CPEB1 - CPEB1

CPEB1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2М13, 2МХ, 2МКК, 2N1O
Идентификаторы
Псевдонимы	CPEB1, CEBP, CPE-BP1, CPEB, CPEB-1, hCPEB-1, h-CPEB, цитоплазматический белок, связывающий элемент полиаденилирования 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 607342 MGI: 108442 ГомолоГен: 7278 Генные карты: CPEB1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q25.2 Начинать 82,543,201 бп[1] Конец 82,648,861 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 D3 Начинать 81,347,026 бп[2] Конец 81,455,465 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • Связывание мРНК 3'-UTR AU-богатой области • активность фактора трансляции, связывание РНК • Связывание РНК • связывание нуклеиновой кислоты • связывание рибосом • активность репрессора трансляции, связывание нуклеиновых кислот • Связывание мРНК 3'-UTR • деятельность регулятора перевода • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • синапс • проекция клетки • соединение клеток • проекция нейрона • мессенджер рибонуклеопротеиновый комплекс • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • постсинаптическая мембрана • мембрана • П-боди • дендрит • клеточная мембрана • цитоплазма • ядро клетки • нуклеоплазма • цитозоль Биологический процесс • клеточный ответ на стимул инсулина • регулирование перевода • отрицательная регуляция цитоплазматической трансляции • обработка мРНК • клеточный ответ на аминокислотный стимул • клеточный ответ на гипоксию • биосинтез белка • положительная регуляция полиаденилирования мРНК Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	64506	12877
Ансамбль	ENSG00000277445 ENSG00000214575	ENSMUSG00000025586
UniProt	Q9BZB8	P70166
RefSeq (мРНК)	NM_030594 NM_001079533 NM_001079534 NM_001079535 NM_001288819 NM_001288820	NM_001252525 NM_001252526 NM_007755 NM_001357107
RefSeq (белок)	NP_001073001 NP_001073002 NP_001073003 NP_001275748 NP_001275749 NP_085097 NP_001352169 NP_001352170 NP_001352171 NP_001352172 NP_001352173 NP_001352174 NP_001352175 NP_001352176 NP_001352177 NP_001352178 NP_001352179	NP_001239454 NP_001239455 NP_031781 NP_001344036
Расположение (UCSC)	Chr 15: 82,54 - 82,65 Мб	Chr 7: 81.35 - 81.46 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цитоплазматический белок, связывающий элемент полиаденилирования 1 это белок что в люди кодируется CPEB1 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует член цитоплазматический элемент полиаденилирования (CPE) привязка белковая семья. Этот высококонсервативный белок связывается со специфическим РНК последовательность, называемая CPE, найденная в 3 'UTR некоторых мРНК. Подобные белки в Xenopus и мышь функция побуждать цитоплазматический полиаденилирование спящих мРНК с короткими полиА-хвостами, в результате чего их перевод. Члены этого семейства белков регулируют трансляцию циклин B1 в течение эмбриональный деления клеток. Несколько стенограмма варианты кодирование разных изоформы были обнаружены для этого гена.^[6]

Рекомендации

1. ENSG00000214575 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000277445, ENSG00000214575 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025586 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Велк Дж. Ф., Чарльзуорт А., Смит Г. Д., Макникол А. М. (март 2001 г.). «Идентификация и характеристика гена, кодирующего человеческий цитоплазматический белок, связывающий элемент полиаденилирования». Ген. 263 (1–2): 113–20. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00588-6. PMID  11223249.
6. «Ген Entrez: CPEB1, связывающий цитоплазматический элемент полиаденилирования, белок 1».

дальнейшее чтение

• Мендес Р., Рихтер Дж. Д. (2001). «Трансляционный контроль со стороны CPEB: средство до конца». Nat. Преподобный Мол. Cell Biol. 2 (7): 521–9. Дои:10.1038/35080081. PMID  11433366.
• «К полной последовательности человеческого генома». Genome Res. 8 (11): 1097–108. 1999. Дои:10.1101 / гр. 8.11.1097. PMID  9847074.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Хуанг Ю.С., Карсон Дж. Х., Барбарез Э., Рихтер Дж. Д. (2003). «Облегчение транспорта дендритной мРНК CPEB». Genes Dev. 17 (5): 638–53. Дои:10.1101 / gad.1053003. ЧВК  196011. PMID  12629046.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Wilczynska A, Aigueperse C, Kress M и др. (2005). «Регулятор трансляции CPEB1 обеспечивает связь между телами dcp1 и стрессовыми гранулами». J. Cell Sci. 118 (Pt 5): 981–92. Дои:10.1242 / jcs.01692. PMID  15731006.
• Сасаяма Т., Марумото Т., Кунитоку Н. и др. (2005). «Сверхэкспрессия Aurora-A нацелена на белок, связывающий цитоплазматический элемент полиаденилирования, и способствует полиаденилированию мРНК Cdk1 и циклина B1». Гены Клетки. 10 (7): 627–38. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2005.00870.x. PMID  15966895.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.

внешняя ссылка

• Человек CPEB1 расположение генома и CPEB1 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.