МРНК ACAT1 - ACAT1 mRNA
| МРНК ACAT1 | |
|---|---|
 Сохранено вторичная структура мРНК ACAT1 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | ACAT1 |
| Рфам | RF01495 |
| Прочие данные | |
| ИДТИ | 0006446 |
| ТАК | 0005836 |
| PDB структуры | PDBe |
Ацетил-КоА холестерина ацилтрансфераза человека (ACAT1 ) ген производит химерный мРНК через межхромосомную обработку двух прерывистых РНК записано с хромосомы 1 и 7.[1] Этот химерный мРНК использует AUG как кодон инициации трансляции производить нормальные 50-кДа Белок ACAT1, но с использованием альтернативного кодона инициации трансляции, GGC, для получения нового ферментативно активная изоформа 56 кДа.
Мутагенез и масс-спектрометрии идентифицировали альтернативный кодон инициации как стартовый кодон для нового 56-кДа белка, и его расположение было картировано в области, расположенной выше кодона инициации AUG. Три стержень петля Предполагается, что структуры окружают инициирующий кодон GCC и известны как SL1-SL3. Мутации, нарушившие эти стебель-петля Структуры показали, что SL1 и SL2 необходимы для инициации трансляции с кодона GGC, но SL3 не влияет на эффективность трансляции. Было показано, что инициация трансляции с кодона GGC опосредуется внутренний сайт входа рибосомы (IRES), для которого требуется, чтобы SL1 располагался выше IRES, а SL2 - ниже по потоку.[2] Это исследование также показало, что SL3 влияет на выбор нижестоящих кодонов инициации трансляции AUG, которые будут продуцировать нормальный человеческий белок ACAT1 массой 50 кДа.[3]
Рекомендации
- ^ Yang L, Lee O, Chen J, Chen J, Chang CC, Zhou P, Wang ZZ, Ma HH, Sha HF, Feng JX, Wang Y, Yang XY, Wang L, Dong R, Ornvold K, Li BL, Chang TY (Октябрь 2004 г.). «Человеческий ацил-кофермент А: последовательности холестерин-ацилтрансферазы 1 (acat1), расположенные в двух разных хромосомах (7 и 1), необходимы для получения нового изофермента ACAT1 с дополнительной последовательностью на N-конце» (Бесплатный полный текст). Журнал биологической химии. 279 (44): 46253–62. Дои:10.1074 / jbc.M408155200. PMID 15319423.
- ^ Chen J, Zhao XN, Yang L, Hu GJ, Lu M, Xiong Y, Yang XY, Chang CC, Song BL, Chang TY, Li BL (сентябрь 2008 г.). «Вторичные структуры РНК, расположенные в межхромосомной области химерной мРНК ACAT1 человека, необходимы для производства изоформы 56 кДа». Клеточные исследования. 18 (9): 921–36. Дои:10.1038 / кр.2008.66. ЧВК 3086790. PMID 18542101.
- ^ Ян Л., Чен Дж, Чанг СС, Ян XY, Ван ЗЗ, Чанг Т.Й., Ли Б.Л. (апрель 2004 г.). «Стабильная вышележащая структура« стебель-петля »увеличивает выбор первой 5'-ORF-AUG в качестве основного стартового кодона для инициации трансляции мРНК человеческого ACAT1». Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 36 (4): 259–68. Дои:10.1093 / abbs / 36.4.259. PMID 15253151. Архивировано из оригинал (Бесплатный полный текст) на 03.03.2016.