ARHGEF3 - ARHGEF3

ARHGEF3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2Z0Q
Идентификаторы
Псевдонимы	ARHGEF3, GEF3, STA3, XPLN, фактор обмена нуклеотида гуанина 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 612115 MGI: 1918954 ГомолоГен: 41329 Генные карты: ARHGEF3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п14.3 Начинать 56,727,418 бп[1] Конец 57,079,329 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 A3 | 14 16,09 см Начинать 27,114,899 бп[2] Конец 27,403,911 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Rho • GO: 0001948 связывание с белками • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • внутриклеточный Биологический процесс • регуляция передачи сигнала белка Rho • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase • Передача сигнала белка Rho • положительная регуляция апоптотического процесса • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	50650	71704
Ансамбль	ENSG00000163947	ENSMUSG00000021895
UniProt	Q9NR81	Q91X46
RefSeq (мРНК)	NM_001128615 NM_001128616 NM_001289698 NM_019555 NM_001377407 NM_001377408 NM_001377409 NM_001377410 NM_001377411 NM_001377412 NM_001377413 NM_001377414 NM_001377415	NM_001289686 NM_001289687 NM_001289688 NM_027871
RefSeq (белок)	NP_001122087 NP_001122088 NP_001276627 NP_062455 NP_001364336 NP_001364337 NP_001364338 NP_001364339 NP_001364340 NP_001364341 NP_001364342 NP_001364343 NP_001364344	NP_001276615 NP_001276616 NP_001276617 NP_082147
Расположение (UCSC)	Chr 3: 56.73 - 57.08 Мб	Chr 14: 27.11 - 27,4 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор обмена нуклеотидов гуанина (GEF) 3, также известный как ARHGEF3, это человек ген.^[5]

Функция

Rho GTPases играют фундаментальную роль во многих клеточных процессах, которые инициируются внеклеточными стимулами, которые работают через рецепторы, связанные с G-белком. Кодируемый белок может образовывать комплекс с G-белками и стимулировать Rho-зависимые сигналы. Этот белок похож на белок NET1A.^[5]

Взаимодействия

ARHGEF3 было показано взаимодействовать с RHOA^[6] и RHOB.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163947 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021895 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: ARHGEF3 фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) 3».
6. Артур В.Т., Эллербрук С.М., Дер С.Дж., Берридж К., Веннерберг К. (ноябрь 2002 г.). «XPLN, фактор обмена гуаниновых нуклеотидов для RhoA и RhoB, но не для RhoC». J. Biol. Chem. 277 (45): 42964–72. Дои:10.1074 / jbc.M207401200. PMID  12221096.

внешняя ссылка

• Человек ARHGEF3 расположение генома и ARHGEF3 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Тизен С., Кюбарт С., Роперс Х. Х., Нотванг Х. Г. (2000). «Выделение двух новых человеческих RhoGEF, ARHGEF3 и ARHGEF4, в 3p13-21 и 2q22». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 273 (1): 364–9. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2925. PMID  10873612.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Артур В.Т., Эллербрук С.М., Дер С.Дж., Берридж К., Веннерберг К. (2003). «XPLN, фактор обмена гуаниновых нуклеотидов для RhoA и RhoB, но не для RhoC». J. Biol. Chem. 277 (45): 42964–72. Дои:10.1074 / jbc.M207401200. PMID  12221096.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.