Мотивы датчиков амфипатической липидной упаковки - Amphipathic lipid packing sensor motifs

Амфипатический Датчик липидной упаковки (ALPS) мотивы были впервые обнаружены в 2005 г. ARFGAP1[1][2] и были рассмотрены.[3][4]

Амфипатические мотивы сенсора липидной упаковки белков ассоциируются с (адсорбировать к) изогнутые липидные бислои.[5]

Изгиб фосфолипид двухслойный, например, в липосома, вызывает нарушения упаковки липидов на той стороне бислоя, которая имеет большую площадь поверхности (например, снаружи липосомы). Менее «упорядоченная» или «более рыхлая» упаковка липидов распознается мотивами ALPS.

Мотивы ALPS от 20 до 40 аминокислота длинные части белки которые имеют важные наборы типов аминокислотных остатков. Громоздкий гидрофобный аминокислотные остатки, такие как Фенилаланин, Лейцин, и Триптофан присутствуют каждые 3 или 4 позиции, причем многие полярный но незаряженные аминокислотные остатки, такие как Глицин, Серин и Треонин между. ALPS не имеет структуры в решении, но складывается как альфа спираль когда они связаны с двойным слоем мембраны, так что гидрофобные остатки вставляются между слабо упакованными липидами, а полярные остатки указывают на водный цитоплазма.

Рекомендации

  1. ^ Бигей Дж., Казелла Дж. Ф., Дрин Дж., Месмин Б., Антонни Б. (июль 2005 г.). «ArfGAP1 реагирует на кривизну мембраны за счет сворачивания мотива сенсорной упаковки липидов». Журнал EMBO. 24 (13): 2244–53. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600714. ЧВК  1173154. PMID  15944734.
  2. ^ Дрин Дж., Казелла Дж. Ф., Готье Р., Бёмер Т., Шварц Т. Ю., Антонни Б. (февраль 2007 г.). «Общий амфипатический альфа-спиральный мотив для определения кривизны мембраны». Структурная и молекулярная биология природы. 14 (2): 138–46. Дои:10.1038 / nsmb1194. PMID  17220896. S2CID  11377393.
  3. ^ Брэдшоу Р.А., Шталь П.Д. (2015). Энциклопедия клеточной биологии (1-е изд.). Кембридж, Массачусетс: Academic Press. п. 206. ISBN  978-0123944474.
  4. ^ Ванни С., Вампарис Л., Готье Р., Дрин Дж., Этчебест С., Фукс П. Ф., Антонни Б. (февраль 2013 г.). «Мотивы сенсора амфипатической липидной упаковки: исследование двухслойных дефектов с помощью гидрофобных остатков». Биофизический журнал. 104 (3): 575–84. Bibcode:2013BpJ ... 104..575В. Дои:10.1016 / j.bpj.2012.11.3837. ЧВК  3566459. PMID  23442908.
  5. ^ Хорчани Х, де Сен-Жан М, Барелли Х, Антонни Б. (2014). «Взаимодействие мотива мембраны-сенсора Spo20 с фосфатидной кислотой и другими анионными липидами и влияние мембранного окружения». PLOS ONE. 9 (11): e113484. Bibcode:2014PLoSO ... 9k3484H. Дои:10.1371 / journal.pone.0113484. ЧВК  4245137. PMID  25426975.