Александр ван Ауденаарден - Alexander van Oudenaarden

Александр ван Ауденаарден
VanOudenaarden2017a.jpg
Александр ван Ауденаарден (2017)
Родившийся (1970-03-19) 19 марта 1970 г. (возраст 50)
Zuidland, Нидерланды
ГражданствоКоролевство Нидерландов
Альма-матерДелфтский технологический университет (Магистр, магистр, доктор философии)
Научная карьера
ПоляБиофизика, Системная биология, Синтетическая биология
УчрежденияHubrecht Institute

Александр ван Ауденаарден (19 марта 1970 г.) биофизик и системный биолог. Он является ведущим исследователем в биология стволовых клеток, специализирующаяся на одноклеточных методах. В 2012 году начал работать директором Hubrecht Institute и дважды был награжден грантом ERC Advanced Grant, в 2012 и 2017 годах. Премия Спинозы в 2017 году.

биография

Ван Ауденаарден родился 19 марта 1970 года в г. Zuidland, небольшой городок в нидерландский язык провинция Южная Голландия. Учился в Делфтский технологический университет, где он получил Магистр степень в области материаловедения и инженерии (с отличием ) и степень магистра физики в 1993 г., а затем кандидат наук степень по физике (с отличием) в 1998 г. по экспериментальной физике конденсированного состояния под руководством профессора J.E. Mooij. Он получил премию Андриса Мидема (лучшая докторская работа в области физики конденсированного состояния в Нидерландах) за диссертацию на тему «Квантовые вихри и квантовые интерференционные эффекты в цепях малых туннельных переходов». В 1998 году переехал в Стэндфордский Университет, где он работал докторантом в отделах биохимии и микробиологии и иммунологии, работая над генерацией силы полимеризующих актиновых филаментов в Териот лаборатории и докторант кафедры химии, работающий над Микрорельеф поддерживаемых двойных слоев фосфолипидов в Боксер лаборатория. В 2000 году он поступил на кафедру физики Массачусетского технологического института в качестве доцента, в 2004 году перешел в штатную должность и сейчас является профессором. В 2001 году получил NSF КАРЬЕРА, и одновременно Научный сотрудник Альфреда Слоана и Кек Развитие карьеры Профессор по развитию карьеры в области биомедицинской инженерии. В 2012 году Александр стал директором Hubrecht Institute как преемник Ганс Клеверс. В 2017 году получил второй Расширенный грант ERCза свое исследование под названием «Подход одноклеточной геномики, объединяющий экспрессию генов, происхождение и физические взаимодействия».

В 2014 году ван Ауденаарден стал членом Королевская Нидерландская академия искусств и наук.[1] В 2017 году он был одним из четырех победителей конкурса Премия Спинозы.[2]

Он женат и у него трое детей.

Работа

Во время его работы в Массачусетском технологическом институте его лаборатория началась с параллельных исследований в актин динамика[3][4]и шум в генных сетях,[5][6][7] а затем сосредоточился на стохастичности в генных сетях[8][9][10][11] биологические сети как системы управления,[12][13][14] и эволюция малых сетей.

Сегодня работа Ван Ауденаарденса в Институте Хубрехта сосредоточена на стохастической экспрессии генов,[15][16] разработка новых инструментов для количественной оценки экспрессии генов в отдельных клетках [17][18] и микроРНК [19][20]

Рекомендации

  1. ^ "Александр ван Ауденаарден". Королевская Нидерландская академия искусств и наук. Архивировано из оригинал 18 сентября 2020 г.
  2. ^ "Проф. Д-р ир. А. (Александр) ван Ауденаарден". Нидерландская организация научных исследований. Архивировано из оригинал 6 ноября 2020 г.
  3. ^ Упадхьяя, А; Chabot, J. R .; Андреева, А .; Самадани, А .; ван Ауденаарден, А. (2003). «Исследование сил полимеризации с помощью липидных пузырьков, движущихся актином». PNAS США. 100 (8): 4521–6. Bibcode:2003ПНАС..100.4521У. Дои:10.1073 / pnas.0837027100. ЧВК  153588. PMID  12657740.
  4. ^ Упадхьяя, А; А. ван Ауденаарден (2003). «Биомиметические системы для изучения актиновой подвижности». Текущая биология. 13 (18): R734–44. Дои:10.1016 / j.cub.2003.08.051. PMID  13678615.
  5. ^ Таттай, М; А. ван Ауденаарден (2001). «Внутренний шум в сетях регуляции генов». PNAS США. 98 (15): 8614–9. Bibcode:2001PNAS ... 98.8614T. Дои:10.1073 / pnas.151588598. ЧВК  37484. PMID  11438714.
  6. ^ Озбудак, Э .; Thattai, M .; Курцер, I .; Гроссман, А.Д .; ван Ауденаарден, А. (2002). «Регулирование шума при экспрессии одного гена». Природа Генетика. 31 (1): 69–73. Дои:10,1038 / ng869. PMID  11967532.
  7. ^ Таттай, М; А. ван Ауденаарден (2002). «Подавление шума в сверхчувствительных сигнальных каскадах». Биофизический журнал. 82 (6): 2943–50. Bibcode:2002BpJ .... 82.2943T. Дои:10.1016 / S0006-3495 (02) 75635-X. ЧВК  1302082. PMID  12023217.
  8. ^ Pedraza, JM; А. ван Ауденаарден (2005). «Распространение шума в генных сетях». Наука. 307 (5717): 1965–9. Bibcode:2005Наука ... 307.1965П. Дои:10.1126 / science.1109090. PMID  15790857.
  9. ^ Becskei, A; Б. Б. Кауфманн; А. ван Ауденаарден (2005). «Вклады низкого числа молекул и хромосомного положения в стохастическую экспрессию генов». Природа Генетика. 37 (9): 937–44. Дои:10,1038 / ng1616. PMID  16086016.
  10. ^ Акар, М; А. Бечкей; А. ван Ауденаарден (2005). «Повышение клеточной памяти за счет уменьшения стохастических переходов». Природа. 435 (7039): 228–32. Bibcode:2005Натура.435..228А. Дои:10.1038 / природа03524. PMID  15889097.
  11. ^ Chabot, JR; Х. М. Педраса; П. Луитель; А. ван Ауденаарден (2007). «Стохастическая экспрессия гена вне стационарного состояния в циркадных часах цианобактерий». Природа. 450 (7173): 1249–52. Bibcode:2007 Натур.450.1249C. Дои:10.1038 / природа06395. PMID  18097413.
  12. ^ Thattai, M; А. Бечкей; А. ван Ауденаарден (2005). «Система противодействия петлям обратной связи регулирует активность Cdc42p во время спонтанной поляризации клеток». Клетка развития. 9 (4): 565–71. Дои:10.1016 / j.devcel.2005.08.014. PMID  16198298.
  13. ^ Цанг, Дж; Дж. Чжу; А. ван Ауденаарден (2007). «Опосредованная микроРНК обратная связь и петли прямой связи являются повторяющимися сетевыми мотивами у млекопитающих». Молекулярная клетка. 26 (5): 753–67. Дои:10.1016 / j.molcel.2007.05.018. ЧВК  2072999. PMID  17560377.
  14. ^ Меттетал, Дж; Д. Муззей; К. Гомес-Урибе; А. ван Ауденаарден (2008). «Частотная зависимость осмоадаптации у Saccharomyces cerevisiae». Наука. 319 (5862): 482–4. Bibcode:2008Научный ... 319..482М. Дои:10.1126 / science.1151582. ЧВК  2916730. PMID  18218902.
  15. ^ Юнкер, Филипп; Александр (2014). «Каждая клетка особенная: исследования в масштабе всего генома добавляют новое измерение в одноклеточную биологию». Клетка. 157 (1): 8–11. Дои:10.1016 / j.cell.2014.02.010. PMID  24679522.
  16. ^ Джи, Ни; Мидделкуоп, Тейе; Mentink, Remco; Бетист, Марко; Тонегава, Сатто; Муиджман, Дилан; Корсваген, Хендрик; Александр (2013). «Контроль обратной связи вариабельности экспрессии генов в пути Wnt Caenorhabditis elegans». Клетка. 155 (4): 869–880. Дои:10.1016 / j.cell.2013.09.060. PMID  24209624.
  17. ^ Грюн, Доминик; Кестер, Леннарт; Александр (2014). «Валидация шумовых моделей для одноклеточной транскриптомики». Методы природы. 11 (6): 637–640. Дои:10.1038 / nmeth.2930. PMID  24747814.
  18. ^ Клемм, Сэнди; Семрау, Стефан; Вибрандс, Кей; Муиджман, Дилан; Фаддах, Дина; Яениш, Рудольф; Александр (2014). «Транскрипционное профилирование клеток, отсортированных по содержанию РНК». Методы природы. 11 (5): 549–551. Дои:10.1038 / nmeth.2910. ЧВК  4174458. PMID  24681693.
  19. ^ Донг; Ким, Доминик Грюн; Александр (2013). «Подавление экспрессионных колебаний за счет синхронной регуляции микроРНК и ее мишени». Природа Генетика. 45 (11): 1337–1344. Дои:10.1038 / ng.2763. ЧВК  3812263. PMID  24036951.
  20. ^ Мукхерджи, Шанкар; Эберт, Маргарет; Чжэн, Грейс; Цанг, Джон; Шарп, Фил; Александр (2011). «МикроРНК могут генерировать пороги экспрессии целевого гена» (PDF). Природа Генетика. 43 (9): 854–859. Дои:10,1038 / нг.905. ЧВК  3163764. PMID  21857679.

внешняя ссылка