CIB1 - CIB1

CIB1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1ДГУ, 1DGV, 1XO5, 1Y1A, 2L4H, 2L4I, 2LM5
Идентификаторы
Псевдонимы	CIB1, CIB, CIBP, KIP1, PRKDCIP, SIP2-28, связывание кальция и интегрина 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602293 MGI: 1344418 ГомолоГен: 4654 Генные карты: CIB1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q26.1 Начните 90,229,975 бп[1] Конец 90,234,047 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 D2 Начните 80,227,147 бп[2] Конец 80,232,813 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность ингибитора протеин-серин / треонинкиназы • связывание ионов кальция • якорь белковой мембраны • связывание ионного канала • Связывание Ras GTPase • связывание ионов металлов • связывание с С-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками • активность ингибитора кальций-зависимой протеинкиназы • связывание протеинкиназы Сотовый компонент • цитоплазма • везикул • аппарат Гольджи • проекция клетки • центросома • мембрана • конус роста • клеточная мембрана • нуклеоплазма • центр организации микротрубочек • мембрана с оборками • аксон • кончик филоподия • дендрит • тело нейрональной клетки • апикальная плазматическая мембрана • эндоплазматический ретикулум • перинуклеарная область цитоплазмы • проекция нейрона • сарколемма • внеклеточная экзосома • цитоскелет • ядро клетки • периферия клетки • ламеллиподиум Биологический процесс • отрицательная регуляция фосфорилирования белков • положительное регулирование нацеливания белков на мембрану • тромбопоэтин-опосредованный сигнальный путь • отрицательная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B • дифференциация клеток • клеточный ответ на стимул фактора роста нервов • положительная регуляция фосфорилирования белков • негативная регуляция развития проекции нейронов • регуляция деления клеток • положительное регулирование миграции клеток, участвующих в прорастании ангиогенеза • внешний апоптотический сигнальный путь • положительное регулирование адгезии клеточного матрикса • положительное регулирование миграции клеток • клеточный ответ на стимул фактора роста • клеточный ответ на фактор некроза опухоли • образование тромбоцитов • отрицательная регуляция апоптотического процесса • отрицательная регуляция дифференцировки мегакариоцитов • положительная регуляция активности протеин-серин / треонинкиназы • положительная регуляция сигнального каскада кальциневрин-NFAT • деление клеток • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • отрицательная регуляция деполимеризации микротрубочек • положительная регуляция распространения клеток, зависящих от адгезии субстрата • положительное регулирование роста клеток • ответ на ишемию • клеточная адгезия • регулирование пролиферации клеток • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • восстановление двухниточного разрыва • ангиогенез • сперматогенез • положительное регулирование пролиферации клеток • развитие сперматид • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • организация цитоплазматических микротрубочек • эндомитотический клеточный цикл • клеточный цикл • положительная регуляция клеточной адгезии, опосредованная интегрином • положительное регулирование пролиферации мужских половых клеток • отрицательное регулирование пролиферации клеток • апоптотический процесс • GO: 0048554 положительное регулирование каталитической активности • отрицательная регуляция активности протеинкиназы • отрицательная регуляция активности протеин-серин / треонинкиназы • положительное регулирование локализации белка в плазматической мембране Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10519	23991
Ансамбль	ENSG00000185043	ENSMUSG00000030538
UniProt	Q99828	Q9Z0F4
RefSeq (мРНК)	NM_001277764 NM_006384	NM_001291275 NM_001291276 NM_011870
RefSeq (белок)	NP_001264693 NP_006375	NP_001278204 NP_001278205 NP_036000
Расположение (UCSC)	Chr 15: 90.23 - 90.23 Мб	Chr 7: 80.23 - 80.23 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Кальций и интегрин-связывающий белок 1 это белок что у людей кодируется CIB1 ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, является членом кальций-связывающий белок семья. Специфическая функция этого белка еще не определена; однако известно, что этот белок взаимодействует с ДНК-зависимыми протеинкиназа и может играть роль в киназа-фосфатаза регулирование Соединение концов ДНК. Этот белок также взаимодействует с интегрином альфа (IIb) бета (3), что может указывать на этот белок как регуляторную молекулу для альфа (IIb) бета (3).^[7]

Взаимодействия

CIB1 показал себя взаимодействовать с участием RAC3,^[8] PSEN2,^[9] ДНК-PKcs,^[10] УБР5^[11] и CD61.^[5]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000185043 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030538 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Naik UP, Patel PM, Parise LV (апрель 1997 г.). «Идентификация нового связывающего кальций белка, который взаимодействует с цитоплазматическим доменом интегрина альфаIIb». J Biol Chem. 272 (8): 4651–4. Дои:10.1074 / jbc.272.8.4651. PMID  9030514.
6. Хаттори А., Секи Н., Хаяси А., Кодзума С., Сайто Т. (август 2000 г.). «Геномная структура генов мыши и человека для белка, взаимодействующего с ДНК-PKcs (KIP)». ДНК Seq. 10 (6): 415–8. Дои:10.3109/10425170009015612. PMID  10826701.
7. «Ген Entrez: связывание кальция и интегрина CIB1 1 (кальмирин)».
8. Хаатая, Лина; Каартинен Веса; Гроффен Джон; Heisterkamp Nora (март 2002 г.). «Малая GTPase Rac3 взаимодействует с интегрин-связывающим белком CIB и способствует адгезии и распространению, опосредованным интегрином альфа (IIb) бета (3)». J. Biol. Chem. 277 (10): 8321–8. Дои:10.1074 / jbc.M105363200. ISSN  0021-9258. PMID  11756406.
9. Stabler, S M; Островский Л Л; Яницки С. М.; Монтейро М. Дж. (Июнь 1999 г.). «Миристоилированный кальций-связывающий белок, который предпочтительно взаимодействует с белком пресенилина 2, вызываемым болезнью Альцгеймера». J. Cell Biol. 145 (6): 1277–92. Дои:10.1083 / jcb.145.6.1277. ISSN  0021-9525. ЧВК  2133148. PMID  10366599.
10. Ву, Х; Либер М. Р. (октябрь 1997 г.). «Взаимодействие между ДНК-зависимой протеинкиназой и новым белком, KIP». Мутат. Res. 385 (1): 13–20. Дои:10.1016 / s0921-8777 (97) 00035-9. ISSN  0027-5107. PMID  9372844.
11. Хендерсон, Мишель Дж; Рассел Аманда Дж; Хирд Саманта; Муньос Марсия; Клэнси Дженнифер Л; Lehrbach Gillian M; Calanni Sophina T; Янс Дэвид А; Сазерленд Роберт Л; Уоттс Колин К. В. (июль 2002 г.). «EDD, белок гиперпластических дисков человека, играет роль в коактивации рецептора прогестерона и потенциальном участии в ответе на повреждение ДНК». J. Biol. Chem. 277 (29): 26468–78. Дои:10.1074 / jbc.M203527200. ISSN  0021-9258. PMID  12011095.

дальнейшее чтение

• Ву X, Либер MR (1997). «Взаимодействие между ДНК-зависимой протеинкиназой и новым белком, KIP». Мутат. Res. 385 (1): 13–20. Дои:10.1016 / s0921-8777 (97) 00035-9. PMID  9372844.
• Секи Н., Хаяси А., Абэ М. и др. (1999). «Хромосомное определение гена белка, взаимодействующего с ДНК-PKcs (KIP) человека на хромосоме 15q25.3-q26.1 с помощью соматического гибридного анализа и флуоресцентной гибридизации in situ». J. Hum. Genet. 43 (4): 275–7. Дои:10.1007 / с100380050089. PMID  9852683.
• Стейблер С.М., Островски Л.Л., Яницки С.М., Монтейро М.Дж. (1999). «Миристоилированный кальций-связывающий белок, который предпочтительно взаимодействует с белком пресенилина 2, вызываемым болезнью Альцгеймера». J. Cell Biol. 145 (6): 1277–92. Дои:10.1083 / jcb.145.6.1277. ЧВК  2133148. PMID  10366599.
• Каузельманн Г., Вейлер М., Вульф П. и др. (1999). «Поло-подобные протеинкиназы Fnk и Snk связываются с Ca (2 +) - и интегрин-связывающим белком и регулируются динамически с синаптической пластичностью». EMBO J. 18 (20): 5528–39. Дои:10.1093 / emboj / 18.20.5528. ЧВК  1171621. PMID  10523297.
• Хван PM, Фогель HJ (2000). «Структуры тромбоцитов, связывающего кальций и интегрин, и цитоплазматического домена альфа IIb-интегрина предполагают механизм распознавания, регулируемого кальцием; моделирование гомологии и исследования ЯМР». J. Mol. Признать. 13 (2): 83–92. Дои:10.1002 / (SICI) 1099-1352 (200003/04) 13: 2 <83 :: AID-JMR491> 3.0.CO; 2-A. PMID  10822252.
• Holtrich U, Wolf G, Yuan J, et al. (2000). «Вызванная адгезией экспрессия серин / треонинкиназы Fnk в макрофагах человека». Онкоген. 19 (42): 4832–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1203845. PMID  11039900.
• Haataja L, Kaartinen V, Groffen J, Heisterkamp N (2002). «Малая GTPase Rac3 взаимодействует с интегрин-связывающим белком CIB и способствует адгезии и распространению, опосредованным интегрином альфа (IIb) бета (3)». J. Biol. Chem. 277 (10): 8321–8. Дои:10.1074 / jbc.M105363200. PMID  11756406.
• Уайтхаус С., Чемберс Дж., Хоу К. и др. (2002). «NBR1 взаимодействует с белком фасцикуляции и удлинения zeta-1 (FEZ1) и белком, связывающим кальций и интегрин (CIB), и демонстрирует ограниченную в развитии экспрессию в нервной трубке». Евро. J. Biochem. 269 (2): 538–45. Дои:10.1046 / j.0014-2956.2001.02681.x. PMID  11856312.
• Холленбах А.Д., Макферсон С.Дж., Лагутина И., Гросвельд Г. (2002). «Кальмирин, связывающий кальций, белок EF-hand, ингибирует транскрипционную и ДНК-связывающую активность Pax3». Биохим. Биофиз. Acta. 1574 (3): 321–8. Дои:10.1016 / s0167-4781 (02) 00230-0. PMID  11997098.
• Хендерсон М.Дж., Рассел А.Дж., Хирд С. и др. (2002). «EDD, белок гиперпластических дисков человека, играет роль в коактивации рецептора прогестерона и потенциальном участии в ответе на повреждение ДНК». J. Biol. Chem. 277 (29): 26468–78. Дои:10.1074 / jbc.M203527200. PMID  12011095.
• Барри В.Т., Будиньон-Прудон С., Шок Д.Д. и др. (2002). «Молекулярная основа связывания CIB с цитоплазматическим доменом интегрина альфа IIb». J. Biol. Chem. 277 (32): 28877–83. Дои:10.1074 / jbc.M202983200. PMID  12023286.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ма С., Лю М.А., Юань Ю.Л., Эриксон Р.Л. (2003). «Индуцируемая сывороткой протеинкиназа Snk представляет собой поло-подобную киназу фазы G1, которая ингибируется кальций- и интегрин-связывающим белком CIB». Мол. Рак Res. 1 (5): 376–84. PMID  12651910.
• Наик УП, Наик МУ (2003). «Ассоциация CIB с GPIIb / IIIa во время передачи сигналов извне внутрь необходима для распространения тромбоцитов на фибриноген». Кровь. 102 (4): 1355–62. Дои:10.1182 / кровь-2003-02-0591. PMID  12714504.
• Наик М.У., Наик Ю.П. (2004). «Кальций- и интегрин-связывающий белок регулирует активность киназы фокальной адгезии во время распространения тромбоцитов на иммобилизованном фибриногене». Кровь. 102 (10): 3629–36. Дои:10.1182 / кровь-2003-05-1703. PMID  12881299.
• Ямнюк А.П., Нгуен Л.Т., Хоанг Т.Т., Фогель Х.Дж. (2004). «Свойства связывания ионов металлов и конформационные состояния кальций- и интегрин-связывающих белков». Биохимия. 43 (9): 2558–68. Дои:10.1021 / bi035432b. PMID  14992593.
• Ли GE, Yu EY, Cho CH и др. (2004). «Белок KIP, взаимодействующий с каталитической субъединицей ДНК-протеинкиназы, связывает теломеразу, взаимодействуя с обратной транскриптазой теломеразы человека». J. Biol. Chem. 279 (33): 34750–5. Дои:10.1074 / jbc.M401843200. PMID  15190070.
• Ленер Б, Сандерсон CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК  442147. PMID  15231747.

внешние ссылки

• Человек CIB1 расположение генома и CIB1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.