CFAP47 - CFAP47

CFAP47, или же реснички и жгутики ассоциированный белок 47, представляет собой ген человека, кодируемый на Х-хромосоме.[1] в людях. CXorf59 расположен на хромосоме X в локусе Xp21.1 генома человека.

Протеин

CXorf59 наиболее известен как белок 47, ассоциированный с ресничками и жгутиками (CFAP47) у других видов.

Ген

CFAP47 представляет собой белок из 3187 аминокислот, который имеет семь вариантов сплайсинга и содержит 64 экзона.[1] Genecard перечислил псевдонимы для CXorf59 как Cilia and Flagella Associated Protein 47 (CFAP47), Кальпонин Гомологический домен-содержащий белок 2 (CHDC2), FLJ3660, CXorf22 и CXorf30[2]

Ортологи и паралоги

Ортологи были обнаружены у млекопитающих, авов, рептилий, амфибий, остеихтисов; sarcopterygii и actinopterygii, ascidiacea, брюхоногие моллюски, головоногие моллюски, инсекты и демоспонгии. В геноме человека нет паралогов.

Выражение

Гипотетическая структура белка CFAP47, произведенного I-Tasser.

CXorf59 - это ген, кодирующий белок, экспрессия которого подтверждена в 27 различных тканях. Печень, яички, щитовидная железа, мозг и эндометрий были выше в считывании на килобазу транскрипта (RPKM).[1] Хотя этот ген связан с ресничками и жгутиками, в настоящее время нет доступной функциональной информации об этом белке.[1] CXorf59 также родственен кальпонину, связывающему кальций белку. В области от 324 до 403 пар оснований имеется домен гомологии кальпонина.[3] Домены гомологии кальпонина находятся в цитоскелет и преобразование сигнала белки. Они состоят из четырех альфа-спиралей и связываются с актином.

Рекомендации

  1. ^ а б c d «Открытая рамка считывания хромосомы X 59». NCBI.
  2. ^ "Ген CFAP47". genecards.org/.
  3. ^ Коренбаум, Э .; Риверо, Ф. (2002). "Домены гомологии кальпонина с первого взгляда". Журнал клеточной науки. 115 (18): 3543–3545. Дои:10.1242 / jcs.00003. PMID  12186940.