Калуменин - Calumenin

CALU
Идентификаторы
Псевдонимы	CALU, калуменин
Внешние идентификаторы	OMIM: 603420 MGI: 1097158 ГомолоГен: 936 Генные карты: CALU
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q32.1 Начните 128,739,292 бп[1] Конец 128,773,400 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 A3.3 Начните 29,348,069 бп[2] Конец 29,377,110 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • аппарат Гольджи • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • меланосома • саркоплазматический ретикулум • внеклеточная область • эндоплазматический ретикулум • просвет саркоплазматического ретикулума • просвет эндоплазматического ретикулума Биологический процесс • посттрансляционная модификация • метаболический процесс клеточного белка • биологический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	813	12321
Ансамбль	ENSG00000128595	ENSMUSG00000029767
UniProt	O43852	O35887
RefSeq (мРНК)	NM_001130674 NM_001199671 NM_001199672 NM_001199673 NM_001199674 NM_001219	NM_001285412 NM_007594 NM_184053
RefSeq (белок)	NP_001124146 NP_001186600 NP_001186601 NP_001186602 NP_001210	NP_001272341 NP_031620 NP_908942
Расположение (UCSC)	Chr 7: 128,74 - 128,77 Мб	Chr 6: 29.35 - 29.38 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Калуменин это белок что у людей кодируется CALU ген.^[5][6]

Калуменин (CALU) - это кальций-связывающий белок, локализованный в эндоплазматический ретикулум (ER) и участвует в таких ER-функциях, как сворачивание белка и сортировка. Калуменин является членом EF-рука суперсемейство в ER и аппарат Гольджи под названием CERC. CERC - это аббревиатура от членов семейства Cab-45, ретикулокалбин, Erc-55 (RCN2 ) и калуменин. Ген CALU кодирует выведенный белок из 315 аминокислот, содержащий 6 мотивов EF-hand, 1 потенциальный сайт N-гликозилирования и C-концевой сигнал удерживания ER. Белки CALU человека и мыши на 98% идентичны. МРНК CALU повсеместно экспрессируется в тканях человека и отображается на 7q32.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000128595 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000029767 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ябе Д., Таниваки М., Накамура Т., Канадзава Н., Таширо К., Хондзё Т. (август 1998 г.). «Ген калуменина человека (CALU): выделение кДНК и хромосомное картирование на 7q32». Геномика. 49 (2): 331–3. Дои:10.1006 / geno.1998.5245. PMID  9598325.
6. "Entrez Gene: CALU калюменин".

внешние ссылки

• Человек CALU расположение генома и CALU страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Ябе Д., Накамура Т., Канадзава Н. и др. (1997). «Калуменин, Са2 + -связывающий белок, удерживаемый в эндоплазматическом ретикулуме с новой карбоксиконцевой последовательностью, HDEF». J. Biol. Chem. 272 (29): 18232–9. Дои:10.1074 / jbc.272.29.18232. PMID  9218460.
• Ворум Х., Лю Х, Мадсен П. и др. (1998). «Молекулярное клонирование кДНК, кодирующей калуменин человека, экспрессия в Escherichia coli и анализ ее Са2 + -связывающей активности». Биохим. Биофиз. Acta. 1386 (1): 121–31. Дои:10.1016 / s0167-4838 (98) 00089-2. PMID  9675259.
• Хсеу MJ, Yen CH, Tzeng MC (1999). «Крокальбин: новый кальций-связывающий белок, который также является связывающим белком для кротоксина, нейротоксической фосфолипазы А2». FEBS Lett. 445 (2–3): 440–4. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00177-5. PMID  10094503. S2CID  40129100.
• Vorum H, Hager H, Christensen BM, et al. (1999). «Человеческий калуменин локализуется в секреторных путях и секретируется в среду». Exp. Cell Res. 248 (2): 473–81. Дои:10.1006 / excr.1999.4431. PMID  10222138.
• Ворум Х, Якобсен С, Оноре Б. (2000). «Калуменин взаимодействует с амилоидным Р компонентом сыворотки». FEBS Lett. 465 (2–3): 129–34. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01734-2. PMID  10631319. S2CID  1943508.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Басрур В., Ян Ф., Кусимото Т. и др. (2003). «Протеомный анализ ранних меланосом: идентификация новых меланосомных белков». J. Proteome Res. 2 (1): 69–79. Дои:10.1021 / pr025562r. PMID  12643545.
• Геваерт К., Геталс М., Мартенс Л. и др. (2004). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Биотехнология. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR и др. (2003). «Хромосома 7 человека: последовательность ДНК и биология». Наука. 300 (5620): 767–72. Дои:10.1126 / science.1083423. ЧВК  2882961. PMID  12690205.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Chi A, Valencia JC, Hu ZZ и др. (2007). «Протеомная и биоинформатическая характеристика биогенеза и функции меланосом». J. Proteome Res. 5 (11): 3135–44. Дои:10.1021 / pr060363j. PMID  17081065.