COMMD1 - COMMD1

COMMD1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2H2M
Идентификаторы
Псевдонимы	COMMD1, C2orf5, MURR1, домен метаболизма меди, содержащий 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 607238 MGI: 109474 ГомолоГен: 17604 Генные карты: COMMD1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п15 Начните 61,888,724 бп[1] Конец 62,147,247 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 A3.2 | 11 14,22 см Начните 22,896,136 бп[2] Конец 22,982,382 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность гомодимеризации белков • связывание фосфатидилинозитол-3,5-бисфосфата • связывание ионов металлов • связывание фосфатидилинозитол-3,4-бисфосфата • связывание фосфатидной кислоты • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • связывание фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфата • связывание ионов меди • связывание фосфатидилинозитол-3,4,5-трифосфата • связывание липидов Сотовый компонент • цитоплазма • переработка эндосомы • эндосома • мембрана • Cul2-RING убиквитинлигазный комплекс • ранняя эндосома • эндосомная мембрана • цитоплазматический пузырек • ядро клетки • нуклеоплазма • цитозоль Биологический процесс • отрицательная регуляция трансмембранного транспорта ионов натрия • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция локализации белка на поверхности клетки • плазматическая мембрана к транспорту эндосом • регуляция протеасомного убиквитин-зависимого катаболического процесса белков • транспорт белка • отрицательная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • положительная регуляция убиквитинирования белков • Гольджи к транспорту через плазматическую мембрану • посттрансляционная модификация • гомеостаз ионов меди • убиквитинирование белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	150684	17846
Ансамбль	ENSG00000173163	ENSMUSG00000051355
UniProt	Q8N668	Q8K4M5
RefSeq (мРНК)	NM_152516 NM_001321781 NM_001321782 NM_001371765	NM_144514 NM_001361661
RefSeq (белок)	NP_001308710 NP_001308711 NP_689729 NP_001358694	NP_653097 NP_001348590
Расположение (UCSC)	Chr 2: 61,89 - 62,15 Мб	Chr 11: 22.9 - 22.98 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

COMM-домен, содержащий белок 1 это белок который закодирован COMMD1 ген в людях. Первоначально он считался Murr1, а затем был выделен и переименован лабораторией доктора Эзры Бурштейна.^[5][6][7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000173163 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000051355 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Набетани А., Хатада И., Морисаки Х., Осимура М., Мукаи Т. (февраль 1997 г.). «Мышь U2af1-rs1 - неоморфный импринтированный ген». Mol Cell Biol. 17 (2): 789–98. Дои:10.1128 / mcb.17.2.789. ЧВК  231805. PMID  9001233.
6. ван Де Слуис Б., Ротуйзен Дж., Пирсон П.Л., ван Ост Б.А., Вейменга С. (январь 2002 г.). «Идентификация нового гена метаболизма меди путем позиционного клонирования в популяции чистокровных собак». Хум Мол Генет. 11 (2): 165–73. Дои:10.1093 / hmg / 11.2.165. PMID  11809725.
7. «Ген Entrez: домен метаболизма меди COMMD1 (Murr1), содержащий 1».

внешние ссылки

• Человек COMMD1 расположение генома и COMMD1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Харрингтон Дж. Дж., Шерф Б., Рандлетт С. и др. (2001). «Создание полногеномных библиотек экспрессии белков с использованием случайной активации экспрессии генов». Nat. Биотехнология. 19 (5): 440–5. Дои:10.1038/88107. PMID  11329013. S2CID  25064683.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Мюллер Т., ван де Слуис Б., Жернакова А. и др. (2003). «Ген токсикоза меди у собак MURR1 не вызывает невильсоновского токсикоза меди в печени». J. Hepatol. 38 (2): 164–8. Дои:10.1016 / S0168-8278 (02) 00356-2. PMID  12547404.
• Тао Т.Ю., Лю Ф., Кломп Л. и др. (2004). «Продукт гена токсикоза меди Murr1 напрямую взаимодействует с белком болезни Вильсона». J. Biol. Chem. 278 (43): 41593–6. Дои:10.1074 / jbc.C300391200. PMID  12968035.
• Кломп А.Е., ван де Слуис Б., Кломп Л.В., Вейменга С. (2004). «Повсеместно экспрессируемый белок MURR1 отсутствует при токсикозе меди у собак». J. Hepatol. 39 (5): 703–9. Дои:10.1016 / S0168-8278 (03) 00380-5. PMID  14568250.
• Биазио В., Чанг Т., Макинтош С.Дж., Макдональд Ф.Дж. (2004). «Идентификация Murr1 как регулятора натриевого канала дельта-эпителия человека». J. Biol. Chem. 279 (7): 5429–34. Дои:10.1074 / jbc.M311155200. PMID  14645214.
• Ганеш Л., Бурштейн Э, Гуха-Нийоги А. и др. (2004). «Продукт гена Murr1 ограничивает репликацию ВИЧ-1 в покоящихся CD4 + лимфоцитах». Природа. 426 (6968): 853–7. Дои:10.1038 / природа02171. HDL:2027.42/62709. PMID  14685242. S2CID  4344050.
• Бурштейн Э., Ганеш Л., Дик Р.Д. и др. (2004). «Новая роль XIAP в гомеостазе меди посредством регуляции MURR1». EMBO J. 23 (1): 244–54. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600031. ЧВК  1271669. PMID  14685266.
• Штюлер Б, Райхерт Дж, Стреммель В, Шефер М (2005). «Анализ человеческого гомолога гена собачьего токсикоза меди MURR1 у пациентов с болезнью Вильсона». J. Mol. Med. 82 (9): 629–34. Дои:10.1007 / s00109-004-0557-9. PMID  15205742. S2CID  8184776.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Бурштейн Э., Хоберг Дж. Э., Уилкинсон А.С. и др. (2005). «Белки COMMD, новое семейство структурных и функциональных гомологов MURR1». J. Biol. Chem. 280 (23): 22222–32. Дои:10.1074 / jbc.M501928200. PMID  15799966.
• Коронадо В.А., Бонневиль Дж. А., Назер Х. и др. (2006). «COMMD1 (MURR1) как кандидат у пациентов с болезнью накопления меди неустановленной этиологии». Clin. Genet. 68 (6): 548–51. Дои:10.1111 / j.1399-0004.2005.00524.x. PMID  16283886. S2CID  27815621.
• Zhang Z, Joh K, Yatsuki H, et al. (2006). «Сравнительный анализ геномного импринтинга и метилирования CpG-островков в локусах Murr1 мыши и MURR1 человека выявил предполагаемую контрольную область импринтинга у мышей». Ген. 366 (1): 77–86. Дои:10.1016 / j.gene.2005.08.020. PMID  16305817.
• де Би П., ван де Слуис Б., Бурштейн Е. и др. (2006). «Характеристика белок-белковых взаимодействий COMMD в передаче сигналов NF-kappaB». Biochem. J. 398 (1): 63–71. Дои:10.1042 / BJ20051664. ЧВК  1525016. PMID  16573520.
• Sommerhalter M, Zhang Y, Rosenzweig AC (2007). «Структура решения N-концевого домена COMMD1». J. Mol. Биол. 365 (3): 715–21. Дои:10.1016 / j.jmb.2006.10.030. ЧВК  2706016. PMID  17097678.
• Мэн Г. Н., Мао X, Комарк С. М., Бурштейн Э (2007). «COMMD1 способствует убиквитинированию субъединиц NF-kappaB посредством убиквитинлигазы, содержащей каллин». EMBO J. 26 (2): 436–47. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601489. ЧВК  1783443. PMID  17183367.