CLK1 - CLK1

Эта статья о ферменте протеин киназа. Для использования в других целях см. CLK-1 (значения).

CLK1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1Z57, 2VAG, 5J1V, 5J1W
Идентификаторы
Псевдонимы	CLK1, CLK, CLK / STY, STY, CDC как киназа 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601951 MGI: 107403 ГомолоГен: 101535 Генные карты: CLK1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q33.1 Начните 200,853,009 бп[1] Конец 200,864,744 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 C1.3 | 1 29.09 см Начните 58,410,189 бп[2] Конец 58,424,066 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • протеин-серин / треонин / тирозинкиназная активность • активность протеин-серин / треонинкиназы • активность протеинкиназы • активность протеинтирозинкиназы • немембранная активность протеинтирозинкиназы • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ • киназная активность Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки Биологический процесс • аутофосфорилирование • фосфорилирование пептидилтирозина • регуляция сплайсинга РНК • фосфорилирование белков • клеточная пролиферация • фосфорилирование пептидил-треонина • фосфорилирование пептидил-серина • фосфорилирование Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	1195	12747
Ансамбль	ENSG00000013441	ENSMUSG00000026034
UniProt	P49759	P22518
RefSeq (мРНК)	NM_001024646 NM_001162407 NM_004071	NM_001042634 NM_009905
RefSeq (белок)	NP_001155879 NP_004062	NP_001036099
Расположение (UCSC)	Chr 2: 200,85 - 200,86 Мб	Chr 1: 58.41 - 58.42 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Протеинкиназа двойной специфичности CLK1 является фермент что у людей кодируется CLK1 ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства CDC2-подобных (или LAMMER) протеинкиназы двойной специфичности. в ядро клетки, кодируемые белковые фосфорилаты серин /аргинин -богатые белки, участвующие в процессинге пре-мРНК, высвобождая их в нуклеоплазма. Выбор сайтов сплайсинга во время процессинга пре-мРНК может регулироваться концентрацией трансактирующих факторов, включая белки, богатые серином / аргинином. Следовательно, кодируемый белок может играть косвенную роль в управлении выбором сайта сплайсинга.^[6]

Взаимодействия

CLK1 был показан взаимодействовать с участием ASF / SF2.^[7][8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000013441 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026034 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Talmadge CB, Finkernagel S, Sumegi J, Sciorra L, Rabinow L (декабрь 1998 г.). «Хромосомное картирование трех генов, кодирующих протеинкиназу LAMMER человека». Hum Genet. 103 (4): 523–4. Дои:10.1007 / s004390050861. PMID  9856501. S2CID  40593571.
6. «Ген Entrez: CDC-подобная киназа 1 CLK1».
7. Колвилл К., Фэн Л.Л., Йикли Дж. М., Гиш Г. Д., Касерес Дж. Ф., Поусон Т., Фу XD (октябрь 1996 г.). «Протеинкиназы SRPK1 и Clk / Sty демонстрируют различные субстратные специфичности для факторов сплайсинга, богатых серином / аргинином». J. Biol. Chem. 271 (40): 24569–75. Дои:10.1074 / jbc.271.40.24569. PMID  8798720.
8. Умехара Х., Нишии Ю., Моришима М., Какехи Ю., Киока Н., Амачи Т., Коидзуми Дж., Хагивара М., Уэда К. (февраль 2003 г.). «Влияние лечения цисплатином на пятнистое распределение богатого серином / аргинином ядерного белка CROP / Luc7A». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 301 (2): 324–9. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 03017-6. PMID  12565863.

внешние ссылки

• Человек CLK1 расположение генома и CLK1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Джонсон К.В., Смит К.А. (1991). «Молекулярное клонирование новой человеческой cdc2 / CDC28-подобной протеинкиназы». J. Biol. Chem. 266 (6): 3402–7. PMID  1704889.
• Бен-Дэвид Y, Летвин К., Таннок Л., Бернштейн А., Поусон Т. (1991). «Протеинкиназа млекопитающих с потенциалом фосфорилирования серина / треонина и тирозина связана с регуляторами клеточного цикла». EMBO J. 10 (2): 317–25. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1991.tb07952.x. ЧВК  452648. PMID  1825055.
• Ханес Дж, фон дер Каммер Х, Клаудины Дж, Шайт К.Х. (1995). «Характеристика путем клонирования кДНК двух новых протеинкиназ человека. Доказательства путем сравнения последовательностей нового семейства протеинкиназ млекопитающих». J. Mol. Биол. 244 (5): 665–72. Дои:10.1006 / jmbi.1994.1763. PMID  7990150.
• Колвилл К., Поусон Т., Эндрюс Б., Прасад Дж., Мэнли Дж. Л., Белл Дж. К., Дункан П. И. (1996). «Протеинкиназа Clk / Sty фосфорилирует факторы сплайсинга SR и регулирует их внутриядерное распределение». EMBO J. 15 (2): 265–75. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00357.x. ЧВК  449941. PMID  8617202.
• Колвилл К., Фэн Л.Л., Йикли Дж. М., Гиш Г. Д., Касерес Дж. Ф., Поусон Т., Фу XD (1996). «Протеинкиназы SRPK1 и Clk / Sty демонстрируют различные субстратные специфичности для факторов сплайсинга, богатых серином / аргинином». J. Biol. Chem. 271 (40): 24569–75. Дои:10.1074 / jbc.271.40.24569. PMID  8798720.
• Нестель Ф.П., Колвилл К., Харпер С., Поусон Т., Андерсон С.К. (1997). «RS циклофилины: идентификация циклофилина, родственного NK-TR1». Ген. 180 (1–2): 151–5. Дои:10.1016 / S0378-1119 (96) 00436-2. PMID  8973360.
• Moeslein FM, Myers MP, Landreth GE (1999). «Киназы семейства CLK, CLK1 и CLK2, фосфорилируют и активируют тирозинфосфатазу, PTP-1B». J. Biol. Chem. 274 (38): 26697–704. Дои:10.1074 / jbc.274.38.26697. PMID  10480872.
• Menegay HJ, Myers MP, Moeslein FM, Landreth GE (2000). «Биохимическая характеристика и локализация киназы двойной специфичности CLK1». J. Cell Sci. 113 (18): 3241–53. PMID  10954422.
• Кодзима Т., Зама Т., Вада К., Оноги Х., Хагивара М. (2001). «Клонирование человеческого PRP4 обнаруживает взаимодействие с Clk1». J. Biol. Chem. 276 (34): 32247–56. Дои:10.1074 / jbc.M103790200. PMID  11418604.
• Хартманн А.М., Руджеску Д., Джаннакурос Т., Николакаки Э., Годерт М., Мандельков Е.М., Гао К.С., Андредис А., Штамм С. (2001). «Регулирование альтернативного сплайсинга экзона 10 человеческого тау путем фосфорилирования факторов сплайсинга». Мол. Cell. Неврологи. 18 (1): 80–90. Дои:10.1006 / mcne.2001.1000. PMID  11461155. S2CID  18388526.
• Лай М.С., Линь Р.И., Тарн В.Й. (2003). «Дифференциальные эффекты гиперфосфорилирования на фактор сплайсинга SRp55». Biochem. J. 371 (Pt 3): 937–45. Дои:10.1042 / BJ20021827. ЧВК  1223332. PMID  12549978.
• Умехара Х., Нишии Ю., Моришима М., Какехи Ю., Киока Н., Амачи Т., Коидзуми Дж., Хагивара М., Уэда К. (2003). «Влияние лечения цисплатином на пятнистое распределение богатого серином / аргинином ядерного белка CROP / Luc7A». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 301 (2): 324–9. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 03017-6. PMID  12565863.
• Кантам Л., Керр-Бейлс Л., Годд Н., Квик М., Уэбб Р., Сандерленд Т., Бонд Дж., Уолдер К., Огерт Дж., Кольер Г. (2003). «Beacon взаимодействует с cdc2 / cdc28-подобными киназами». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 304 (1): 125–9. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 00549-7. PMID  12705895.
• Прасад Дж., Мэнли Дж. Л. (2003). «Регулирование и субстратная специфичность протеинкиназы SR Clk / Sty». Мол. Cell. Биол. 23 (12): 4139–49. Дои:10.1128 / MCB.23.12.4139-4149.2003. ЧВК  156123. PMID  12773558.
• Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). «Недооцененная роль надзора за РНК». Геном Биол. 5 (2): R8. Дои:10.1186 / gb-2004-5-2-r8. ЧВК  395752. PMID  14759258.
• Мураки М., Окавара Б., Хосоя Т., Оноги Х., Коидзуми Дж., Коидзуми Т., Суми К., Йомода Дж., Мюррей М.В., Кимура Х., Фуруичи К., Сибуя Х., Крайнер А.Р., Судзуки М., Хагивара М. (2004). «Манипуляции альтернативным сплайсингом с помощью недавно разработанного ингибитора Clks». J. Biol. Chem. 279 (23): 24246–54. Дои:10.1074 / jbc.M314298200. PMID  15010457.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Веласкес-Донес А., Хагопиан Дж. К., Ма CT, Чжун XY, Чжоу Х., Гош Г., Фу XD, Адамс Дж. А. (2006). «Масс-спектрометрический и кинетический анализ фосфорилирования ASF / SF2 с помощью SRPK1 и Clk / Sty». J. Biol. Chem. 280 (50): 41761–8. Дои:10.1074 / jbc.M504156200. PMID  16223727.