CDC40 - CDC40

CDC40
Идентификаторы
Псевдонимы	CDC40, EHB3, PRP17, PRPF17, цикл клеточного деления 40
Внешние идентификаторы	OMIM: 605585 MGI: 1918963 ГомолоГен: 5716 Генные карты: CDC40
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q21 Начните 110,180,141 бп[1] Конец 110,254,275 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 B1 Начните 40,831,621 бп[2] Конец 40,883,311 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • каталитическая стадия 2 сплайсосомы • сплайсосомальный комплекс • нуклеоплазма • ядро клетки • Каталитическая сплайсосома 2-го типа U2 • ядерное пятнышко Биологический процесс • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • прекращение транскрипции РНК-полимеразы II • обработка мРНК • экспорт мРНК из ядра • Обработка 3'-конца мРНК • Сплайсинг РНК • Экспорт РНК из ядра Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	51362	71713
Ансамбль	ENSG00000168438	ENSMUSG00000038446
UniProt	O60508	Q9DC48
RefSeq (мРНК)	NM_015891	NM_027879
RefSeq (белок)	NP_056975	NP_082155
Расположение (UCSC)	Chr 6: 110.18 - 110.25 Мб	Chr 10: 40,83 - 40,88 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор пре-мРНК-процессинга 17 это белок что у людей кодируется CDC40 ген.^[5][6][7]

Сплайсинг пре-мРНК происходит в двух последовательных переэтерификация шаги. Было обнаружено, что белок, кодируемый этим геном, необходим для каталитической стадии II в пре-мРНК процесс сращивания. Он находится в сплайсосома, и содержит семь повторов WD, которые участвуют во взаимодействиях белок-белок. Этот белок имеет сходство последовательности с дрожжевым белком Prp17, который функционирует в двух различных клеточных процессах: сплайсинг пре-мРНК и прогрессирование клеточного цикла. Это предполагает, что этот белок может играть роль в развитии клеточного цикла.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000168438 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038446 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Бен Иегуда С., Дикс I, Рассел С.С., Леви С., Беггс Д.Д., Купец М. (октябрь 1998 г.). «Идентификация и функциональный анализ hPRP17, человеческого гомолога дрожжевого гена PRP17 / CDC40, участвующего в сплайсинге и контроле клеточного цикла». РНК. 4 (10): 1304–12. Дои:10.1017 / S1355838298980712. ЧВК  1369702. PMID  9769104.
6. Линдси Л.А., Гарсия-Бланко Массачусетс (январь 1999 г.). «Функциональная консервация человеческого гомолога дрожжевого фактора сплайсинга пре-мРНК Prp17p». J Biol Chem. 273 (49): 32771–5. Дои:10.1074 / jbc.273.49.32771. PMID  9830021.
7. «Ген Entrez: гомолог клеточного цикла деления 40 CDC40 (S. cerevisiae)».

внешняя ссылка

• Человек CDC40 расположение генома и CDC40 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Вонг В.Т., Шумахер С., Сальчини А.Е. и др. (1995). «Белок-связывающий домен, EH, идентифицированный в субстрате рецепторной тирозинкиназы Eps15 и сохраненный в процессе эволюции». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (21): 9530–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.9530 Вт. Дои:10.1073 / пнас.92.21.9530. ЧВК  40835. PMID  7568168.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Сальчини А.Е., Конфалониери С., Дориа М. и др. (1997). «Специфичность связывания и мишени in vivo для домена EH, новый модуль межбелкового взаимодействия». Genes Dev. 11 (17): 2239–49. Дои:10.1101 / gad.11.17.2239. ЧВК  275390. PMID  9303539.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Чжоу З., Рид Р. (1998). «Человеческие гомологи дрожжевых prp16 и prp17 демонстрируют сохранение механизма каталитического этапа II сплайсинга пре-мРНК». EMBO J. 17 (7): 2095–106. Дои:10.1093 / emboj / 17.7.2095. ЧВК  1170554. PMID  9524131.
• Бен-Иегуда С., Дикс I, Рассел С.С. и др. (2001). «Генетические и физические взаимодействия между факторами, участвующими как в развитии клеточного цикла, так и в сплайсинге пре-мРНК у Saccharomyces cerevisiae». Генетика. 156 (4): 1503–17. ЧВК  1461362. PMID  11102353.
• Юрица М.С., Ликлидер Л.Дж., Гиги С.Р. и др. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, пригодных для трехмерного структурного анализа». РНК. 8 (4): 426–39. Дои:10.1017 / S1355838202021088. ЧВК  1370266. PMID  11991638.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Барриос-Родилес М., Браун К.Р., Оздамар Б. и др. (2005). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Bibcode:2005Научный ... 307.1621B. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID  15761153. S2CID  39457788.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.