DDX3Y - DDX3Y

DDX3Y
Идентификаторы
Псевдонимы	DDX3Y, DBY, DEAD-бокс-геликаза 3, Y-сцепленная, DEAD-бокс-геликаза 3 Y-сцепленная
Внешние идентификаторы	OMIM: 400010 MGI: 1349406 ГомолоГен: 55839 Генные карты: DDX3Y
Расположение гена (человек) Chr. Y-хромосома (человек)[1] Группа Yq11.221 Начните 12,904,108 бп[1] Конец 12,920,478 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Y-хромосома (мышь)[2] Группа Y | Y A1 Начните 1,260,771 бп[2] Конец 1,286,629 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание нуклеотидов • гидролазная активность • Связывание АТФ • GO: 0008026 геликазная активность • Связывание РНК • связывание нуклеиновой кислоты Сотовый компонент • цитоплазматическая гранула рибонуклеопротеина • мембрана • ядро клетки • цитоплазма • цитозоль • ядрышко Биологический процесс • трансляционная инициация • регуляция экспрессии генов • Раскрутка вторичной структуры РНК • сегрегация хромосом Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8653	26900
Ансамбль	ENSG00000067048	ENSMUSG00000069045
UniProt	O15523	Q62095
RefSeq (мРНК)	NM_001122665 NM_001302552 NM_004660 NM_001324195	NM_012008
RefSeq (белок)	NP_001116137 NP_001289481 NP_001311124 NP_004651	NP_036138
Расположение (UCSC)	Chr Y: 12.9 - 12.92 Мб	Chr Y: 1.26 - 1.29 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX3Y является фермент что у людей кодируется DDX3Y ген.^[5][6]

Белки DEAD-бокса, характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), являются предполагаемыми РНК-геликазами. Они участвуют в ряде клеточных процессов, включающих изменение вторичной структуры РНК, таких как инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг, а также сборка рибосом и сплайсосом. Основываясь на паттернах их распространения, считается, что некоторые члены этого семейства участвуют в эмбриогенезе, сперматогенезе, а также росте и делении клеток. Этот ген кодирует белок DEAD-бокса, и он имеет гомолог на Х-хромосоме (DDX3X ). Мутация гена вызывает мужское бесплодие, синдром только клеток Сертоли или тяжелый гипосперматогенез, что позволяет предположить, что этот ген играет ключевую роль в сперматогенном процессе. Альтернативный сплайсинг этого гена генерирует 2 транскрипта, которые отличаются только длиной 3 'UTR.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000067048 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000069045 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лан Б.Т., Пейдж, округ Колумбия (ноябрь 1997 г.). «Функциональная когерентность Y-хромосомы человека». Наука. 278 (5338): 675–80. Дои:10.1126 / наука.278.5338.675. PMID  9381176.
6. «Ген Entrez: DDX3Y DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) полипептид 3, Y-связанный».

дальнейшее чтение

• Фореста С., Ферлин А., Моро Е. (2000). «Анализ делеции и экспрессии генов AZFa в Y-хромосоме человека показал важную роль DBY в мужском бесплодии». Гм. Мол. Genet. 9 (8): 1161–9. Дои:10.1093 / hmg / 9.8.1161. PMID  10767340.
• Шен П., Ван Ф, Андерхилл П.А. и др. (2000). «Популяционные генетические последствия изменения последовательности в четырех генах Y-хромосомы». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (13): 7354–9. Дои:10.1073 / пнас.97.13.7354. ЧВК  16549. PMID  10861003.
• Сессия DR, Lee GS, Wolgemuth DJ (2001). «Характеристика D1Pas1, мышиного аутосомного гомолога области DBY человека AZFa, как ядерного белка в сперматогенных клетках». Fertil. Стерил. 76 (4): 804–11. Дои:10.1016 / S0015-0282 (01) 01996-3. PMID  11591417.
• Ким Ю.С., Ли С.Г., Пак С.Х., Сон К. (2002). «Генная структура DDX3 человека и хромосомное картирование его родственных последовательностей». Мол. Клетки. 12 (2): 209–14. PMID  11710523.
• Vogt MH, van den Muijsenberg JW, Goulmy E, et al. (2002). «Ген DBY кодирует ограниченный по HLA-DQ5 человеческий мужской минорный антиген гистосовместимости, участвующий в реакции« трансплантат против хозяина »». Кровь. 99 (8): 3027–32. Дои:10.1182 / кровь.V99.8.3027. PMID  11929796.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Скалецкий Х., Курода-Кавагути Т., Минкс П.Дж. и др. (2003). «Специфическая для мужчин область Y-хромосомы человека представляет собой мозаику классов дискретных последовательностей». Природа. 423 (6942): 825–37. Дои:10.1038 / природа01722. PMID  12815422.
• Зорн Э., Миклос Д. Б., Флойд Б. Н. и др. (2004). «Антиген незначительной гистосовместимости DBY вызывает скоординированный ответ В- и Т-клеток после трансплантации аллогенных стволовых клеток». J. Exp. Med. 199 (8): 1133–42. Дои:10.1084 / jem.20031560. ЧВК  1361263. PMID  15096539.
• Брилл Л.М., Саломон А.Р., Фикарро С.Б. и др. (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т-клеток человека с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованным металлом и тандемной масс-спектрометрии». Анальный. Chem. 76 (10): 2763–72. Дои:10.1021 / ac035352d. PMID  15144186.
• Диттон Х.Дж., Циммер Дж., Камп С. и др. (2005). «Ген AZFa DBY (DDX3Y) широко транскрибируется, но белок ограничен мужскими половыми клетками посредством контроля трансляции». Гм. Мол. Genet. 13 (19): 2333–41. Дои:10,1093 / hmg / ddh240. PMID  15294876.
• Секигучи Т, Иида Х, Фукумура Дж, Нисимото Т (2004). «DDX3Y человека, Y-кодируемая изоформа РНК-геликазы DDX3, спасает чувствительную к температуре мутантную клеточную линию ET24 с мутацией DDX3X». Exp. Cell Res. 300 (1): 213–22. Дои:10.1016 / j.yexcr.2004.07.005. PMID  15383328.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Фикарро С.Б., Саломон А.Р., Брилл Л.М. и др. (2005). "Автоматическая аффинная хроматография с иммобилизованным металлом / наножидкостная хроматография / масс-спектрометрическая платформа с ионизацией электрораспылением для профилирования сайтов фосфорилирования белков". Rapid Commun. Масс-спектрометрия. 19 (1): 57–71. Дои:10.1002 / RCM.1746. PMID  15570572.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455.
• Папа С.Н., Ли И.Р. (2005). «Дрожжевое двухгибридное определение белков простаты, взаимодействующих с глобулином, связывающим половые гормоны человека». J. Steroid Biochem. Мол. Биол. 94 (1–3): 203–8. Дои:10.1016 / j.jsbmb.2005.01.007. PMID  15862967.