса
• Ded1 / DDX3

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000067248 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042426 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: DExH-box геликаза 29".
6. Писарева В.П., Писарев А.В., Комар А.А., Эллен К.У., Пестова Т.В. (декабрь 2008 г.). «Для инициации трансляции мРНК млекопитающих со структурированными 5'UTR требуется белок DExH-бокса DHX29». Клетка. 135 (7): 1237–50. Дои:10.1016 / j.cell.2008.10.037. ЧВК  2948571. PMID  19109895.
7. Сугимото Н., Митома Х, Ким Т., Ханабучи С., Лю Ю. Дж. (Май 2014 г.). «Белки геликазы DHX29 и RIG-I косенсируют цитозольные нуклеиновые кислоты в системе дыхательных путей человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 111 (21): 7747–52. Дои:10.1073 / pnas.1400139111. ЧВК  4040624. PMID  24821782.
8. Парсян А., Шахбазян Д., Мартино Ю., Петроулакис Э, Ален Т., Ларссон О., Матоннет Г., Тетвейлер Г., Хеллен К.Ю., Пестова Т.В., Свиткин Ю.В., Зоненберг Н. (декабрь 2009 г.). «Белок геликазы DHX29 способствует инициации трансляции, пролиферации клеток и онкогенезу». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 106 (52): 22217–22. Дои:10.1073 / pnas.0909773106. ЧВК  2799747. PMID  20018725.
9. Хашем Y, де Жорж А., Дхоте V, Ланглуа Р., Ляо Х.Й., Грассуччи Р.А., Хеллен К.Ю., Пестова Т.В., Франк Дж. (Май 2013 г.). «Структура преинициативного комплекса 43S рибосом млекопитающих, связанного со сканирующим фактором DHX29». Клетка. 153 (5): 1108–19. Дои:10.1016 / j.cell.2013.04.036. ЧВК  3730827. PMID  23706745.
10. Хашем Y, де Жорж А., Дхоте V, Ланглуа Р., Ляо Х.Й., Грассуччи Р.А., Пестова Т.В., Хеллен К.Ю., Франк Дж. (Ноябрь 2013 г.). «Внутренние сайты входа в рибосомы, подобные вирусу гепатита С, вытесняют eIF3, чтобы получить доступ к субъединице 40S». Природа. 503 (7477): 539–43. Дои:10.1038 / природа12658. ЧВК  4106463. PMID  24185006.
11. Писарева В.П., Писарев А.В. (декабрь 2016 г.). «DHX29 и eIF3 взаимодействуют при сканировании рибосом на структурированных мРНК во время инициации трансляции». РНК. 22 (12): 1859–1870. Дои:10.1261 / rna.057851.116. ЧВК  5113206. PMID  27733651.
12. Des Georges A, Dhote V, Kuhn L, Hellen CU, Pestova TV, Frank J, Hashem Y (сентябрь 2015 г.). «Структура eIF3 млекопитающих в контексте преинициативного комплекса 43S». Природа. 525 (7570): 491–5. Дои:10.1038 / природа14891. ЧВК  4719162. PMID  26344199.

дальнейшее чтение

• Hendrickson SL, Lautenberger JA, Chinn LW, Malasky M, Sezgin E, Kingsley LA, Goedert JJ, Kirk GD, Gomperts ED, Buchbinder SP, Troyer JL, O'Brien SJ (сентябрь 2010 г.). «Генетические варианты в кодируемых ядром митохондриальных генах влияют на прогрессирование СПИДа». PLOS ONE. 5 (9): e12862. Дои:10.1371 / journal.pone.0012862. ЧВК  2943476. PMID  20877624.
• Дхоте В., Суини Т.Р., Ким Н., Хеллен К.Ю., Пестова Т.В. (ноябрь 2012 г.). «Роли отдельных доменов в функции DHX29, важного фактора, необходимого для трансляции структурированных мРНК млекопитающих». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 109 (46): E3150-9. Дои:10.1073 / pnas.1208014109. ЧВК  3503174. PMID  23047696.
• Писарева В.П., Писарев А.В. (май 2016). «DHX29 снижает неплотное сканирование вышестоящего кодона AUG независимо от его нуклеотидного контекста». Исследования нуклеиновых кислот. 44 (9): 4252–65. Дои:10.1093 / нар / gkw240. ЧВК  4872109. PMID  27067542.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.