CPSF7 - CPSF7

CPSF7
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3Н9У
Идентификаторы
Псевдонимы	CPSF7, CFIm59, FLJ12529, специфический фактор расщепления и полиаденилирования 7
Внешние идентификаторы	MGI: 1917826 ГомолоГен: 11731 Генные карты: CPSF7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q12.2 Начинать 61,402,641 бп[1] Конец 61,430,031 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 А Начинать 10,525,266 бп[2] Конец 10,547,653 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК Сотовый компонент • мембрана • ядро клетки • нуклеоплазма • комплекс факторов расщепления мРНК • цитоплазма • Комплекс факторов специфичности расщепления мРНК и полиаденилирования Биологический процесс • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • прекращение транскрипции РНК-полимеразы II • обработка мРНК • Обработка 3'-конца мРНК • тетрамеризация белков • гетеротетрамеризация белков • расщепление пре-мРНК, необходимое для полиаденилирования • альтернативное полиаденилирование мРНК • сборка комплекса рибонуклеопротеидов-мессенджеров Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	79869	269061
Ансамбль	ENSG00000149532	ENSMUSG00000034820
UniProt	Q8N684	Q8BTV2
RefSeq (мРНК)	NM_001136040 NM_001142565 NM_024811	NM_001164272 NM_172302 NM_001362450
RefSeq (белок)	NP_001129512 NP_001136037 NP_079087	NP_001157744 NP_758506 NP_001349379
Расположение (UCSC)	Chr 11: 61,4 - 61,43 Мб	Chr 19: 10,53 - 10,55 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица 7 фактора специфичности расщепления и полиаденилирования это белок что у людей кодируется CPSF7 ген.^[5][6]

Функция

CPSF7, также известный как CFIm59, является фактор расщепления двух тесно связанных белковые комплексы в 3 'непереведенный регион недавно синтезированного пре-информационная РНК (мРНК) молекула, используемая в транскрипция гена. ^[7] CPSF7 - один из трех Факторы специфичности расщепления и полиаденилирования (CPSF), два других - CFIm25 (или CPSF5 /NUDT21 ) и CFIm68 (или CPSF6 ).

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000149532 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034820 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, et al. (Декабрь 2002 г.). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
6. «Ген Entrez: фактор расщепления пре-мРНК I FLJ12529, субъединица 59 кДа».
7. Харди Дж. Дж., Норбери Си Джей (август 2016 г.). «Фактор расщепления Im (CFIm) как регулятор альтернативного полиаденилирования». Сделки Биохимического Общества. 44 (4): 1051–7. Дои:10.1042 / BST20160078. PMID  27528751.

дальнейшее чтение

• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу К., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руал Дж. Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Е., Барабаши А.Л., Видал М., Зогби Х.Ю. (май 2006 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (май 2004 г.). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т-клеток человека с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованным металлом и тандемной масс-спектрометрии». Аналитическая химия. 76 (10): 2763–72. Дои:10.1021 / ac035352d. PMID  15144186.
• Rüegsegger U, Beyer K, Keller W (март 1996). «Очистка и характеристика человеческого фактора расщепления Im, участвующего в процессинге 3'-конца предшественников матричной РНК». Журнал биологической химии. 271 (11): 6107–13. Дои:10.1074 / jbc.271.11.6107. PMID  8626397.