CSDC2 - CSDC2

CSDC2
Идентификаторы
Псевдонимы	CSDC2, PIPPIN, dJ347H13.2, домен холодного шока, содержащий C2
Внешние идентификаторы	OMIM: 617689 MGI: 2146027 ГомолоГен: 8701 Генные карты: CSDC2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q13.2 Начинать 41,561,010 бп[1] Конец 41,577,741 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 E1 Начинать 81,936,759 бп[2] Конец 81,950,941 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание мРНК 3'-UTR • связывание фактора транскрипции Сотовый компонент • ядро клетки • цитоплазма Биологический процесс • обработка мРНК • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция стабильности мРНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	27254	105859
Ансамбль	ENSG00000172346	ENSMUSG00000042109
UniProt	Q9Y534	Q91YQ3
RefSeq (мРНК)	NM_014460	NM_145473
RefSeq (белок)	NP_055275	NP_663448
Расположение (UCSC)	Chr 22: 41,56 - 41,58 Мб	Chr 15: 81.94 - 81.95 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок C2, содержащий домен холодного шока это белок что у людей кодируется CSDC2 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000172346 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042109 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Castiglia D, Scaturro M, Nastasi T, Cestelli A, Di Liegro I (март 1996 г.). «PIPPin, предполагаемый РНК-связывающий белок, специфически экспрессируемый в головном мозге крысы». Biochem Biophys Res Commun. 218 (1): 390–4. Дои:10.1006 / bbrc.1996.0068. PMID  8573167.
6. Раймонди Л., Д'Асаро М., Пройя П., Настаси Т., Ди Лигро I (май 2003 г.). «РНК-связывающая способность PIPPin требует всего белка». J Cell Mol Med. 7 (1): 35–42. Дои:10.1111 / j.1582-4934.2003.tb00200.x. ЧВК  6740078. PMID  12767259.
7. «Ген Entrez: домен холодного шока CSDC2, содержащий C2, связывание РНК».

внешняя ссылка

• Человек CSDC2 расположение генома и CSDC2 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Настаси Т., Скатурро М., Беллафиоре М. и др. (1999). «PIPPin - это специфический для мозга белок, который содержит домен холодового шока и специфически связывается с мРНК H1 степени и H3.3». J. Biol. Chem. 274 (34): 24087–93. Дои:10.1074 / jbc.274.34.24087. PMID  10446180.
• Данэм И., Шимицу Н., Роу Б.А. и др. (1999). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.
• Настаси Т., Музи П., Беккари С. и др. (2001). «Определенные нейроны коры головного мозга и мозжечка являются PIPPin-положительными». NeuroReport. 11 (10): 2233–6. Дои:10.1097/00001756-200007140-00034. PMID  10923677.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Schäfer C, Steffen H, Krzykowski KJ и др. (2003). «Фосфорилирование CRHSP-24 регулируется множеством сигнальных путей в ацинарных клетках поджелудочной железы». Являюсь. J. Physiol. Гастроинтест. Физиология печени. 285 (4): G726–34. Дои:10.1152 / ajpgi.00111.2003. PMID  12801884.
• Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс К. А. и др. (2005). «Основанный на аннотации генома подход к клонированию ORFeome человека». Геном Биол. 5 (10): R84. Дои:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. ЧВК  545604. PMID  15461802.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.