Ассоциация объектов биомолекулярных ресурсов - Association of Biomolecular Resource Facilities
Формирование | 1989 |
---|---|
Штаб-квартира | Лексингтон, Кентукки |
Место расположения | |
Членство | 1000 (март 2020 г.) |
Официальный язык | английский |
Президент | Ричард Коул |
Интернет сайт | http://www.abrf.org/ |
В Ассоциация объектов биомолекулярных ресурсов (ABRF) посвящена развитию основных и исследовательских биотехнологических лабораторий посредством исследований, общения и образования.[1] В члены ABRF входят более 1000 ученых, представляющих 340 различных основных лабораторий в 41 стране, в том числе в промышленных, государственных, академических и исследовательских учреждениях.
История
В 1986 г. было проведено сателлитное совещание по исследовательским ресурсам в связи с Шестой международной конференцией по методам анализа последовательности белков.[нужна цитата ] В следующем году секвенирование белков и образцы аминокислот были отправлены на обследование 103 основных объектов. К 1989 году ABRF был официально организован и зарегистрирован. Каждый год ежегодное собрание проводилось как вспомогательное собрание Белкового общества до 1996 года, когда начались отдельные собрания.[2]
Исследовательские группы ABRF
Исследовательские группы созданы для достижения двух целей Ассоциации биомолекулярных ресурсов. Во-первых, предоставить механизмы для самооценки и повышения процедурной и оперативной точности, точности и эффективности в ресурсных учреждениях и исследовательских лабораториях. Во-вторых, внести свой вклад в обучение сотрудников ресурсных учреждений и исследовательских лабораторий, пользователей, администраторов и заинтересованных членов научного сообщества.[3] Результаты исследований ABRF Research Group опубликованы в научных статьях.[4][5][6] Результаты исследований ABRF Research Group были повторно использованы в других исследованиях.[7][8][9]
- ABRF Next Generation Sequencing Group (ABRF-NGS)
- Технология антител Исследовательская группа (ARG)
- Биомедицинская исследовательская группа Omics (BORG)
- Секвенирование ДНК Исследовательская группа (DSRG)
- Проточной цитометрии Исследовательская группа (FCRG)
- Геномика Исследовательская группа (GVRG)
- Гликопротеин Исследовательская группа (gPRG)
- Световая микроскопия Исследовательская группа (LMRG)
- Метаболомика Исследовательская группа (MRG)
- Метагеномика Исследовательская группа (MGRG)
- Молекулярные взаимодействия Исследовательская группа (MIRG)
- Нуклеиновые кислоты Исследовательская группа (NARG)
- Экспрессия белка Исследовательская группа (PERG)
- Секвенирование белков Исследовательская группа (PSRG)
- Протеомика Исследовательская группа (PRG)
- Протеомная информатика Исследовательская группа (iPRG)
- Группа исследования стандартов протеомики (sPRG)
Ресурсные технологии
Члены ABRF вовлечены в широкий спектр биомолекулярных технологий, которые реализуются на основных объектах:
- Автоматизация: высокопроизводительный грохот, LIMS, робототехника.
- Химия белков / пептидов: аминокислотный анализ, N- и C-концевое секвенирование, синтез пептидов, массивы пептидов / белков.
- Биофизика: калориметрия, CD, флуоресценция, рассеяние света, SPR, ультрацентрифугирование.
- Проточной цитометрии Сортировка клеток, активирующая флуоресценцию
- Экспрессия белка, Идентификация и профилирование: дифференциальная флуоресценция, стандартная двухмерная гель-электрофорез, открытие биомаркера болезни.
- Экспрессия гена и профилирование: массивы генов, в реальном времени ПЦР.
- Масс-спектрометрии: качественный, количественный и структурный анализ белков, углеводы, олигонуклеотиды, и липиды.
- Микроскопия световая микроскопия и визуализация, Конфокальная микроскопия
- Нуклеиновая кислота Химия: Секвенирование ДНК, Синтез ДНК, Синтез РНК, генотипирование.
- Разделения: 1- и 2-D СТРАНИЦА, капиллярный электрофорез, хроматография.
- Контроль качества: GLP, GMP, качество и соответствие.
- Универсальный протеомный стандарт (UPS), смесь белков, используемых в качестве эталонного стандарта в протеомике, представленная вышеупомянутым sPRG.[10] Он включает в себя два набора: исходный (UPS1, где все 48 белков находятся в 48 пмоль) и динамический диапазон концентраций (называемый UPS2) от 500 до 50 пмоль.[11]
- Другой: биоинформатика, углевод анализ, дифференциальный дисплей, рекомбинантный белок производство.
Ежегодная конференция
Ежегодно ежегодная конференция Ассоциации объектов биомолекулярных ресурсов проводится весной в разных городах Северной Америки. Эта международная конференция используется для ознакомления участников с новыми и развивающимися биотехнологиями посредством лекций, круглых столов, презентаций исследовательских групп, стендовых сессий, семинаров и технических выставок.
- ABRF 2022, 27–30 марта 2022 г., Палм-Спрингс, Калифорния
- ABRF 2021, 7–10 марта 2021 г., Бостон, Массачусетс
- ABRF 2020, 29 февраля - 3 марта 2020 г., Палм-Спрингс, Калифорния
- ABRF 2019, 23–26 марта, Сан Антонио, Техас; 30 лет преодоления ограничений науки и технологий, открывая двери в будущее
- ABRF 2018, 22–25 апреля, Миртл-Бич, Южная Каролина; Премьер-конференция по основным услугам
- ABRF 2017, 25–28 марта, Сан Диего, Калифорния; Форум по продвижению современных основных технологий для внедрения инноваций завтрашнего дня
- ABRF 2016, 20–23 февраля, Ft. Lauderdale, Флорида; Инновационные технологии, ускоряющие открытия
- ABRF 2015, 28–31 марта, Святой Луи, Штат Миссури; Интеграционные технологии для развития научных ядер
- ABRF 2014, 23–25 марта, Альбукерке, Нью-Мексико; Командная наука и большие данные: ядра на передовой
- ABRF 2013, 2–5 марта, Палм-Спрингс, Калифорния; Инструменты для развития науки о конвергенции
- ABRF 2012, 17–20 марта, Орландо, Флорида; Учимся на биомолекулах
- ABRF 2011, 19–22 февраля, Сан-Антонио, Техас; Технологии для создания персонализированной медицины
- ABRF 2010, 20–23 марта, Сакраменто, Калифорния; Перевод фундаментальных исследований с достижениями биомолекулярных технологий
- ABRF 2009, 7–10 февраля, Мемфис, Теннесси; Применение и оптимизация существующих и новых биотехнологий
- ABRF 2008, 9–12 февраля, Солт-Лейк-Сити, Юта; Разрешающие технологии в науках о жизни
- ABRF 2007, 31 марта - 3 апреля, Тампа, Флорида; Создание биологической дорожной карты
- ABRF 2006, 11–14 февраля, Лонг-Бич, Калифорния; Интеграция науки, инструментов и технологий с системной биологией
- ABRF 2005, 5–8 февраля, Саванна, Джорджия; Биомолекулярные технологии: от открытия к гипотезе
- ABRF 2004, 28 февраля - 2 марта, Портленд, Орегон; Интеграция технологий в протеомику и геномику
- ABRF 2003, 10–13 февраля, Денвер, Колорадо; Перевод биологии с помощью протеомики и функциональной геномики
- ABRF 2002, 9–12 марта, Остин, Техас; Биомолекулярные технологии: инструменты для открытий в протеомике и геномике
- ABRF 2001, 24–27 февраля, Сан-Диего, Калифорния; Новая биология: технология для разрешения макромолекулярных коммуникаций
- ABRF 2000, 19–22 февраля, Белвью, Вашингтон; От единичного к глобальному анализу биологических систем
- ABRF 1999, 19–22 марта, Дарем, Северная Каролина; Биоинформатика и биомолекулярные технологии: связывая геномы, протеомы и биохимию
- ABRF 1998, 21–24 марта, Сан-Диего, Калифорния; От геномов к функциям - технические проблемы постгеномной эпохи
- ABRF 1997, 9–12 февраля, Балтимор, Мэриленд; Методы взаимодействия геном-протеом
- ABRF 1996, 30 марта - 2 апреля, Сан-Франциско, Калифорния; Биомолекулярные методы
Премия ABRF
Премия ABRF вручается на ежегодном собрании ABRF за выдающийся вклад в биомолекулярные технологии. Лауреаты прошлых премий:[12]
- 2020 Георгия за новаторские исследования в области геномного секвенирования и лидерство в области генной терапии и технологий синтетической биологии.
- 2019 Ричард М. Каприоли за открытие временной и пространственной обработки в биологических системах с помощью масс-спектрометрии.
- 2018 Амос Байрох для развития общественных ресурсов, таких как База знаний UniProtKB / Swiss-Prot, PROSITE, ENZYME и neXtProt.
- 2017 Сэр Шанкар Баласубраманян и Дэвид Кленерман за изобретение метода секвенирования ДНК следующего поколения, который сегодня широко известен как «секвенирование путем синтеза».
- 2016 Эммануэль Шарпантье и Дженнифер Дудна за разработку технологий редактирования генома CRISPR / Cas9.
- 2015 Джон Г. Уайт и Уильям Брэдшоу Амос за разработку конфокального лазерного сканирующего микроскопа высокого разрешения
- 2014 Патрик Х. О'Фаррелл, для разработки 2-мерного гель-электрофореза.
- 2013 Леонард Герценберг и Леонора Герценберг для разработки метода сортировки клеток с активацией потоком (FACS).
- 2012 Алан Дж. Маршалл за развитие масс-спектрометрии с ионным циклотронным резонансом с преобразованием Фурье (FT-ICR).
- 2011 Сэр Алек Джон Джеффрис: Разработаны методики для Дактилоскопия ДНК и ДНК профилирование
- 2010 Пэт Браун: Новаторская работа в области разработки микроматриц и различных применений этой технологии в генетических исследованиях.
- 2009 Матиас Улен
- 2008 Руэди Эберсольд
- 2007 Дональд Ф. Хант
- 2006 Роджер Цзянь
- 2005 Стивен Фодор
- 2004 Эдвин Южный
- 2003 Франц Хилленкамп и Майкл Карас
- 2002 Джон Фенн
- 2001 Чаба Хорват
- 2000 Лерой Худ
- 1999 Марвин Х. Карутерс за новаторский вклад в химический синтез ДНК и РНК
- 1998 Брюс Меррифилд
- 1997 Ллойд М. Смит
- 1996 Дэвид Липман
- 1995 Клаус Биманн
- 1994 Фредерик Сэнгер
Журнал биомолекулярных методов
ABRF является издателем журнала биомолекулярных методов. Журнал рецензируемый и публикуется ежеквартально.[13] Основное внимание в журнале уделяется публикации научных обзоров и статей, связанных с биомолекулярными ресурсами. Опубликованные исследовательской группой отчеты включают ежегодные опросы. Также включены новости и события, а также обзор статей, посвященных методикам, используемым в типичных условиях основного объекта. Текущий главный редактор - Рон Орландо, Университет Джорджии.
Правление ABRF
- Ричард Коул, президент ABRF, Школа общественного здравоохранения, Государственный университет Нью-Йорка
- Мари Адамс, Институт Ван Андела
- Шридар Читтур, СУНИ Олбани
- Эндрю Читти, Орегонский университет здоровья и науки
- Кевин Кнудтсон, Отдел геномики, Университет Айовы
- Кристиан Литл, казначей, Дартмутский колледж
- Клавдий Мундома, Университет штата Флорида
- Магнус Палмблад, Медицинский центр Лейденского университета
- Кен Шоппманн, исполнительный директор ABRF
Рекомендации
- ^ «Заявление о миссии». Ассоциация объектов биомолекулярных ресурсов. В архиве с оригинала на 1 апреля 2019 г.. Получено 4 марта 2020.
- ^ Крабб, JW: "ABRF; Краткая история" ABRF News, июнь 1995 г.
- ^ «Рекомендации исследовательской группы» (PDF). Ассоциация биомолекулярных ресурсов. Архивировано из оригинал (PDF) 31 января 2012 г.. Получено 15 апреля 2009.
- ^ Чой, Мина; Eren-Dogu, Zeynep F .; Коланджело, Кристофер; Коттрелл, Джон; Hoopmann, Michael R .; Капп, Юджин А .; Ким, Сангтае; Лам, Генри; Neubert, Thomas A .; Пальмблад, Магнус; Phinney, Brett S .; Weintraub, Susan T .; Маклин, Брендан; Витек, Ольга (2017). "Исследование ABRF Proteome Informatics Research Group (iPRG) 2015: Обнаружение дифференциально обильных белков в безметочных количественных экспериментах ЖХ-МС / МС". Журнал протеомных исследований. 16 (2): 945–957. Дои:10.1021 / acs.jproteome.6b00881. PMID 27990823.
- ^ Chalkley, Роберт Дж .; Бандейра, Нуно; Чемберс, Мэтью С .; Clauser, Karl R .; Коттрелл, Джон С .; Deutsch, Eric W .; Капп, Юджин А .; Lam, Генри Х. Н .; Макдональд, У. Хейс; Neubert, Thomas A .; Сунь, Жуй-Сян (2014). «Исследовательская группа по протеомной информатике (iPRG) _2012: исследование по обнаружению модифицированных пептидов в сложной смеси». Молекулярная и клеточная протеомика. 13 (1): 360–371. Дои:10.1074 / mcp.M113.032813. ЧВК 3879627. PMID 24187338. Получено 5 ноября 2018.
- ^ Bennett, Keiryn L .; Ван, Ся; Bystrom, Cory E .; Чемберс, Мэтью С .; Andacht, Tracy M .; Данготт, Ларри Дж .; Эльорца, Феликс; Лешик, Джон; Молина, Хенрик; Мориц, Роберт Л .; Phinney, Brett S .; Томпсон, Дж. Уилл; Бангер, Морин К .; Табб, Дэвид Л. (2015). «Исследование группы протеомных исследований ABRF 2012/2013: Оценка продольной внутрилабораторной изменчивости в рутинных анализах тандемной масс-спектрометрии с жидкостной хроматографией на пептидах». Молекулярная и клеточная протеомика. 14 (12): 3299–3309. Дои:10.1074 / mcp.O115.051888. ЧВК 4762617. PMID 26435129. Получено 5 ноября 2018.
- ^ Нгуен, Чунг Хай; Рустенбург, Ариен С .; Krimmer, Stefan G .; Чжан, Хэси; Кларк, Джон Д .; Novick, Paul A .; Брэнсон, Ким; Pande, Vijay S .; Ходера, Джон Д .; Мин, Дэвид Д. Л. (2018). «Байесовский анализ калориметрии изотермического титрования для термодинамики связывания». PLOS One. 13 (9): e0203224. Дои:10.1371 / journal.pone.0203224. ЧВК 6136728. PMID 30212471.
- ^ Мэтью; Эдфорс, Фредрик; Перес-Риверол, Яссет; Payne, Samuel H .; Hoopmann, Michael R .; Пальмблад, Магнус; Форсстрём, Бьёрн; Келл, Лукас (2018). "Стандарт белка, который имитирует гомологию для характеристики алгоритмов вывода белков". Журнал протеомных исследований. 17 (5): 1879–1886. Дои:10.1021 / acs.jproteome.7b00899. ЧВК 6474350. PMID 29631402.
- ^ У Гуаньин; Ван, Сян; Сюй, Баохуа (2018). «Новая оценка уровня ложных открытий на уровне белков». BMC Genomics. 19 (Дополнение 6): 567. Дои:10.1186 / s12864-018-4923-3. ЧВК 6101079. PMID 30367581.
- ^ «Универсальные стандарты протеомики - подтверждая будущее протеомики». Получено 22 августа 2016.
- ^ «Протеомные стандарты UPS1 и UP2». Получено 22 августа 2016.
- ^ «Премия ABRF». Ассоциация объектов биомолекулярных ресурсов. Архивировано из оригинал 30 января 2012 г.. Получено 22 августа 2016.
- ^ "JBT: журнал биомолекулярных методов". Ассоциация объектов биомолекулярных ресурсов. В архиве с оригинала 3 августа 2019 г.. Получено 4 марта 2020.