APIP - APIP

APIP
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4М6Р
Идентификаторы
Псевдонимы	APIP, APIP2, CGI29, MMRP19, hCGI-29, взаимодействующий белок APAF1
Внешние идентификаторы	OMIM: 612491 MGI: 1926788 ГомолоГен: 6277 Генные карты: APIP
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11p13 Начинать 34,853,094 бп[1] Конец 34,916,379 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 E2 Начинать 103,073,675 бп[2] Конец 103,092,644 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • лиазная активность • идентичное связывание с белками • активность метилтиорибулозо-1-фосфатдегидратазы • связывание ионов цинка Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • процесс биосинтеза метионина • отрицательная регуляция апоптотического процесса • клеточный процесс биосинтеза аминокислот • регуляция каскада ERK1 и ERK2 • апоптотический процесс • пироптоз • гомотетрамеризация белков • Спасение L-метионина из метилтиоаденозина • Восстановление L-метионина из S-аденозилметионина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51074	56369
Ансамбль	ENSG00000149089	ENSMUSG00000010911
UniProt	Q96GX9	Q9WVQ5
RefSeq (мРНК)	NM_015957	NM_019735 NM_001355473 NM_001355474
RefSeq (белок)	NP_057041	NP_062709 NP_001342402 NP_001342403
Расположение (UCSC)	Chr 11: 34,85 - 34,92 Мб	Chr 2: 103.07 - 103.09 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

APAF1-взаимодействующий белок это белок что у людей кодируется APIP ген.^[5][6][7] Это фермент с Метилтиорибулоза 1-фосфатдегидратаза Мероприятия^[8][9] который участвует в метионин путь спасения.

Дефицит APIP связан с смерть клетки^[10] и рак.

Взаимодействия

APIP был показан взаимодействовать с APAF1.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000149089 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000010911 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лай Ч., Чжоу Ц.Й., Чан ЛЙ, Лю Ц.С., Лин В. (август 2000 г.). «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК  310876. PMID  10810093.
6. Cho DH, Hong YM, Lee HJ, Woo HN, Pyo JO, Mak TW, Jung YK (сентябрь 2004 г.). «Индуцированное ингибирование ишемического / гипоксического повреждения с помощью APIP, нового белка, взаимодействующего с Apaf-1». J Biol Chem. 279 (38): 39942–50. Дои:10.1074 / jbc.M405747200. PMID  15262985.
7. «Ген Entrez: белок, взаимодействующий с APIP и APAF1».
8. Мэри К., Дуэк П., Саллерон Л., Тиенц П., Буманн Д., Байрох А., Лейн Л. (2012). Ди Кунто Ф (ред.). «Функциональная идентификация APIP как человеческого mtnB, ключевого фермента в пути спасения метионина». PLOS ONE. 7 (12): e52877. Дои:10.1371 / journal.pone.0052877. ЧВК  3532061. PMID  23285211.
9. Канг, Вт; Hong, S.H .; Lee, H.M .; Kim, N. Y .; Lim, Y.C .; Ле Ле, Т. М .; Lim, B; Kim, H.C .; Kim, T. Y .; Ашида, Н; Йокота, А; Ха, С. С .; Chun, K. H .; Юнг, Ю.К .; Ян, Дж. К. (2014). «Структурная и биохимическая основа ингибирования гибели клеток APIP, ферментом спасения метионина». Труды Национальной академии наук. 111 (1): E54-61. Дои:10.1073 / pnas.1308768111. ЧВК  3890807. PMID  24367089.
10. Ко Д.К., Гамазон Э.Р., Шукла К.П., Пфуэцнер Р.А., Уиттингтон Д., Холден Т.Д., Бриттнахер М.Дж., Фонг С., Радей М., Огохара С., Старк А.Л., Эйки Дж.М., Долан М.Э., Вурфель М.М., Миллер С.И. «Функциональный генетический скрининг человеческого разнообразия показывает, что фермент спасения метионина регулирует гибель воспалительных клеток». Труды Национальной академии наук. 109 (35): E2343 – E2352. Дои:10.1073 / pnas.1206701109. ЧВК  3435171. PMID  22837397.

внешняя ссылка

• Человек APIP расположение генома и APIP страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Штейн М.А., Бауэр А., Касари Дж., Дрюс Дж., Гэвин А.С., Джексон Д. Б., Джоберти Дж., Нойбауэр Дж., Рик Дж., Кустер Б., Суперти-Фурга Г. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. Дои:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216. S2CID  11683986.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.