BCAS2 - BCAS2

BCAS2
Идентификаторы
Псевдонимы	BCAS2, DAM1, SPF27, Snt309, амплифицированная последовательность 2 карциномы груди, фактор процессинга пре-мРНК, фактор процессинга пре-мРНК BCAS2
Внешние идентификаторы	OMIM: 605783 MGI: 1915433 ГомолоГен: 4291 Генные карты: BCAS2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п13.2 Начинать 114,567,557 бп[1] Конец 114,581,629 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 F2.2 Начинать 103,171,655 бп[2] Конец 103,179,166 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • Комплекс фактора репликации ДНК А • каталитическая стадия 2 сплайсосомы • сплайсосомальный комплекс • ядрышко • прекаталитическая сплайсосома • Прп19 комплекс • нуклеоплазма • ядро клетки • центросома • ядерное пятнышко • Каталитическая сплайсосома 2-го типа U2 Биологический процесс • Сплайсинг РНК посредством реакций переэтерификации • обработка мРНК • Сплайсинг РНК • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10286	68183
Ансамбль	ENSG00000116752	ENSMUSG00000005687
UniProt	O75934	Q9D287
RefSeq (мРНК)	NM_005872	NM_026602 NM_001356330 NM_001356331
RefSeq (белок)	NP_005863	NP_080878 NP_001343259 NP_001343260
Расположение (UCSC)	Chr 1: 114,57 - 114,58 Мб	Chr 3: 103.17 - 103.18 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор пре-мРНК-сплайсинга SPF27 это белок что у людей кодируется BCAS2 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000116752 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005687 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нойбауэр Г., Кинг А., Раппсилбер Дж., Кальвио С., Уотсон М., Аджу П., Слиман Дж., Ламонд А., Манн М. (октябрь 1998 г.). «Масс-спектрометрия и поиск в базе данных EST позволяют охарактеризовать мультибелковый сплайсосомный комплекс». Нат Жене. 20 (1): 46–50. Дои:10.1038/1700. PMID  9731529.
6. Нагасаки К., Маасс Н., Манабе Т., Ханзава Х., Цукада Т., Кикучи К., Ямагути К. (август 1999 г.). «Идентификация нового гена, DAM1, амплифицированного в области хромосомы 1p13.3-21 в клеточных линиях рака груди человека». Рак Lett. 140 (1–2): 219–26. Дои:10.1016 / S0304-3835 (99) 00091-9. PMID  10403562.
7. «Ген Entrez: последовательность 2 амплифицированной карциномы молочной железы BCAS2».

дальнейшее чтение

• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.
• Ци С., Чжу Ю.Т., Чанг Дж. И др. (2005). «Усиление транскрипционной активности рецептора эстрогена за счет амплифицированной последовательности 2 рака груди». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 328 (2): 393–8. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.12.187. PMID  15694360.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Scherl A, Couté Y, Déon C и др. (2003). «Функциональный протеомный анализ ядрышка человека». Мол. Биол. Клетка. 13 (11): 4100–9. Дои:10.1091 / mbc.E02-05-0271. ЧВК  133617. PMID  12429849.
• Ли С., Ха С, Чунг М. и др. (2003). «Мышиный DAM1 регулирует проапоптотическую активность BLK в эпителиальных клетках молочных желез». Рак Lett. 188 (1–2): 121–6. Дои:10.1016 / S0304-3835 (02) 00055-1. PMID  12406557.
• Маасс Н., Розель Ф., Схема C и др. (2002). «Амплификация гена BCAS2 на хромосоме 1p13.3-21 при первичном раке груди человека». Рак Lett. 185 (2): 219–23. Дои:10.1016 / S0304-3835 (02) 00286-0. PMID  12169396.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.

внешняя ссылка

• BCAS2 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• BCAS2 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.