CCNDBP1 - CCNDBP1

CCNDBP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3AY5
Идентификаторы
Псевдонимы	CCNDBP1, DIP1, GCIP, HHM, циклин D1 связывающий белок 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 607089 MGI: 109595 ГомолоГен: 7826 Генные карты: CCNDBP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q15.2 Начинать 43,185,118 бп[1] Конец 43,197,177 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 E5 | 2 60,37 см Начинать 121,008,403 бп[2] Конец 121,016,904 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • ядро клетки • цитоплазма • нуклеоплазма Биологический процесс • регулирование клеточного цикла • клеточный цикл Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23582	17151
Ансамбль	ENSG00000166946	ENSMUSG00000023572
UniProt	O95273	Q3TVC7
RefSeq (мРНК)	NM_012142 NM_037370	NM_010761 NM_001355127
RefSeq (белок)	NP_036274	NP_034891 NP_001342056
Расположение (UCSC)	Chr 15: 43.19 - 43,2 Мб	Chr 2: 121.01 - 121.02 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Циклин-D1-связывающий белок 1 это белок что у людей кодируется CCNDBP1 ген.^[5][6]

Этот ген был идентифицирован по взаимодействию его генного продукта с Grap2, a лейкоциты -специфический адаптерный белок, важный для передачи сигналов иммунной клетки. Было показано, что белок, кодируемый этим геном, взаимодействует с циклином D. Сообщалось, что трансфекция этого гена в клетках снижает фосфорилирование продукта гена Rb циклин D-зависимой протеинкиназой и ингибирует E2F1-опосредованную активность транскрипции. Было также обнаружено, что этот белок взаимодействует с белком E12 спираль-петля-спираль и считается негативным регулятором специфичных для печени экспрессия гена. Сообщалось о двух альтернативно сплайсированных вариантах, которые кодируют разные изоформы.^[6]

Взаимодействия

CCNDBP1 был показан взаимодействовать с GRAP2^[7] и Циклин D1.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166946 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023572 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ся К., Бао З., Табассам Ф, Ма В., Цю М., Хуа С., Лю М. (август 2000 г.). «GCIP, новый белок, взаимодействующий с grap2 и циклином D человека, регулирует E2F-опосредованную транскрипционную активность». J Biol Chem. 275 (27): 20942–8. Дои:10.1074 / jbc.M002598200. PMID  10801854.
6. «Ген Entrez: CCNDBP1, связывающий белок 1 циклина D-типа».
7. Ся, С; Бао З; Tabassam F; Ma W; Qiu M; Hua S; Лю М. (июль 2000 г.). «GCIP, новый белок, взаимодействующий с grap2 и циклином D человека, регулирует E2F-опосредованную транскрипционную активность». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 275 (27): 20942–8. Дои:10.1074 / jbc.M002598200. ISSN  0021-9258. PMID  10801854.

дальнейшее чтение

• Ма В., Ся Х, Стаффорд Л.Дж. и др. (2006). «Экспрессия GCIP у трансгенных мышей снижает восприимчивость к химическому гепатоканцерогенезу». Онкоген. 25 (30): 4207–16. Дои:10.1038 / sj.onc.1209450. PMID  16501603.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чанг М.С., Чен С.Й., Йе Х.И. и др. (2003). «Клонирование, экспрессия и геномная организация гена mp29 мыши». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 299 (2): 241–6. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02605-0. PMID  12437976.
• Джани О., Авидан Н., Делоне Дж. И др. (2003). «Врожденная дизеритропоэтическая анемия типа I вызвана мутациями в коданине-1». Являюсь. J. Hum. Genet. 71 (6): 1467–74. Дои:10.1086/344781. ЧВК  378595. PMID  12434312.
• Тераи С., Аоки Х., Ашида К., Торгейрссон С.С. (2000). «Человеческий гомолог горничной: доминантный ингибирующий белок спираль-петля-спираль, связанный с экспрессией специфичного для печени гена». Гепатология. 32 (2): 357–66. Дои:10.1053 / jhep.2000.9092. PMID  10915743.
• Ямада С., Иида Т., Табата Т. и др. (2000). «Алкогольная жировая дистрофия печени по-разному индуцирует нейтрофил-хемокин и некроз печени после ишемии-реперфузии у крысы». Гепатология. 32 (2): 278–88. Дои:10.1053 / jhep.2000.9604. PMID  10915734.
• Яо Ю., Доки Ю., Цзян В. и др. (2000). «Клонирование и характеристика DIP1, нового белка, который относится к семейству белков Id». Exp. Cell Res. 257 (1): 22–32. Дои:10.1006 / excr.2000.4884. PMID  10854051.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.

внешняя ссылка

• Человек CCNDBP1 расположение генома и CCNDBP1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.