ARHGAP11B - ARHGAP11B

ARHGAP11B
Идентификаторы
ПсевдонимыARHGAP11B, B'-T, FAM7B1, Rho GTPase, активирующий белок 11B, GAP (1-8), ArhGAP11B и человеческая энцефализация
Внешние идентификаторыOMIM: 616310 Генные карты: ARHGAP11B
Расположение гена (человек)
Хромосома 15 (человек)
Chr.Хромосома 15 (человек)[1]
Хромосома 15 (человек)
Геномное расположение ARHGAP11B
Геномное расположение ARHGAP11B
Группа15q13.2Начинать30,624,548 бп[1]
Конец30,685,606 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001039841

н / д

RefSeq (белок)

NP_001034930

н / д

Расположение (UCSC)Chr 15: 30.62 - 30.69 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

ARHGAP11B является специфическим для человека геном, который появился после расхождения с шимпанзе. Он усиливается базальные предшественники, контролирует пролиферацию нейральных предшественников и может вызывать неокортекс складной. Он способен вызывать сворачивание неокортекса у мышей. Это, вероятно, отражает роль ARHGAP11B в развитии и эволюционном расширении неокортекса человека, вывод согласуется с выводом о том, что дупликация гена, создавшая ARHGAP11B, произошла в человеческой линии после расхождения от линии шимпанзе, но до расхождения с неандертальцами.[3]

Структура

ARHGAP11B кодирует 267 аминокислот и представляет собой усеченную копию ARHGAP11A. ARHGAP11B возник в эволюционной линии человека после расхождения от линии шимпанзе путем частичной дупликации ARHGAP11A, который встречается во всем животном мире и кодирует белок, активирующий ГТФазу Rho (RhoGAP домен ). ARHGAP11B существует не только у современного человека, но также у неандертальцев и денисовцев. ARHGAP11B включает большую часть GAP-домена (до лизина-220), за которым следует новая C-концевая последовательность, но не содержит C-концевых 756 аминокислот ARHGAP11A.

Мероприятия

В отличие от полноразмерных ARHGAP11A и ARHGAP11A 1-250, ARHGAP11B, как и ARHGAP11A1-220, не проявлял активности RhoGAP в клетках на основе RhoA / Rho-киназы. трансфекция проба. Это указывает на то, что 47 C-концевых аминокислот ARHGAP11B (после лизина-220) составляют не только уникальную последовательность, являющуюся результатом делеции со сдвигом рамки считывания, но также функционально отличаются от своего аналога в ARHGAP11A. В этом анализе совместная экспрессия ARHGAP11B вместе с ARHGAP11A не подавляла активность последнего RhoGAP.[3]

Функция

Поскольку несколько генов, участвующих в умственная отсталость кодировать белки с RhoGAP домены или другие белки в сигнальном пути Rho, то не удивительно, что ARHGAP11B участвует в сворачивании неокортекса; однако его точная функция до сих пор неизвестна. Сообщается [4] что он расположен в митохондрии где он привязан к транслокатор адениновых нуклеотидов; он не влияет на активность транслокатора по обмену адениновых нуклеотидов, но приводит к замедленному открытию митохондриальная проницаемость переходная пора, что позволяет лучше связывать кальций. Кроме того, присутствие ARHGAP11B в митохондриях повышает глутаминолиз, что, скорее всего, связано со способностью митохондрий связывать больше кальция, который активирует митохондриальный матрикс дегидрогеназы в цикл лимонной кислоты, особенно оксоглутаратдегидрогеназный комплекс.

Рекомендации

  1. ^ а б c ENSG00000286139, ENSG00000284906 GRCh38: Ensembl версии 89: ENSG00000274734, ENSG00000286139, ENSG00000284906 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ а б Флорио М., Альберт М., Таверна Е., Намба Т., Брандл Н., Левитус Е. и др. (Март 2015 г.). «Специфический для человека ген ARHGAP11B способствует усилению базальных предшественников и расширению неокортекса». Наука. Нью-Йорк, штат Нью-Йорк. 347 (6229): 1465–70. Дои:10.1126 / science.aaa1975. PMID  25721503.
  4. ^ Намба Т., Доци Дж., Пинсон А., Син Л., Калебич Н., Вильш-Бройнингер М., Лонг К. Р., Вайд С., Лауэр Дж., Богданова А., Боргоново Б., Шевченко А., Келлер П., Дрехсель Д., Курцхалия Т., Вимбергер П., Чинопулос К., Хаттнер ВБ (март 2020 г.). "Человеческий специфический ARHGAP11B действует в митохондриях, увеличивая неокортикальные предшественники путем глутаминолиза". Нейрон. 105 (5): 867–881.e9. Дои:10.1016 / j.neuron.2019.11.027. PMID  31883789.

дальнейшее чтение