CDC42EP3 - CDC42EP3

CDC42EP3
Идентификаторы
Псевдонимы	CDC42EP3, BORG2, CEP3, UB1, CDC42 эффекторный белок 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 606133 MGI: 2384718 ГомолоГен: 4708 Генные карты: CDC42EP3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п22.2 Начните 37,641,882 бп[1] Конец 37,738,468 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 E3 Начните 79,333,727 бп[2] Конец 79,355,091 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание GTP-Rho • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase • связывание регуляторных белков цитоскелета • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • цитоскелет • мембрана • эндомембранная система • актиновый цитоскелет • клеточная мембрана Биологический процесс • положительная регуляция сборки псевдоподия • положительное регулирование полимеризации актиновых филаментов • Передача сигнала белка Rho • преобразование сигнала • регулировка формы клеток • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10602	260409
Ансамбль	ENSG00000163171	ENSMUSG00000036533
UniProt	Q9UKI2	Q9CQC5
RefSeq (мРНК)	NM_001270436 NM_001270437 NM_001270438 NM_006449 NM_001371569 NM_001371570	NM_026514
RefSeq (белок)	NP_001257365 NP_001257366 NP_001257367 NP_006440 NP_001358498 NP_001358499	NP_080790
Расположение (UCSC)	Chr 2: 37,64 - 37,74 Мб	Chr 17: 79.33 - 79.36 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Cdc42 эффекторный белок 3 это белок что у людей кодируется CDC42EP3 ген.^[5][6][7]

CDC42, малая ГТФаза Rho, регулирует образование структур, содержащих F-актин, посредством взаимодействия с нижележащими эффекторными белками. Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства эффекторных белков CDC42 Borg. Белки семейства Borg содержат домен CRIB (интерактивно-связывающий Cdc42 / Rac). Они связываются и негативно регулируют функцию CDC42. Этот белок может взаимодействовать с CDC42, а также с геном семейства гомологов ras, членом Q (ARHQ / TC10). Было показано, что экспрессия этого белка в фибробластах вызывает образование псевдоподий.^[7]

Взаимодействия

CDC42EP3 показал, что взаимодействовать с участием CDC42^[5][8] и RHOQ.^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163171 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000036533 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Альбертс А.С., Букен Н., Джонстон Л.Х., Трейсман Р. (май 1998 г.). «Анализ RhoA-связывающих белков выявляет домен взаимодействия, законсервированный в бета-субъединицах гетеротримерного G-белка и регуляторном белке дрожжевого ответа Skn7». J Biol Chem. 273 (15): 8616–22. Дои:10.1074 / jbc.273.15.8616. PMID  9535835.
6. Хирш Д.С., Пироне Д.М., Бурбело П.Д. (март 2001 г.). «Новое семейство эффекторных белков Cdc42, CEP, функционирует в фибробластах и ​​изменениях формы эпителиальных клеток». J Biol Chem. 276 (2): 875–83. Дои:10.1074 / jbc.M007039200. PMID  11035016.
7. «Ген Entrez: CDC42EP3 CDC42 эффекторный белок (связывание Rho GTPase) 3».
8. Джоберти, G; Perlungher R R; Macara I G (октябрь 1999 г.). «Борги, новое семейство белков, взаимодействующих с ГТФазой Cdc42 и TC10». Мол. Cell. Биол. 19 (10): 6585–97. Дои:10.1128 / MCB.19.10.6585. ISSN  0270-7306. ЧВК  84628. PMID  10490598.

внешние ссылки

• Человек CDC42EP3 расположение генома и CDC42EP3 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Джоберти Г., Перлунгер Р. Р., Макара И. Г. (2000). «Борги, новое семейство белков, взаимодействующих с ГТФазой Cdc42 и TC10». Мол. Cell. Биол. 19 (10): 6585–97. Дои:10.1128 / MCB.19.10.6585. ЧВК  84628. PMID  10490598.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Джоберти Г., Перлунгер Р. Р., Шеффилд П. Дж. И др. (2001). «Белки Borg контролируют организацию септина и негативно регулируются Cdc42». Nat. Cell Biol. 3 (10): 861–6. Дои:10.1038 / ncb1001-861. PMID  11584266. S2CID  58805.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Мол. Cell. Протеомика. 3 (11): 1093–101. Дои:10.1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID  15345747.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Hillier LW, Graves TA, Fulton RS и др. (2005). «Создание и аннотирование последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Природа. 434 (7034): 724–31. Bibcode:2005Натура.434..724H. Дои:10.1038 / природа03466. PMID  15815621.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Ячейка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070. S2CID  8235923.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.