Полная база данных устойчивости к антибиотикам - Comprehensive Antibiotic Resistance Database

Полная база данных по устойчивости к антибиотикам
Логотип McArthur Lab.png
Содержание
ОписаниеКомплексная база данных устойчивости к антибиотикам предоставляет данные, модели и алгоритмы, относящиеся к молекулярной основе устойчивости к противомикробным препаратам.
Типы данных
захвачен		Гены и фенотипы устойчивости к противомикробным препаратам
ОрганизмыБактерии
Контакт
Исследовательский центрУниверситет Макмастера
Основное цитированиеPMID  27789705
Доступ
Интернет сайткарта.mcmaster.ca
Скачать URLСкачать
Разное
Закладки
сущности		да

В Полная база данных устойчивости к антибиотикам (CARD) это биологическая база данных который собирает и систематизирует справочную информацию о устойчивость к противомикробным препаратам гены, белки и фенотипы.[1] [2] База данных охватывает все типы классов лекарств и механизмы устойчивости и структурирует свои данные на основе онтологии. База данных CARD была одним из первых ресурсов, посвященных генам устойчивости к противомикробным препаратам.[3] Ресурс обновляется ежемесячно [4] и предоставляет инструменты, позволяющие пользователям находить потенциальные гены устойчивости к антибиотикам во вновь секвенированных геномах. Информация, которая добавляется в CARD, включает: гены устойчивости к антибиотикам, онтологию антибиотиков и механизм действия устойчивости к антибиотикам. В настоящее время по состоянию на июнь 2020 года CARD содержит 4463 термина онтологии, 2984 ссылочных последовательности, 1334 SNP, 2685 публикаций, 3030 моделей обнаружения AMR. Прогнозы резистома: 88 патогенов, 9560 хромосом, 21362 плазмиды, 102181 сборки WGS, 222011 аллелей.[4]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Алкок Б.П., Рафения А.Р., Лау TTY, Цанг К.К., Бушар М., Эдалатманд А; и другие. (2020). «CARD 2020: надзор за устойчивостью к антибиотикам с помощью обширной базы данных по устойчивости к антибиотикам». Нуклеиновые кислоты Res. 48 (D1): D517 – D525. Дои:10.1093 / нар / gkz935. ЧВК  7145624. PMID  31665441.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
  2. ^ Цзя, B; Raphenya, AR; Алкок, B; Waglechner, N; Guo, P; Цанг, К.К .; Lago, BA; Дэйв, BM; Перейра, S; Шарма, АН; Доши, S; Курто, М.; Lo, R; Уильямс, LE; Фрай, JG; Эльсайег, Т; Сардар, Д; Вестман, Э.Л .; Павловски, AC; Джонсон, TA; Бринкман, Ф.С. Райт, Г.Д .; McArthur, AG (4 января 2017 г.). «CARD 2017: расширение и модельно-ориентированное лечение всеобъемлющей базы данных по устойчивости к антибиотикам». Исследования нуклеиновых кислот. 45 (D1): D566 – D573. Дои:10.1093 / нар / gkw1004. ЧВК  5210516. PMID  27789705.
  3. ^ McArthur, AG; Waglechner, N; Низам, Ф; Ян, А; Азад, Массачусетс; Байлай, AJ; Бхуллар, К; Канова, MJ; Де Паскаль, G; Ejim, L; Калан, Л; Кинг, AM; Котева, К; Морар, М; Mulvey, MR; О'Брайен, Дж. С.; Павловски, AC; Пиддок, ЖЖ; Spanogiannopoulos, P; Сазерленд, AD; Тан, я; Тейлор, Польша; Thaker, M; Ванга, Вт; Ян, М; Ю, Т; Райт, Г. Д. (июль 2013 г.). «Полная база данных по устойчивости к антибиотикам». Противомикробные препараты и химиотерапия. 57 (7): 3348–57. Дои:10.1128 / AAC.00419-13. ЧВК  3697360. PMID  23650175.
  4. ^ а б «КАРТОЧНЫЙ сайт». Получено 5 июн 2020.