C2CD4D - C2CD4D
C2CD4D, или же C2 кальций-зависимый домен, содержащий белок 4D белковый продукт человеческий геном. Ген, кодирующий этот белок, находится на хромосоме 1, от 150 076 963 до 150 079 657. Ген содержит 2 экзоны и кодирует 353 аминокислоты. Синонимы слова C2CD4D: «FAM148D».[5] и NP_001129475. C2CD4D содержит консервативный металл-связывающий домен, известный как Консервативная область 2 протеинкиназы C, подгруппа 1. Этот мотив, как известно, является членом суперсемейства C2, которое присутствует в фосфолипазы, протеинкиназы C и синаптотагмины.[6] Аминокислотная последовательность C2CD4D доступна по адресу [1] До любой посттрансляционной модификации C2CD4D имел молекулярную массу 37,6 кДал.[7] Хотя ученые еще не определили, где C2CD4D функционирует в клетке, C2CD4D предсказал изоэлектрическая точка 11.636, что сильно ограничивает области, в которых он может быть эффективным. Кроме того, C2CD4D не содержит никаких предсказанных трансмембранных доменов или каких-либо предсказанных сигнальных пептидов.
Выражение
Согласно Национальный центр биотехнологической информации, C2CD4D экспрессируется только у взрослых людей с некоторой формой рак.[8] C2CD4D не экспрессируется повсеместно, и до сих пор ученые обнаружили, что C2CD4D экспрессируется только в тканях мозга, кишечника и молочной железы.
Эволюционное сохранение
Известно 52 ортолога C2CD4D у млекопитающих,[9] встречается как минимум у 10 видов, включая Пан троглодиты, Орниторинчус анатинус, и Sus scrofa. Всего у этих 10 видов имеется 38 полностью консервативных остатков, что соответствует 10,76% сохранности. У позвоночных сохранность остается высокой и составляет 33 остатка, что соответствует 9,3%. Однако, за исключением позвоночных, сохранность снижается максимум до 1,98%, или до 3 остатков.[10]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000225556 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000091648 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «C2 кальций-зависимый домен, содержащий белок 4D [Homo sapiens] - белок - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov.
- ^ NCBI https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=119477
- ^ Верстак, NCSA Biology. "SDSC Biology Workbench". workbench.sdsc.edu.
- ^ Национальный центр биотехнологической информации
- ^ "NCBI Blast:". blast.ncbi.nlm.nih.gov.
- ^ данные выравнивания, определенные с помощью инструмента ClustalW, доступного на http://workbench.sdsc.edu и соответствующие результаты ортологов, полученные в результате быстрого поиска с помощью инструмента, доступного на http://blast.ncbi.nlm.nih.gov