Вирус желтой карликовости ячменя 5UTR - Barley yellow dwarf virus 5UTR

Вирус желтого карлика ячменя 5 'UTR
BYDV SS.png
Сохранено вторичная структура БЫДВ 5 'УТР.
Идентификаторы
СимволBYDV 5'UTR
РфамRF01508
Прочие данные
РНК типцис-регуляторный элемент
Домен (ы)ячмень желтый карлик
PDB структурыPDBe

Вирус желтого карлика ячменя 5 'UTR это некодирующая РНК элемент, содержащий структурные элементы, необходимые для перевод вирусного генома.

В отличие от эукариотическая мРНК, у этого вируса отсутствует Крышка 5 футов и поли (А) хвост но по-прежнему циркулирует свою мРНК за счет спаривания оснований между двумя стержневые петли, один расположен в 5 'UTR, а другой в пределах 3 'UTR. Структура внутри 3 'UTR ранее характеризовалась как 3' независимый от шапки элемент перевода (3 'TE элемент) и 5' UTR ячмень желтый карлик Предполагается, что вирус содержит 4 структуры петли стебля.[1] Мутагенез показали, что петля 4 ствола важна для спаривания оснований с 3'TE и только 5 оснований необходимы для спаривания оснований для возникновения циркуляризации мРНК.[2]

Рекомендации

  1. ^ Ван С., Браунинг К.С., Миллер В.А. (июль 1997 г.). «Вирусная последовательность в 3'-нетранслируемой области имитирует 5'-кэп, облегчая трансляцию не кэпированной мРНК». Журнал EMBO (Бесплатный полный текст). 16 (13): 4107–4116. Дои:10.1093 / emboj / 16.13.4107. ЧВК  1170033. PMID  9233819.
  2. ^ Го Л., Аллен Э.М., Миллер В.А. (май 2001 г.). «Спаривание оснований между нетранслируемыми областями облегчает трансляцию неполиаденилированной вирусной РНК». Молекулярная клетка. 7 (5): 1103–1109. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00252-0. PMID  11389856.

дальнейшее чтение

Малис Н., Маккарти Дж. Э. (март 2011 г.). «Инициирование перевода: можно ожидать вариаций в механизме». Клеточные и молекулярные науки о жизни. 68 (6): 991–1003. Дои:10.1007 / s00018-010-0588-z. PMID  21076851.

внешняя ссылка