C1QBP - C1QBP

C1QBP
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1П32, 3RPX
Идентификаторы
Псевдонимы	C1QBP, GHABP1, SF2p32, gC1Q-R, gC1qR, p32, компонент комплемента 1, q субкомпонентный белок, связывающий белок комплемента C1q, COXPD33, SF2AP32
Внешние идентификаторы	OMIM: 601269 MGI: 1194505 ГомолоГен: 31023 Генные карты: C1QBP
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17p13.2 Начните 5,432,777 бп[1] Конец 5,448,830 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 B4 | 11 43,21 см Начните 70,977,836 бп[2] Конец 70,983,026 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • связывание фактора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • связывание гиалуроновой кислоты • связывание кининогена • связывание митохондриальных рибосом • связывание мРНК • связывание протеинкиназы C • связывание компонента комплемента C1q • связывание адренергических рецепторов • активность активатора перевода Сотовый компонент • цитозоль • внеклеточная область • поверхность клетки • митохондриальный матрикс • ядрышко • цитоплазма • мембрана • митохондрия • ядро клетки • внеклеточный • клеточная мембрана • пресинаптическая активная зона • пресинапс • глутаматергический синапс • ГАМК-ергический синапс Биологический процесс • свертывание крови, внутренний путь • положительная регуляция митохондриальной трансляции • отрицательная регуляция выработки гамма-интерферона • положительная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B • отрицательная регуляция сигнального пути MDA-5 • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • адаптивный иммунный ответ • биогенез рибосом • отрицательная регуляция защитной реакции на вирус • иммунная система • обработка мРНК • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция миграции клеток трофобласта • положительная регуляция распространения клеток, зависящих от адгезии субстрата • сборка зрелых рибосом • отрицательная регуляция сплайсинга мРНК через сплайсосомы • иммунная реакция • Сплайсинг РНК • положительная регуляция хемотаксиса нейтрофилов • классический путь комплемента • положительная регуляция апоптотического процесса • передача сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы • врожденная иммунная система • GO: 0022415 вирусный процесс • положительная регуляция хемотаксиса дендритных клеток • регуляция активации комплемента • отрицательная регуляция сигнального пути RIG-I • положительная регуляция клеточной адгезии • отрицательная регуляция продукции интерлейкина-12 • апоптотический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	708	12261
Ансамбль	ENSG00000108561	ENSMUSG00000018446
UniProt	Q07021	O35658 Q8R5L1
RefSeq (мРНК)	NM_001212	NM_007573
RefSeq (белок)	NP_001203	NP_031599
Расположение (UCSC)	Chr 17: 5.43 - 5.45 Мб	Chr 11: 70.98 - 70.98 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Компонент комплемента 1 Q субкомпонент-связывающий белок, митохондриальный это белок что у людей кодируется C1QBP ген.^[5][6][7]

Субкомпонент человеческого комплемента C1q связывается с C1r и C1s, чтобы получить первый компонент сывороточной системы комплемента. Белок, кодируемый этим геном, как известно, связывается с глобулярными головками молекул C1q и ингибирует активацию C1. Этот белок также был идентифицирован как субъединица p32 пре-мРНК фактора сплайсинга SF2, а также как субъединица p32. гиалуроновая кислота -связывающий белок.^[7]

Белковая субъединица

C1QBP - 282 аминокислота в длину и имеет три гомологичных подразделение со своим N-выводом 73 аминокислота остатки отщепляются с образованием зрелого C1QBP. C1QBP отображается как мономер около 33 кДа на SDS-СТРАНИЦА гель как в восстанавливающих, так и в невосстанавливающих условиях, но мигрирует как тример на эксклюзионная хроматография (гель-фильтрация).^[8]

Белковая структура

В кристалл структура C1QBP при разрешении 2,25 Å показывает гомотримерное кольцо, показывающее симметрия. Отдельные субъединицы удерживаются вместе нековалентными взаимодействиями и образуют пончик в форме четвертичная структура с центральной полостью диаметром 20 Å. Каждая субъединица C1QBP имеет семь β-цепь (β1- β7) и три α-спирали (α1- α3). C1QBP заряжен отрицательно на своей растворимой поверхности, в то время как поверхность мембраны преимущественно заряжена положительно.^[9]

Взаимодействия

C1QBP был показан взаимодействовать с участием Протеинкиназа D1,^[10] BAT2,^[11] PRKCD,^[10] PKC альфа^[10] и Протеинкиназа Mζ.^[10]Другие взаимодействующие партнеры C1QBP включают белковые домены патогенов, таких как бактерии,^[12] вирус ^[13] и плазмодий falciparum.^[14] Было продемонстрировано, что белки плазмы, включая фибриноген, FXII и HK, взаимодействуют с C1QBP цинк-зависимым образом.^[15][16] Недавно было показано, что пептид самонаведения опухоли LyP-1 (CGNKRTRGC) избирательно связывается с C1QBP в клетках, экспрессирующих опухоль.^[17]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108561 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018446 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Деб ТБ, Датта К. (март 1996 г.). «Молекулярное клонирование белка, связывающего гиалуроновую кислоту фибробластов человека, подтверждает его идентичность с P-32, белком, очищенным совместно с фактором сплайсинга SF2. Белок, связывающий гиалуроновую кислоту, как белок P-32, очищенный совместно с фактором сплайсинга SF2». J Biol Chem. 271 (4): 2206–12. Дои:10.1074 / jbc.271.4.2206. PMID  8567680.
6. Гебрехивет Б., Лим Б.Л., Першке Е.И., Уиллис А.С., Рид К.Б. (июнь 1994 г.). «Выделение, клонирование кДНК и сверхэкспрессия гликопротеина клеточной поверхности массой 33 кДа, который связывается с глобулярными« головками »C1q». J Exp Med. 179 (6): 1809–21. Дои:10.1084 / jem.179.6.1809. ЧВК  2191527. PMID  8195709.
7. «Ген Entrez: компонент комплемента 1 C1QBP, q субкомпонент связывающий белок».
8. Цзян, Цзяньчжун (1999). «Кристаллическая структура человеческого p32, кислого белка митохондриального матрикса в форме пончика». PNAS. 96 (7): 3572–3577. Bibcode:1999PNAS ... 96.3572J. Дои:10.1073 / пнас.96.7.3572. ЧВК  22335. PMID  10097078.
9. Цзян, Цзяньчжун (1999). «Кристаллическая структура человеческого p32, кислого белка митохондриального матрикса в форме пончика». PNAS. 96 (7): 3572–3577. Bibcode:1999PNAS ... 96.3572J. Дои:10.1073 / пнас.96.7.3572. ЧВК  22335. PMID  10097078.
10. Storz, P; Hausser A; Link G; Dedio J; Ghebrehiwet B; Pfizenmaier K; Йоханнес Ф. Дж. (Август 2000 г.). «Протеинкиназа C [микро] регулируется многофункциональным белком-шапероном p32». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 275 (32): 24601–7. Дои:10.1074 / jbc.M002964200. ISSN  0021-9258. PMID  10831594.
11. Ленер, Бен; Семпл Дженнифер I; Браун Стефани Э; Советник Дамиан; Кэмпбелл Р. Дункан; Сандерсон Кристофер М. (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной двугибридной дрожжевой системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика. Соединенные Штаты. 83 (1): 153–67. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. ISSN  0888-7543. PMID  14667819.
12. Браун, Лоуренс; Гебрехивет, Берхане; Коссарт, Паскаль (2000). «gC1q-R / p32, C1q-связывающий белок, представляет собой рецептор инвазионного белка InlB Listeria monocytogenes». Журнал EMBO. 19 (7): 1458–1466. Дои:10.1093 / emboj / 19.7.1458. ЧВК  310215. PMID  10747014.
13. Киттлесен, Дэвид Дж .; Chianese-Bullock, Kimberly A .; Яо, Чжи Q; Braciale, Thomas J .; Хан, Янг С. (2000). «Взаимодействие между рецептором комплемента gC1qR и коровым белком вируса гепатита С подавляет пролиферацию Т-лимфоцитов». J Clin Invest. 106 (10): 1239–1249. Дои:10.1172 / jci10323. ЧВК  381434. PMID  11086025.
14. Магальон-Техада, Ариэль (2016). «Цитоадгезия к gC1qR через мембранный белок 1 эритроцитов Plasmodium falciparum при тяжелой малярии». PLOS Pathog. 12 (11): e1006011. Дои:10.1371 / journal.ppat.1006011. ЧВК  5106025. PMID  27835682.
15. Патхак, Моника; Kaira, Bubacarr G .; Слейтер, Александр; Эмсли, Джонас (2018). «Взаимодействие клеточных рецепторов и кофакторов контактной системы активации и фактора XI». Границы медицины. 5: 66. Дои:10.3389 / fmed.2018.00066. ЧВК  5871670. PMID  29619369.
16. Peerschke, EI; Bayer, AS; Ghebrehiwet, B; Xiong, YQ (2006). «Блокада gC1qR / p33 снижает колонизацию Staphylococcus aureus в тканях-мишенях в модели инфекционного эндокардита на животных». Заразить иммунную. 74 (8): 4418–4423. Дои:10.1128 / iai.01794-05. ЧВК  1539591. PMID  16861627.
17. Паасонен, Лаури; Шарма, Светлана; Браун, Гэри Б.; Kotamraju, Venkata R .; Чанг, Томас Д.Ю .; Она, Чжиган; Сугахара, Кадзуки Н.; Yliperttula, Marjo; Ву, Байнань; Пеллеккья, Маурицио; Руослахти, Эркки; Тисалу, Тамбет (2017). «Новые лиганды p32 / gC1qR для адресной доставки лекарств от опухолей». ChemBioChem. 17 (7): 570–575. Дои:10.1002 / cbic.201500564. ЧВК  5433940. PMID  26895508.

дальнейшее чтение

• Крайнер А.Р., Майеда А., Козак Д., Биннс Г. (1991). «Функциональная экспрессия клонированного человеческого фактора сплайсинга SF2: гомология с РНК-связывающими белками, U1 70K и регуляторами сплайсинга Drosophila». Ячейка. 66 (2): 383–94. Дои:10.1016 / 0092-8674 (91) 90627-Б. PMID  1830244. S2CID  24119556.
• Басби Т.Ф., Ингхэм К.С. (1990). «NH2-концевой кальций-связывающий домен человеческого комплемента C1s- опосредует взаимодействие C1r- с C1q». Биохимия. 29 (19): 4613–8. Дои:10.1021 / bi00471a016. PMID  2372546.
• Фриделл Р.А., Хардинг Л.С., Богерд Л.С., Каллен Б.Р. (1995). «Идентификация нового белка цинкового пальца человека, который специфически взаимодействует с доменом активации лентивирусных белков Tat». Вирусология. 209 (2): 347–57. Дои:10.1006 / viro.1995.1266. PMID  7778269.
• Ло Й, Ю Х, Петерлин Б.М. (1994). «Клеточный белок модулирует действие вируса иммунодефицита человека 1 типа Rev». Дж. Вирол. 68 (6): 3850–6. Дои:10.1128 / JVI.68.6.3850-3856.1994. ЧВК  236890. PMID  8189522.
• Оноре Б., Мадсен П., Расмуссен Х. Х. и др. (1994). «Клонирование и экспрессия кДНК, покрывающей полную кодирующую область субъединицы P32 человеческого фактора сплайсинга пре-мРНК SF2». Ген. 134 (2): 283–7. Дои:10.1016 / 0378-1119 (93) 90108-Ф. PMID  8262387.
• Танге Т.О., Дженсен Т.Х., Кьемс Дж. (1996). «Взаимодействие in vitro между белком Rev вируса иммунодефицита человека типа 1 и белком, ассоциированным с фактором сплайсинга, ASF / SF2, p32». J. Biol. Chem. 271 (17): 10066–72. Дои:10.1074 / jbc.271.17.10066. PMID  8626563.
• Гуо Н., Веремович С., Линч Н. и др. (1997). «Отнесение C1QBP, кодирующего белок, связывающий глобулярный домен C1q (gC1q-R), с полосой р13.3 хромосомы 17 человека путем гибридизации in situ». Cytogenet. Cell Genet. 77 (3–4): 283–4. Дои:10.1159/000134598. PMID  9284938.
• Маджумдар М, Датта К. (1998). «Отнесение кДНК, кодирующей связывающий гиалуроновую кислоту белок 1, хромосоме 17p12-p13 человека». Геномика. 51 (3): 476–7. Дои:10.1006 / geno.1998.5364. PMID  9721222.
• Petersen-Mahrt SK, Estmer C, Ohrmalm C и др. (1999). «Белок, связанный с фактором сплайсинга, p32, регулирует сплайсинг РНК, ингибируя связывание и фосфорилирование РНК ASF / SF2». EMBO J. 18 (4): 1014–24. Дои:10.1093 / emboj / 18.4.1014. ЧВК  1171193. PMID  10022843.
• Цзян Дж, Чжан И, Крайнер А.Р., Сюй Р.М. (1999). «Кристаллическая структура человеческого p32, кислого белка митохондриального матрикса в форме пончика». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (7): 3572–7. Bibcode:1999PNAS ... 96.3572J. Дои:10.1073 / пнас.96.7.3572. ЧВК  22335. PMID  10097078.
• Браун Л., Гебрехивет Б., Коссарт П. (2000). «gC1q-R / p32, C1q-связывающий белок, представляет собой рецептор для белка инвазии InlB Listeria monocytogenes». EMBO J. 19 (7): 1458–66. Дои:10.1093 / emboj / 19.7.1458. ЧВК  310215. PMID  10747014.
• Beatch MD, Hobman TC (2000). «Капсид вируса краснухи связывается с белком p32 клетки-хозяина и локализуется в митохондриях». Дж. Вирол. 74 (12): 5569–76. Дои:10.1128 / JVI.74.12.5569-5576.2000. ЧВК  112044. PMID  10823864.
• Сторц П., Хауссер А., Линк Г. и др. (2000). «Протеинкиназа C [микро] регулируется многофункциональным белком-шапероном p32». J. Biol. Chem. 275 (32): 24601–7. Дои:10.1074 / jbc.M002964200. PMID  10831594.
• Тай А.Дж., Гебрехивет Б., Го Н. и др. (2001). «Ген gC1qR / p32 человека, C1qBP. Геномная организация и анализ промотора». J. Biol. Chem. 276 (20): 17069–75. Дои:10.1074 / jbc.M009064200. PMID  11278463.
• Шерер М.Т., Канненберг К., Хунцикер П. и др. (2001). «Взаимодействие между бета-субъединицами рецептора ГАМК (А) и многофункциональным белком gC1q-R». J. Biol. Chem. 276 (28): 26597–604. Дои:10.1074 / jbc.M102534200. PMID  11350968.
• Кобаяси М., Ханай Р. (2001). «Специфическая для фазы M ассоциация топоизомеразы IIIbeta человека с хромосомами». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 287 (1): 282–7. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5580. PMID  11549288.
• Розанов Д.В., Гебрехивет Б., Постнова Т.И. и др. (2002). «Гемопексин-подобный С-концевой домен матричной металлопротеиназы мембранного типа 1 регулирует протеолиз многофункционального белка gC1qR». J. Biol. Chem. 277 (11): 9318–25. Дои:10.1074 / jbc.M110711200. PMID  11773076.
• Маджумдар М., Минакши Дж., Госвами С.К., Датта К. (2002). «Гиалуронансвязывающий белок 1 (HABP1) / C1QBP / p32 представляет собой эндогенный субстрат для MAP-киназы и перемещается в ядро ​​при митогенной стимуляции». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 291 (4): 829–37. Дои:10.1006 / bbrc.2002.6491. PMID  11866440.

внешние ссылки

• Человек C1QBP расположение генома и C1QBP страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.