Аламетицин - Alamethicin

Аламетицин[1]
Аламетицин.png
Имена
Название ИЮПАК
N-ацетил-2-метилаланил-L-пролил-2-метилаланил-L-аланил-2-метилаланил-L-аланил-L-глутаминил-2-метилаланил-L-валил-2-метилаланилглицил-L-лейцил-2-метилаланил-L-пролил-L-валил-2-метилаланил-2-метилаланил-L-α-глутамил-N1-[(1S) -1-бензил-2-гидроксиэтил] -L-глутамид
Идентификаторы
3D модель (JSmol )
ЧЭМБЛ
ChemSpider
ECHA InfoCard100.121.626 Отредактируйте это в Викиданных
UNII
Характеристики
C92ЧАС150N22О25
Молярная масса1964,31 г / моль
ВнешностьНе совсем белое твердое вещество
Температура плавления От 255 до 270 ° C (от 491 до 518 ° F; от 528 до 543 K)
Нерастворимый
Растворимость в ДМСО, метанол, этиловый спиртРастворимый
Если не указано иное, данные для материалов приведены в их стандартное состояние (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
☒N проверять (что проверитьY☒N ?)
Ссылки на инфобоксы

Аламетицин каналообразующий пептид антибиотик, производимый грибком Trichoderma viride. Это принадлежит пептаибол пептиды, содержащие не протеиногенный аминокислотный остаток Айб (2-аминоизомасляная кислота ). Этот остаток сильно индуцирует образование альфа-спиральный структура. Пептидная последовательность:

Ac-Aib-Pro-Aib-Ala-Aib-Ala-Gln-Aib-Val-Aib-Gly-Leu-Aib-Pro-Val-Aib-Aib-Glu-Gln-Phl

(Ac = ацетил, Phl = фенилаланинол, Aib = 2-аминоизомасляная кислота )

В клеточные мембраны, это образует Напряжение -зависимый ион каналов при агрегировании от четырех до шести молекулы.

Биосинтез

Предполагается, что биосинтез аламетицина катализируется аламетицин-синтазой, a Нерибосомальный пептид синтаза (NRPS) впервые была выделена в 1975 году.[2] Хотя существует несколько приемлемых последовательностей пептида аламетицина,[3] данные свидетельствуют о том, что все они следуют общему механизму NRPS. [4] с небольшими вариациями в избранных аминокислотах.[5] Начиная с ацилирование терминала N первого аминоизобутиловая кислота на ферменте синтазы ALM путем Ацетил-КоА,[6] за этим следует последовательная конденсация аминокислот каждой модульной единицей синтетазы.[7] Аминокислоты изначально аденилируются по методу «аденилилирование ”(A) перед присоединением тиоэфир связь с Ацильный белок-носитель -подобный пептидиловый белок-носитель.[8] Растущая цепь присоединяется к несущему аминокислоту PCP доменом «конденсации» (C), за которым следует еще один цикл тех же реакций в следующем модуле.[8]

альтернативный текст
Общий механизм синтеза NRPS в аламетицине, показывающий конденсацию аминокислотных субстратов от модуля к модулю. Ac = ацетил Aib = аминоизомасляная кислота. Компоненты модуля: A = аденилилирование PCP = пептидил-несущий белок C = конденсация

Сборка завершается добавлением фенилаланинола, необычного похожего на аминокислоту субстрата.[9] После добавления фенилаланинола завершенная пептидная цепь расщепляется доменом тиоэстеразы, разрывая тиоэфирную связь и оставляя спирт.

альтернативный текст
Схема отдельных модулей и элонгации биосинтеза аламетицина. Для каждого модуля показана растущая пептидная цепь, оканчивающаяся расщеплением тиоэфира и образованием линейного аламетицина. Ac = ацетил Aib = аминоизомасляная кислота Pheol = фенилаланинол. Компоненты модуля: A = аденилилирование PCP = пептидил-несущий белок C = конденсация

Рекомендации

  1. ^ Страница продукта аламетицина из Ферментек
  2. ^ Rindfleisch, H .; Кляйнкауф, Х. (1976-03-01). «Биосинтез аламетицина». Письма FEBS. 62 (3): 276–280. Дои:10.1016/0014-5793(76)80074-9. ISSN  0014-5793. PMID  945191.
  3. ^ Киршбаум, Йохен; Краузе, Корина; Winzheimer, Ruth K .; Брюкнер, Ганс (ноябрь – декабрь 2003 г.). «Последовательности аламетицинов F30 и F50 пересмотрены и согласованы». Журнал пептидной науки. 9 (11–12): 799–809. Дои:10.1002 / psc.535. ISSN  1075-2617. PMID  14658799.
  4. ^ Marahiel, Mohamed A .; Stachelhaus, Торстен; Муц, Хеннинг Д. (1997-11-01). «Модульные пептидные синтетазы, участвующие в синтезе нерибосомальных пептидов». Химические обзоры. 97 (7): 2651–2674. Дои:10.1021 / cr960029e. ISSN  0009-2665. PMID  11851476.
  5. ^ Kleinkauf, H .; Риндфляйш, Х. (1975). «Нерибосомный биосинтез циклического октадекапептида аламетицина». Acta Microbiologica Academiae Scientiarum Hungaricae. 22 (4): 411–418. ISSN  0001-6187. PMID  1241650.
  6. ^ Mohr, H .; Кляйнкауф, Х. (1978-10-12). «Биосинтез аламетицина: ацетилирование амино-конца и присоединение фенилаланинола». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Энзимология. 526 (2): 375–386. Дои:10.1016/0005-2744(78)90129-8. ISSN  0006-3002. PMID  568941.
  7. ^ Вебер, Томас; Марахиэль, Мохамед А. (январь 2001 г.). «Изучение доменной структуры модульных нерибосомальных пептидных синтетаз». Структура. 9 (1): –3 – R9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (00) 00560-8. ISSN  0969-2126. PMID  11342140.
  8. ^ а б Fischbach, Michael A .; Уолш, Кристофер Т. (август 2006 г.). "Сборочная энзимология поликетидных и нерибосомальных пептидных антибиотиков: логика, машины и механизмы". Химические обзоры. 106 (8): 3468–3496. Дои:10.1021 / cr0503097. ISSN  0009-2665. PMID  16895337.
  9. ^ Тернер, С. Ричард; Войт, Бриджит I .; Мурей, Томас Х. (1993-08-01). «Полностью ароматические гиперразветвленные полиэфиры с C-фенилаланинольными и N-ацетатными концевыми группами: синтез и характеристика». Макромолекулы. 26 (17): 4617–4623. Bibcode:1993MaMol..26.4617T. Дои:10.1021 / ma00069a031. ISSN  0024-9297.

дальнейшее чтение

  • Джонс, Л. Р.; Мэддок, ЮЗ; Беш, HR-младший (1980). «Демаскирующий эффект аламетицина на (Na +, K +) - АТФазу, аденилатциклазу, связанную с бета-адренергическим рецептором, и активность цАМФ-зависимых протеинкиназ в сердечных сарколеммальных везикулах». J. Biol. Chem. 255 (20): 9971–9980. PMID  6253461.
  • Исследуйте структуры Аламетицин на банк данных белков
  • Аламетицин в Норине
    • Из «Модель потенциалзависимого ионного канала, полученная на основе кристаллической структуры аламетицина с разрешением 1,5 A». Fox Jr, RO; Ричардс, FM (1982). «Модель потенциалзависимого ионного канала, выведенная из кристаллической структуры аламетицина с разрешением 1,5 A». Природа. 300 (5890): 325–30. Bibcode:1982Натура. 300..325F. Дои:10.1038 / 300325a0. PMID  6292726.
  • Лейтгеб, Балаж; Секереш, Андраш; Манцингер, Ласло; Вагвёльдьи, Чаба; Kredics, Ласло (01.06.2007). "История аламетицина: обзор наиболее широко изученного пептаибола". Химия и биоразнообразие. 4 (6): 1027–1051. Дои:10.1002 / cbdv.200790095. ISSN  1612-1880. PMID  17589875.