BacMet - BacMet
| Содержание | |
|---|---|
| Типы данных захвачен | Устойчивость к противомикробным препаратам гены и фенотипы |
| Организмы | Бактерии |
| Контакт | |
| Исследовательский центр | Гетеборгский университет |
| Основное цитирование | PMID 24304895 |
| Доступ | |
| Интернет сайт | бакмет |
| Скачать URL | Скачать |
| Разное | |
| Закладки сущности | да |
BacMet является устойчивость к противомикробным препаратам база данных. Он отслеживает бактериальные гены которые придают устойчивость к антибактериальным биоцидам и металлы.[1]
BacMet состоит из двух внутренних баз данных. Одна представляет собой вручную созданную базу данных генов с экспериментально подтвержденной функцией устойчивости, а другая база данных рассматривает предсказанные гены устойчивости. Данные первого собраны из NCBI, а аннотации взяты из UniProt и генная онтология.[2] BacMet предоставляет информацию о резистентных генах, их последовательностях и молекулярных функциях.
База данных содержит более 700 подтвержденных генов и более 150 000 предсказанных генов, которые организованы по молекулярным функциям и устойчивым фенотипам. По состоянию на 2019 год[Обновить], BacMet последний раз обновлялся в марте 2018 г. и основан на Гетеборгский университет в Швеции.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ Pal, C .; Bengtsson-Palme, J .; Rensing, C .; Kristiansson, E .; Ларссон, Д. Г. (2014). «BacMet: база данных генов антибактериальных биоцидов и устойчивости к металлам». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Проблема с базой данных) (Проблема с базой данных): D737 – D743. Дои:10.1093 / nar / gkt1252. ЧВК 3965030. PMID 24304895.
- ^ Blake, J. A .; и другие. (2013). «Аннотации и ресурсы генной онтологии». Исследования нуклеиновых кислот. 41 (Проблема с базой данных) (Проблема с базой данных): D530 – D535. Дои:10.1093 / нар / гкс1050. ЧВК 3531070. PMID 23161678.