ATG4A - ATG4A

ATG4A
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2П82
Идентификаторы
Псевдонимы	ATG4A, APG4A, AUTL2, 4А цистеинпептидаза, связанная с аутофагией
Внешние идентификаторы	OMIM: 300663 MGI: 2147903 ГомолоГен: 70873 Генные карты: ATG4A
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq22.3 Начинать 108,091,668 бп[1] Конец 108,154,671 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа Х | Х F1 Начинать 140,956,907 бп[2] Конец 141,164,270 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • пептидазная активность • активность пептидазы цистеинового типа • GO: 0001948 связывание с белками • гидролазная активность • активность эндопептидазы цистеинового типа Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • аутофагия • транспорт белка • аутофагия ядра • Липидирование C-концевого белка • делипидация белков • аутофагия митохондрии • сборка аутофагосом • протеолиз • нацеливание белка на мембрану Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	115201	666468
Ансамбль	ENSG00000101844	ENSMUSG00000079418
UniProt	Q8WYN0	Q8C9S8
RefSeq (мРНК)	NM_052936 NM_178270 NM_178271 NM_001321287 NM_001321288 NM_001321289 NM_001321290	NM_174875
RefSeq (белок)	NP_001308216 NP_001308217 NP_001308218 NP_001308219 NP_443168 NP_840054 NP_840055	NP_777364 NP_001366610 NP_001366611 NP_001366612 NP_001366613
Расположение (UCSC)	Chr X: 108.09 - 108.15 Мб	Chr X: 140.96 - 141.16 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цистеиновая протеаза ATG4A является фермент что у людей кодируется ATG4A ген.^[5][6]

Аутофагия - это процесс, посредством которого эндогенный белки и поврежденные органеллы уничтожены внутриклеточно. Аутофагия постулируется, что он необходим для клетки гомеостаз и ремоделирование клеток во время дифференциация, метаморфоза, не-апоптотический смерть клетки, и старение. Снижение уровня аутофагии было описано в некоторых злокачественные опухоли, и была предложена роль аутофагии в контроле нерегулируемого роста клеток, связанного с раком. Этот ген кодирует член аутофагин семейство белков. Кодируемый белок также обозначен как член семейства С-54 цистеин протеазы. Варианты транскрипции, которые кодируют разные изоформы были идентифицированы.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101844 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079418 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Scherz-Shouval R, Sagiv Y, Shorer H, Elazar Z (апрель 2003 г.). «COOH-конец GATE-16, модулятора транспорта внутри Гольджи, расщепляется цистеиновой протеазой человека HsApg4A». J Biol Chem. 278 (16): 14053–8. Дои:10.1074 / jbc.M212108200. PMID  12473658.
6. «Ген Entrez: ATG4A, связанный с аутофагией ATG4, 4 гомолог A (S. cerevisiae)».

внешняя ссылка

• Человек ATG4A расположение генома и ATG4A страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Scherz-Shouval R, Shvets E, Fass E, et al. (2007). «Реактивные формы кислорода необходимы для аутофагии и специфически регулируют активность Atg4». EMBO J. 26 (7): 1749–60. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601623. ЧВК  1847657. PMID  17347651.
• Росс М.Т., Графхэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека». Природа. 434 (7031): 325–37. Дои:10.1038 / природа03440. ЧВК  2665286. PMID  15772651.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Кабея Ю., Мидзусима Н., Ямамото А. и др. (2005). «LC3, GABARAP и GATE16 локализуются на мембране аутофагосомы в зависимости от образования формы II». J. Cell Sci. 117 (Pt 13): 2805–12. Дои:10.1242 / jcs.01131. PMID  15169837.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.