CSDE1 - CSDE1

CSDE1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1WFQ, 1X65, 2YTV, 2YTX, 2YTY
Идентификаторы
Псевдонимы	CSDE1, D1S155E, UNR, область холодного шока, содержащая E1
Внешние идентификаторы	OMIM: 191510 MGI: 92356 ГомолоГен: 5179 Генные карты: CSDE1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п13.2 Начните 114,716,913 бп[1] Конец 114,758,676 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 F2.2 | 3 45,25 см Начните 103,020,426 бп[2] Конец 103,058,186 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК Сотовый компонент • CRD-опосредованный комплекс стабильности мРНК • митохондриальная внутренняя мембрана • клеточная мембрана • аппарат Гольджи • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • развитие мужских гонад • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК, беспрерывный распад Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	7812	229663
Ансамбль	ENSG00000009307	ENSMUSG00000068823
UniProt	O75534	Q91W50
RefSeq (мРНК)	NM_007158 NM_001007553 NM_001130523 NM_001242891 NM_001242892 NM_001242893	NM_001161854 NM_144901 NM_001310693
RefSeq (белок)	NP_001007554 NP_001123995 NP_001229820 NP_001229821 NP_001229822 NP_009089	NP_001155326 NP_001297622 NP_659150
Расположение (UCSC)	Chr 1: 114,72 - 114,76 Мб	Chr 3: 103.02 - 103.06 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок Е1, содержащий домен холодного шока это белок что в люди кодируется CSDE1 ген.^[5][6][7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000009307 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000068823 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Джефферс М., Пачуччи Р., Пеллисер А. (октябрь 1990 г.). «Характеристика unr; гена, тесно связанного с N-ras». Нуклеиновые кислоты Res. 18 (16): 4891–9. ЧВК  331975. PMID  2204029.
6. Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (май 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (6): 355–64. Дои:10.1093 / днарес / 5.6.355. PMID  10048485.
7. «Ген Entrez: домен холодного шока CSDE1, содержащий E1, связывание РНК».

внешние ссылки

• Человек CSDE1 расположение генома и CSDE1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Николаев N, Triqueneaux G, Dautry F (1991). «Организация человеческого локуса N-ras: характеристика гена, расположенного непосредственно перед N-ras». Онкоген. 6 (5): 721–30. PMID  2052355.
• Boussadia O, Jacquemin-Sablon H, Dautry F (1993). «Пропуск экзона в экспрессии гена непосредственно перед N-ras (unr / NRU)». Биохим. Биофиз. Acta. 1172 (1–2): 64–72. Дои:10.1016 / 0167-4781 (93) 90270-Н. PMID  8439573.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Хант С.Л., Сюань Дж.Дж., Тотти Н., Джексон Р.Дж. (1999). «unr, клеточный цитоплазматический РНК-связывающий белок с пятью доменами холодового шока, необходим для внутренней инициации трансляции РНК человеческого риновируса». Genes Dev. 13 (4): 437–48. Дои:10.1101 / gad.13.4.437. ЧВК  316477. PMID  10049359.
• Гроссет С., Чен С.Ю., Сюй Н. и др. (2000). «Механизм трансляционного обмена мРНК: взаимодействие между поли (А) хвостом и детерминантой, кодирующей РНК c-fos через белковый комплекс». Ячейка. 103 (1): 29–40. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 00102-1. PMID  11051545.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Митчелл С.А., Сприггс К.А., Колдвелл М.Дж. и др. (2003). «Внутренний входной сегмент рибосомы Apaf-1 достигает правильной структурной конформации для функции посредством взаимодействий с PTB и unr». Мол. Ячейка. 11 (3): 757–71. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00093-5. PMID  12667457.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Чанг Т.С., Ямасита А., Чен С.Ю. и др. (2004). «UNR, новый партнер поли (A) -связывающего белка, играет ключевую роль в трансляционно-связанном обмене мРНК, опосредованном детерминантой основной кодирующей области c-fos». Genes Dev. 18 (16): 2010–23. Дои:10.1101 / gad.1219104. ЧВК  514181. PMID  15314026.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Корнелис С., Тинтон С.А., Шепенс Б. и др. (2005). «Трансляция UNR может управляться элементом IRES, который негативно регулируется белком, связывающим полипиримидиновый тракт». Нуклеиновые кислоты Res. 33 (10): 3095–108. Дои:10.1093 / нар / gki611. ЧВК  1142345. PMID  15928332.
• Пател Г. П., Ма С., Сумка Дж. (2006). «Ауторегуляторный элемент управления трансляцией мРНК поли (A) -связывающего белка образует гетеромерный рибонуклеопротеидный комплекс». Нуклеиновые кислоты Res. 33 (22): 7074–89. Дои:10.1093 / нар / gki1014. ЧВК  1316114. PMID  16356927.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983.