CYTH1 - CYTH1

CYTH1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1BC9, 4A4P
Идентификаторы
Псевдонимы	CYTH1, B2-1, ЦИТОГЕЗИН-1, D17S811E, PSCD1, SEC7, цитогезин 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 182115 MGI: 1334257 ГомолоГен: 31262 Генные карты: CYTH1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q25.3 Начните 78,674,048 бп[1] Конец 78,782,297 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 E2 Начните 118,132,019 бп[2] Конец 118,248,592 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • липидное связывание • ARF активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Сотовый компонент • цитоплазма • внешний компонент цитоплазматической стороны плазматической мембраны • клеточная мембрана • мембрана • цитозоль • Мембрана Гольджи • стык • двухклеточное плотное соединение • соединение клеток Биологический процесс • регуляция передачи сигнала белка ARF • регуляция клеточной адгезии • везикулярный транспорт • установление полярности эпителиальных клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9267	19157
Ансамбль	ENSG00000108669	ENSMUSG00000017132
UniProt	Q15438	Q9QX11
RefSeq (мРНК)	NM_001292018 NM_001292019 NM_004762 NM_017456 NM_001365037 NM_001365038 NM_001365039 NM_001365040 NM_001365041	NM_001112699 NM_001112700 NM_011180 NM_001378885 NM_001378886 NM_001378887 NM_001378888
RefSeq (белок)	NP_001278947 NP_001278948 NP_004753 NP_059430 NP_001351966 NP_001351967 NP_001351968 NP_001351969 NP_001351970	NP_001106169 NP_001106170 NP_035310 NP_001365814 NP_001365815 NP_001365816 NP_001365817
Расположение (UCSC)	Chr 17: 78.67 - 78.78 Мб	Chr 11: 118.13 - 118.25 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цитогезин-1 ранее известный как гомология плэкстрина, Sec7 и coiled / coil домены 1 (PSCD1) являются белок что у людей кодируется CYTH1 ген.^[5][6][7]

Функция

Цитогезин-1 (CYTH1) является членом семейства цитогезинов. Члены этого семейства имеют идентичную структурную организацию, состоящую из N-концевой спиральная катушка мотив, центральный домен Sec7 и C-терминал гомология плекстрина (PH) домен. Мотив coiled-coil участвует в гомодимеризация, домен Sec7 содержит гуанин-нуклеотидный обмен белка (GEP), а домен PH взаимодействует с фосфолипиды и отвечает за ассоциацию CYTHs с мембранами. Представляется, что члены этой семьи опосредуют регулирование сортировка белков и мембранный трафик. CYTH1 высоко экспрессируется в естественный убийца и периферийные Т-клетки, и регулирует адгезию интегринов к плазматической мембране лимфоциты. Белок CYTH1 на 83% гомологичен CYTH2.^[7]

Взаимодействия

CYTH1 показал взаимодействовать с участием:

• ARFRP1,^[8]
• CD18,^[9][10] и
• TRIM23.^[11]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108669 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000017132 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лю Л., Похайдак Б. (сентябрь 1992 г.). «Клонирование и секвенирование кДНК человека из цитолитических NK / T-клеток, гомологичных дрожжевому SEC7». Биохим. Биофиз. Acta. 1132 (1): 75–8. Дои:10.1016/0167-4781(92)90055-5. PMID  1511013.
6. Диксон Б., Мансур М., Похайдак Б. (апрель 1993 г.). «Присвоение человеческого гена B2-1 (D17S811E) хромосоме 17qter с помощью ПЦР-анализа гибридов соматических клеток и флуоресцентной гибридизации in situ». Cytogenet. Cell Genet. 63 (1): 42–4. Дои:10.1159/000133498. PMID  8449036.
7. «Ген Entrez: гомология плекстрина PSCD1, Sec7 и домены 1 спиральной спирали (цитохезин 1)».
8. Шюрманн А., Шмидт М., Асмус М., Байер С., Флигерт Ф., Колинг С., Массманн С., Шильф С., Субаусте М.С., Восс М., Якобс К. Х., Йост Х. Г. (апрель 1999 г.). «Связанный с АДФ-фактором рибозилирования (ARF) белок GTPase, связанный с ARF, связывается с ARF-специфическим фактором обмена гуаниновых нуклеотидов цитохезином и ингибирует ARF-зависимую активацию фосфолипазы D». J. Biol. Chem. 274 (14): 9744–51. Дои:10.1074 / jbc.274.14.9744. PMID  10092663.
9. Рицлер М., Биттнер М., Коланус В., Шустер А., Хольцманн Б. (октябрь 1998 г.). «Белок с повторами WD человека WAIT-1 специфически взаимодействует с цитоплазматическими хвостами бета7-интегринов». J. Biol. Chem. 273 (42): 27459–66. Дои:10.1074 / jbc.273.42.27459. PMID  9765275.
10. Гейгер С., Нагель В., Бем Т., ван Койк Ю., Фигдор К. Г., Креммер Е., Хогг Н., Цейтлманн Л., Диркс Н., Вебер К. С., Коланус В. (июнь 2000 г.). «Цитогезин-1 регулирует адгезию, опосредованную бета-2 интегрином, посредством функции ARF-GEF и взаимодействия с LFA-1». EMBO J. 19 (11): 2525–36. Дои:10.1093 / emboj / 19.11.2525. ЧВК  212768. PMID  10835351.
11. Vitale N, Pacheco-Rodriguez G, Ferrans VJ, Riemenschneider W, Moss J, Vaughan M (июль 2000 г.). «Специфическое функциональное взаимодействие человеческого цитохезина-1 и белка домена фактора ADP-рибозилирования (ARD1)». J. Biol. Chem. 275 (28): 21331–9. Дои:10.1074 / jbc.M909642199. PMID  10748148.

дальнейшее чтение

• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Коланус В., Нагель В., Шиллер Б., Цейтлманн Л., Годар С., Стокингер Н., Сид Б. (1996). «Связывание интегрина альфа L бета 2 / LFA-1 с ICAM-1, индуцированное цитохезином-1, цитоплазматической регуляторной молекулой». Ячейка. 86 (2): 233–42. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80095-1. PMID  8706128. S2CID  18390795.
• Миччи Э., Цай С.К., Адамик Р., Мосс Дж., Воган М. (1997). «Цитогезин-1, цитозольный гуанин-нуклеотид-обменный белок для фактора ADP-рибозилирования». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (5): 1745–8. Дои:10.1073 / пнас.94.5.1745. ЧВК  19987. PMID  9050849.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. К., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Ю. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Нагель В., Цайтльманн Л., Шилхер П., Гейгер С., Коланус Дж., Коланус В. (1998). «Фосфоинозитид 3-ОН киназа активирует путь адгезии интегрина бета 2 и индуцирует привлечение цитогезина-1 в мембрану». J. Biol. Chem. 273 (24): 14853–61. Дои:10.1074 / jbc.273.24.14853. PMID  9614087.
• Бец С.Ф., Шнухель А., Ван Х., Олейничак Е.Т., Медоуз Р.П., Липски Б.П., Харрис Е.А., Стонтон Д.Е., Фесик С.В. (1998). «Структура раствора цитогезина-1 (B2-1) Sec7 домена и его взаимодействие с фактором рибозилирования 1 GTPase ADP». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (14): 7909–14. Дои:10.1073 / пнас.95.14.7909. ЧВК  20903. PMID  9653114.
• Нагель В., Шилхер П., Цейтлманн Л., Коланус В. (1998). «PH-домен и многоосновный c-домен цитогезина-1 специфически взаимодействуют в ассоциации с плазматической мембраной и клеточной функции». Мол. Биол. Ячейка. 9 (8): 1981–94. Дои:10.1091 / mbc.9.8.1981. ЧВК  25450. PMID  9693361.
• Пачеко-Родригес Г., Меаччи Е., Витале Н., Мосс Дж., Воан М. (1998). «Обмен гуаниновых нуклеотидов на факторах ADP-рибозилирования, катализируемый цитогезином-1 и его доменом Sec7». J. Biol. Chem. 273 (41): 26543–8. Дои:10.1074 / jbc.273.41.26543. PMID  9756891.
• Рицлер М., Биттнер М., Коланус В., Шустер А., Хольцманн Б. (1998). «Белок с повторами WD человека WAIT-1 специфически взаимодействует с цитоплазматическими хвостами бета7-интегринов». J. Biol. Chem. 273 (42): 27459–66. Дои:10.1074 / jbc.273.42.27459. PMID  9765275.
• Шюрманн А., Шмидт М., Асмус М., Байер С., Флигерт Ф., Колинг С., Массманн С., Шильф С., Субаусте М.С., Восс М., Якобс К. Х., Йост Х. Г. (1999). «Связанный с АДФ-фактором рибозилирования (ARF) белок GTPase, связанный с ARF, связывается с ARF-специфическим фактором обмена гуаниновых нуклеотидов цитохезином и ингибирует ARF-зависимую активацию фосфолипазы D». J. Biol. Chem. 274 (14): 9744–51. Дои:10.1074 / jbc.274.14.9744. PMID  10092663.
• Пачеко-Родригес Дж., Паттон В.А., Адамик Р., Ю Х.С., Ли Ф.Дж., Чжан Г.Ф., Мосс Дж., Воган М. (1999). «Структурные элементы фактора АДФ-рибозилирования 1, необходимые для функционального взаимодействия с цитогезином-1». J. Biol. Chem. 274 (18): 12438–44. Дои:10.1074 / jbc.274.18.12438. PMID  10212218.
• Венкатесварлу К., Ганн-Мур Ф., Таваре Дж. М., Каллен П. Дж. (1999). «Стимулированная EGF и NGF транслокация цитогезина-1 к плазматической мембране клеток PC12 требует активации PI 3-киназы и функционального PH домена цитогезина-1». J. Cell Sci. 112 (Pt 12) (12): 1957–65. PMID  10341214.
• Огасавара М., Ким С.К., Адамик Р., Тогава А., Ферранс В.Дж., Такеда К., Кирби М., Мосс Дж., Воган М. (2000). «Сходства в функции и структуре генов цитогезина-4 и цитогезина-1, белков обмена гуаниновых нуклеотидов для факторов ADP-рибозилирования». J. Biol. Chem. 275 (5): 3221–30. Дои:10.1074 / jbc.275.5.3221. PMID  10652308.
• Витале Н., Пачеко-Родригес Г., Ферранс В.Дж., Рименшнайдер В., Мосс Дж., Воган М. (2000). «Специфическое функциональное взаимодействие человеческого цитохезина-1 и белка домена фактора ADP-рибозилирования (ARD1)». J. Biol. Chem. 275 (28): 21331–9. Дои:10.1074 / jbc.M909642199. PMID  10748148.
• Ли С.Ю., Мансур М., Похайдак Б. (2000). «B2-1, белок, содержащий домен гомологии Sec7 и плекстрина, локализуется в комплексе Гольджи». Exp. Cell Res. 256 (2): 515–21. Дои:10.1006 / excr.2000.4845. PMID  10772823.
• Гейгер С., Нагель В., Бем Т., ван Койк Ю., Фигдор К. Г., Креммер Е., Хогг Н., Цайтлманн Л., Диркс Н., Вебер К. С., Коланус В. (2000). «Цитогезин-1 регулирует адгезию, опосредованную бета-2 интегрином, посредством функции ARF-GEF и взаимодействия с LFA-1». EMBO J. 19 (11): 2525–36. Дои:10.1093 / emboj / 19.11.2525. ЧВК  212768. PMID  10835351.
• Диркс Х., Коланус Дж., Коланус В. (2001). «Актиновая ассоциация цитоскелета цитохезина-1 регулируется специфическим фосфорилированием его карбоксиконцевого многоосновного домена». J. Biol. Chem. 276 (40): 37472–81. Дои:10.1074 / jbc.M101502200. PMID  11438522.
• Тан П, Ченг Т.П., Агнелло Д., Ву Си Ю., Хиссонг Б. Д., Уотфорд В. Т., Ан Х. Дж., Галон Дж., Мосс Дж., Воан М., О'Ши Дж. Дж., Гадина М. (2002). «Cybr, цитокин-индуцируемый белок, который связывает цитохезин-1 и регулирует его активность». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (5): 2625–9. Дои:10.1073 / pnas.052712999. ЧВК  122398. PMID  11867758.