CHST10 - CHST10

CHST10
Идентификаторы
Псевдонимы	CHST10, HNK-1ST, HNK1ST, карбогидрат сульфотрансфераза 10
Внешние идентификаторы	OMIM: 606376 MGI: 2138283 ГомолоГен: 21013 Генные карты: CHST10
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q11.2 Начинать 100,391,860 бп[1] Конец 100,417,668 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 млрд Начинать 38,863,867 бп[2] Конец 38,898,161 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • сульфотрансферазная активность • Активность сульфотрансферазы HNK-1 Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • Мембрана Гольджи • аппарат Гольджи • мембрана Биологический процесс • клеточная адгезия • процесс биосинтеза углеводов • углеводный обмен • процесс биосинтеза протеогликана Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9486	98388
Ансамбль	ENSG00000115526	ENSMUSG00000026080
UniProt	O43529	Q6PGK7
RefSeq (мРНК)	NM_004854	NM_145142 NM_001368780
RefSeq (белок)	NP_004845	NP_660124 NP_001355709
Расположение (UCSC)	Chr 2: 100,39 - 100,42 Мб	Chr 1: 38.86 - 38.9 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Углеводная сульфотрансфераза 10 является фермент что у людей кодируется CHST10 ген.^[5][6]

Поверхность клетки углеводы модулируют различные клеточные функции и обычно синтезируются поэтапно. HNK1ST играет роль в биосинтез HNK1 (см. MIM 151290), нейронально экспрессируемого углевода, который содержит сульфоглюкуронил остаток. [поставляется OMIM]^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115526 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026080 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Канг Х.Г., Эверс М.Р., Ся Джи, Баензигер Ю.Ю., Шахнер М. (сентябрь 2002 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика хондроитин-4-O-сульфотрансферазы-3. Новый член семейства сульфотрансфераз HNK-1». J Biol Chem. 277 (38): 34766–72. Дои:10.1074 / jbc.M204907200. PMID  12080076.
6. «Энтрез Ген: углевод сульфотрансфераза 10 CHST10».

внешняя ссылка

• Человек CHST10 расположение генома и CHST10 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Онг Э., Йе Дж. К., Динг И и др. (1999). «Структура и функция сульфотрансферазы HNK-1. Идентификация донорных и акцепторных сайтов связывания с помощью сайт-направленного мутагенеза». J. Biol. Chem. 274 (36): 25608–12. Дои:10.1074 / jbc.274.36.25608. PMID  10464296.
• Онг Э., Йе Дж. К., Динг И и др. (1998). «Экспрессионное клонирование человеческой сульфотрансферазы, которая направляет синтез гликана HNK-1 на молекулу адгезии нервных клеток и гликолипиды». J. Biol. Chem. 273 (9): 5190–5. Дои:10.1074 / jbc.273.9.5190. PMID  9478973.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Shilatifard A, Merkle RK, Helland DE и др. (1993). «N-связанные олигосахариды сложного типа gp120 из вируса иммунодефицита человека типа 1 содержат сульфатированный N-ацетилглюкозамин». Дж. Вирол. 67 (2): 943–52. Дои:10.1128 / JVI.67.2.943-952.1993. ЧВК  237448. PMID  8419650.
• Бернштейн HB, Compans RW (1992). «Сульфатирование гликопротеина оболочки вируса иммунодефицита человека». Дж. Вирол. 66 (12): 6953–9. Дои:10.1128 / JVI.66.12.6953-6959.1992. ЧВК  240329. PMID  1433500.