Связь конформация-деятельность - Conformation–activity relationship

В взаимосвязь между телосложением и деятельностью отношения между биологическая активность и химическая структура или же конформационные изменения биомолекулы. Эта терминология подчеркивает важность динамических конформационных изменений для биологической функции, а не важность статической трехмерной структуры, используемой при анализе отношения структура – ​​деятельность.[1]

Конформационные изменения обычно происходят во время межмолекулярная ассоциация, Такие как белок-белковое взаимодействие или же связывание белок-лиганд. Партнер по связыванию изменяет конформацию биомолекулы (например, белка), чтобы включить или отключить ее биохимическую активность.

Методы анализа взаимосвязи конформационной активности варьируются от in silico[2] или используя экспериментальные методы, такие как Рентгеновская кристаллография и ЯМР где соответствие до и после активности можно сравнить статически или с использованием динамических методов, таких как многопараметрический поверхностный плазмонный резонанс, двухполяризационная интерферометрия или же круговой дихроизм где кинетика а также степень конформационного изменения может быть определена количественно.

Экспериментальные техники

Статический

Статические экспериментальные методы включают: Рентгеновская кристаллография и ЯМР.

Динамический

Динамические экспериментальные методы включают: многопараметрический поверхностный плазмонный резонанс, двухполяризационная интерферометрия, и круговой дихроизм.

Рекомендации

  1. ^ Тейлор, RE; Чен, Y; Битти, А; Майлз, округ Колумбия; Чжоу, Y (2003). «Связь конформация-активность в поликетидных натуральных продуктах: новый взгляд на рациональный дизайн аналогов эпотилона». Журнал Американского химического общества. 125 (1): 26–7. Дои:10.1021 / ja028196l. PMID  12515494.
  2. ^ Каротенуто, Альфонсо; Д'урси, Анна Мария; Мулиначчи, Барбара; Паолини, Илария; Лолли, Франческо; Папини, Анна Мария; Новеллино, Этторе; Роверо, Паоло (2006). «Связь конформации-активности сконструированных гликопептидов в качестве синтетических зондов для обнаружения аутоантител, биомаркеров рассеянного склероза». Журнал медицинской химии. 49 (17): 5072–9. Дои:10.1021 / jm060117j. PMID  16913697.