CRIPT - CRIPT

Для мюонного детектора, известного как CRIPT Детектор, видеть Мюонная томография.

CRIPT
Идентификаторы
Псевдонимы	CRIPT, SSMDF, HSPC139, повтор CXXC, содержащий интерактор домена PDZ3
Внешние идентификаторы	OMIM: 604594 MGI: 1929655 ГомолоГен: 8572 Генные карты: CRIPT
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п21 Начинать 46,616,416 бп[1] Конец 46,630,176 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 E4 Начинать 87,025,550 бп[2] Конец 87,035,810 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание микротрубочек • связывание с белками каркаса • Связывание домена PDZ • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса Сотовый компонент • цитоплазма • дендритный вал • соединение клеток • тело нейрональной клетки • дендритный позвоночник • дендрит • проекция клетки • синапс • ядрышко • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • ядро клетки • фибриллярный центр Биологический процесс • регуляция кластеризации белков постсинаптической плотности 95 • локализация белка в микротрубочке • организация цитоплазматических микротрубочек • установление локализации белка Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9419	56724
Ансамбль	ENSG00000119878	ENSMUSG00000024146
UniProt	Q9P021	O70333
RefSeq (мРНК)	NM_014171	NM_019936
RefSeq (белок)	NP_054890	NP_064320
Расположение (UCSC)	Chr 2: 46.62 - 46.63 Мб	Chr 17: 87.03 - 87.04 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

PDZ-связывающий белок, богатый цистеином это белок что у людей кодируется CRIPT ген.^{[5][6][7][8][9]}

Взаимодействия

CRIPT был показан взаимодействовать с DLG3.^[10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000119878 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024146 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Фукунага Ю., Мацубара М., Нагай Р., Миядзава А. (август 2005 г.). «Взаимодействие между PSD-95 и Ca2 + / кальмодулином усиливается PDZ-связывающими белками». J Biochem. 138 (2): 177–82. Дои:10.1093 / jb / mvi107. PMID  16091592.
6. Piserchio A, Pellegrini M, Mehta S, Blackman SM, Garcia EP, Marshall J, Mierke DF (февраль 2002 г.). «Домен PDZ1 SAP90. Характеристика структуры и связывания». J Biol Chem. 277 (9): 6967–73. Дои:10.1074 / jbc.M109453200. PMID  11744724.
7. Пассафаро М., Зала С, Нитхаммер М., Шенг М. (январь 2000 г.). «Связывание микротрубочек с помощью CRIPT и его потенциальная роль в синаптическом кластеризации PSD-95». Nat Neurosci. 2 (12): 1063–9. Дои:10.1038/15990. PMID  10570482. S2CID  8145832.
8. Niethammer M, Valtschanoff JG, Kapoor TM, Allison DW, Weinberg RJ, Craig AM, Sheng M (июнь 1998 г.). «CRIPT, новый постсинаптический белок, который связывается с третьим доменом PDZ PSD-95 / SAP90». Нейрон. 20 (4): 693–707. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 81009-0. PMID  9581762. S2CID  16068361.
9. «Ген Entrez: CRIPT-богатый цистеином PDZ-связывающий белок».
10. Лим, Индра Ади; Холл Дуэйн D; Ад Йоханнес В (июнь 2002 г.). «Селективность и неразборчивость первого и второго доменов PDZ PSD-95 и синапс-ассоциированного белка 102». J. Biol. Chem. Соединенные Штаты. 277 (24): 21697–711. Дои:10.1074 / jbc.M112339200. ISSN  0021-9258. PMID  11937501.

дальнейшее чтение

• Чжан К.Х., Е М., Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Лим И.А., Холл Д.Д., Ад JW (2002). «Селективность и неразборчивость первого и второго доменов PDZ PSD-95 и синапс-ассоциированного белка 102». J. Biol. Chem. 277 (24): 21697–711. Дои:10.1074 / jbc.M112339200. PMID  11937501.
• Cai C, Coleman SK, Niemi K, Keinänen K (2002). «Селективное связывание синапс-ассоциированного белка 97 с субъединицей рецептора альфа-амино-5-гидрокси-3-метил-4-изоксазол пропионата GluR-A определяется новым мотивом последовательности». J. Biol. Chem. 277 (35): 31484–90. Дои:10.1074 / jbc.M204354200. PMID  12070168.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Стиффлер М.А., Гранчарова В.П., Севецкая М., Макбит Г. (2007). «Выявление количественных сетей взаимодействия белков для доменов PDZ мыши с использованием белковых микрочипов». Варенье. Chem. Soc. 128 (17): 5913–22. Дои:10.1021 / ja060943h. ЧВК  2533859. PMID  16637659.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть межбелкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.

внешняя ссылка

• Человек CRIPT расположение генома и CRIPT страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.